RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466048.6

USP54-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 54, humanhuman

TSL 5

Gene USP54, Length 4,674 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP54-210ENST00000466048 MYOTQ9UBF9 498 aa6.9□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 ICAM5Q9UMF0 924 aa6.9□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa6.9□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 A0A087WUJ7 227 aa6.89□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 SCO1O75880 301 aa6.89□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 OR2C1O95371 312 aa6.89□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 TACR3P29371 465 aa6.89□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 TAS2R46P59540 309 aa6.89□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 RPS25P62851 125 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 SLC36A2Q495M3 483 aa6.89□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 SLC35D3Q5M8T2 416 aa6.89□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 OR5M8Q8NGP6 311 aa6.89□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 OR51A7Q8NH64 312 aa6.89□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 PHYHIPLQ96FC7 376 aa6.89□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 OR5M11Q96RB7 305 aa6.89□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 HCAR1Q9BXC0 346 aa6.89□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa6.89□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 PLSCR3Q9NRY6 295 aa6.89□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 CHRNA9Q9UGM1 479 aa6.89□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 PROCRQ9UNN8 238 aa6.89□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 NTNG1Q9Y2I2 539 aa6.89□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 ZNF281Q9Y2X9 895 aa6.89□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 JTBO76095 146 aa6.89□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 IL5P05113 134 aa6.89□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 CPEP16870 476 aa6.89□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 GALP22466 123 aa6.89□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 CSF2RBP32927 897 aa6.89□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 RFX2P48378 723 aa6.89□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 MFAP5Q13361 173 aa6.89□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 KLHDC1Q8N7A1 406 aa6.89□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa6.89□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 C2CD4CQ8TF44 421 aa6.89□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 GLYATL2Q8WU03 294 aa6.89□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 APH1AQ96BI3 265 aa6.89□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 RNF170Q96K19 258 aa6.89□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 FBXO34Q9NWN3 711 aa6.89□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 ANKUB1A6NFN9 424 aa6.89□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 ZNF850A8MQ14 1090 aa6.89□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 ACTL6AO96019 429 aa6.89□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 SRD5A2P31213 254 aa6.89□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 ACSM1Q08AH1 577 aa6.89□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 OR13C2Q8NGS9 318 aa6.89□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 PPP1R35Q8TAP8 253 aa6.89□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 RHNO1Q9BSD3 238 aa6.89□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 C1orf123Q9NWV4 160 aa6.89□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 KCNE5Q9UJ90 142 aa6.89□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 SIGLEC7Q9Y286 467 aa6.89□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 GPR52Q9Y2T5 361 aa6.89□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 AKR7A2O43488 359 aa6.89□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 F2RL1P55085 397 aa6.89□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 EFNB1P98172 346 aa6.89□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 TPBGQ13641 420 aa6.89□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 EMC4Q5J8M3 183 aa6.89□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 TMEM244Q5VVB8 128 aa6.89□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 CLEC9AQ6UXN8 241 aa6.89□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 LILRB2Q8N423 598 aa6.89□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 FAM71CQ8NEG0 241 aa6.89□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 OR52E2Q8NGJ4 325 aa6.89□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 OR8D4Q8NGM9 314 aa6.89□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 OR13C3Q8NGS6 347 aa6.89□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 PFN4Q8NHR9 129 aa6.89□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 ZNF721Q8TF20 911 aa6.89□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 OPALINQ96PE5 141 aa6.89□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 NUDT9Q9BW91 350 aa6.89□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 BCO1Q9HAY6 547 aa6.89□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 ASH2LQ9UBL3 628 aa6.89□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 A0A0A6YYJ9 748 aa6.88□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 A0A0B4J2A0 478 aa6.88□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 PPP5D1E7EU14 171 aa6.88□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 LYPD3O95274 346 aa6.88□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 IGKV1D-16P01601 117 aa6.88□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 CTSBP07858 339 aa6.88□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 APEHP13798 732 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 LAP3P28838 519 aa6.88□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 TNK1Q13470 666 aa6.88□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 RAB31Q13636 194 aa6.88□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 STEAP1BQ6NZ63 245 aa6.88□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 CMTM3Q96MX0 182 aa6.88□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 GPA33Q99795 319 aa6.88□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 ZNF426Q9BUY5 554 aa6.88□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 C1orf198Q9H425 327 aa6.88□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 TAS2R16Q9NYV7 291 aa6.88□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 SHPKQ9UHJ6 478 aa6.88□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 MOKQ9UQ07 419 aa6.88□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 TGFBR3LH3BV60 316 aa6.88□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.3 ms