RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463533.1

ANKRD28-208, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 3

Gene ANKRD28, Length 742 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-208ENST00000463533 PTTG3PQ9NZH4 202 aa7.24□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 CLEC2DQ9UHP7 191 aa7.24□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 GNG8Q9UK08 70 aa7.24□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 FZR1Q9UM11 496 aa7.24□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 TPRKBQ9Y3C4 175 aa7.24□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 SPEF1Q9Y4P9 236 aa7.24□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa7.23□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 HS3ST1O14792 307 aa7.23□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 TBX1O43435 398 aa7.23□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF254O75437 659 aa7.23□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 PNPP00491 289 aa7.23□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 CDK1P06493 297 aa7.23□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 CCDC159P0C7I6 412 aa7.23□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 CRHBPP24387 322 aa7.23□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 DCKP27707 260 aa7.23□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 PCSK6P29122 969 aa7.23□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 SSTR2P30874 369 aa7.23□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 PSMB10P40306 273 aa7.23□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 RAD52P43351 418 aa7.23□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 FABP6P51161 128 aa7.23□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 PPP1CBP62140 327 aa7.23□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 NKPD1Q17RQ9 610 aa7.23□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 SNAI3Q3KNW1 292 aa7.23□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 CDONQ4KMG0 1287 aa7.23□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 OR2G6Q5TZ20 316 aa7.23□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 DRAM2Q6UX65 266 aa7.23□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 COLCA1Q6ZS62 124 aa7.23□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 RHOUQ7L0Q8 258 aa7.23□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 PRSS45Q7RTY3 260 aa7.23□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 NUP37Q8NFH4 326 aa7.23□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 SLC25A40Q8TBP6 338 aa7.23□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 NRGNQ92686 78 aa7.23□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 MYDGFQ969H8 173 aa7.23□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 PGAM5Q96HS1 289 aa7.23□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 C4orf36Q96KX1 117 aa7.23□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 DOK1Q99704 481 aa7.23□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 DHRS9Q9BPW9 319 aa7.23□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 RSRP1Q9BUV0 290 aa7.23□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 JAM3Q9BX67 310 aa7.23□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa7.23□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa7.23□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 INPP5EQ9NRR6 644 aa7.23□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 CA10Q9NS85 328 aa7.23□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 TBCCD1Q9NVR7 557 aa7.23□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF319Q9P2F9 582 aa7.23□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa7.23□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa7.22□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 E9PI62 339 aa7.22□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 RGS10O43665 173 aa7.22□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 SULT1C4O75897 302 aa7.22□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 CLPTM1O96005 669 aa7.22□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 APOC1P02654 83 aa7.22□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 MT-ND2P03891 347 aa7.22□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 TACSTD2P09758 323 aa7.22□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 OR4A8P0C604 315 aa7.22□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 MYL12AP19105 171 aa7.22□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 GLRXP35754 106 aa7.22□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 MPV17P39210 176 aa7.22□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 RGS6P49758 472 aa7.22□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 SLC35A2P78381 396 aa7.22□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 ADIPOQQ15848 244 aa7.22□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 GLYATL3Q5SZD4 288 aa7.22□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 LIPNQ5VXI9 398 aa7.22□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 FAM220AQ7Z4H9 259 aa7.22□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 LRP11Q86VZ4 500 aa7.22□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 KLHL36Q8N4N3 616 aa7.22□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 OR2AE1Q8NHA4 323 aa7.22□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 TMEM171Q8WVE6 324 aa7.22□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 GATAD2BQ8WXI9 593 aa7.22□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 FBXW5Q969U6 566 aa7.22□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 CMBLQ96DG6 245 aa7.22□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 PELI1Q96FA3 418 aa7.22□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 SYT3Q9BQG1 590 aa7.22□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 BCL2L14Q9BZR8 327 aa7.22□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 OR2J1Q9GZK6 312 aa7.22□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 CCDC90BQ9GZT6 254 aa7.22□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 LIME1Q9H400 295 aa7.22□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 DUSP21Q9H596 190 aa7.22□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 NIPAL2Q9H841 368 aa7.22□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 ACOXLQ9NUZ1 547 aa7.22□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 FAM206AQ9NX38 181 aa7.22□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 ADAM30Q9UKF2 790 aa7.22□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.4 ms