RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462494.5

ACTB-207, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 2,245 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-207ENST00000462494 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
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ACTB-207ENST00000462494 ZNF43P17038 809 aa15.01□□□□□ -0.01
ACTB-207ENST00000462494 CALCRP30988 508 aa15.01□□□□□ -0.01
ACTB-207ENST00000462494 CXCL12P48061 93 aa15.01□□□□□ -0.01
ACTB-207ENST00000462494 P2RY4P51582 365 aa15.01□□□□□ -0.01
ACTB-207ENST00000462494 FGL1Q08830 312 aa15.01□□□□□ -0.01
ACTB-207ENST00000462494 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
ACTB-207ENST00000462494 DMRTC1Q5HYR2 192 aa15.01□□□□□ -0.01
ACTB-207ENST00000462494 TMEM81Q6P7N7 255 aa15.01□□□□□ -0.01
ACTB-207ENST00000462494 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa15.01□□□□□ -0.01
ACTB-207ENST00000462494 SLC25A42Q86VD7 318 aa15.01□□□□□ -0.01
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ACTB-207ENST00000462494 OR2M3Q8NG83 312 aa15.01□□□□□ -0.01
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ACTB-207ENST00000462494 CASTOR1Q8WTX7 329 aa15.01□□□□□ -0.01
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ACTB-207ENST00000462494 AKR1C4P17516 323 aa15□□□□□ -0.01
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ACTB-207ENST00000462494 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
ACTB-207ENST00000462494 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa15□□□□□ -0.01
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ACTB-207ENST00000462494 MPIG6BO95866 241 aa15□□□□□ -0.01
ACTB-207ENST00000462494 ZBTB25P24278 435 aa15□□□□□ -0.01
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ACTB-207ENST00000462494 PPP1R3BQ86XI6 285 aa15□□□□□ -0.01
ACTB-207ENST00000462494 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
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ACTB-207ENST00000462494 OR1S1Q8NH92 325 aa15□□□□□ -0.01
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ACTB-207ENST00000462494 TMEM41AQ96HV5 264 aa15□□□□□ -0.01
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ACTB-207ENST00000462494 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
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ACTB-207ENST00000462494 TUSC1Q2TAM9 212 aa14.99□□□□□ -0.01
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ACTB-207ENST00000462494 K7ESF4 209 aa14.98□□□□□ -0.01
ACTB-207ENST00000462494 SULT2B1O00204 365 aa14.98□□□□□ -0.01
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ACTB-207ENST00000462494 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
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ACTB-207ENST00000462494 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
ACTB-207ENST00000462494 C11orf87Q6NUJ2 197 aa14.98□□□□□ -0.01
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ACTB-207ENST00000462494 OR6X1Q8NH79 312 aa14.98□□□□□ -0.01
ACTB-207ENST00000462494 ST8SIA2Q92186 375 aa14.98□□□□□ -0.01
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ACTB-207ENST00000462494 GPER1Q99527 375 aa14.98□□□□□ -0.01
ACTB-207ENST00000462494 PHB2Q99623 299 aa14.98□□□□□ -0.01
ACTB-207ENST00000462494 DUSP23Q9BVJ7 150 aa14.98□□□□□ -0.01
ACTB-207ENST00000462494 MOB1AQ9H8S9 216 aa14.98□□□□□ -0.01
ACTB-207ENST00000462494 A0A0D9SG52 128 aa14.98□□□□□ -0.01
ACTB-207ENST00000462494 SCGNO76038 276 aa14.98□□□□□ -0.01
ACTB-207ENST00000462494 MGMTP16455 207 aa14.98□□□□□ -0.01
ACTB-207ENST00000462494 CASRP41180 1078 aa14.98□□□□□ -0.01
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