RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449757.5

DDX39B-211, Transcript of DExD-box helicase 39B, humanhuman

TSL 3

Gene DDX39B, Length 591 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39B-211ENST00000449757 DNAJB11Q9UBS4 358 aa8.52□□□□□ -1.05
DDX39B-211ENST00000449757 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
DDX39B-211ENST00000449757 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa8.51□□□□□ -1.05
DDX39B-211ENST00000449757 LOC100653049A0A140TA62 436 aa8.51□□□□□ -1.05
DDX39B-211ENST00000449757 A0A1W2PRD5 423 aa8.51□□□□□ -1.05
DDX39B-211ENST00000449757 A0A1W2PRF3 423 aa8.51□□□□□ -1.05
DDX39B-211ENST00000449757 A0A1W2PRM7 423 aa8.51□□□□□ -1.05
DDX39B-211ENST00000449757 ANKRD61A6NGH8 418 aa8.51□□□□□ -1.05
DDX39B-211ENST00000449757 UNC119BA6NIH7 251 aa8.51□□□□□ -1.05
DDX39B-211ENST00000449757 CXCR6O00574 342 aa8.51□□□□□ -1.05
DDX39B-211ENST00000449757 EDF1O60869 148 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
DDX39B-211ENST00000449757 KRT34O76011 436 aa8.51□□□□□ -1.05
DDX39B-211ENST00000449757 ALX3O95076 343 aa8.51□□□□□ -1.05
DDX39B-211ENST00000449757 PPP1R3DO95685 299 aa8.51□□□□□ -1.05
DDX39B-211ENST00000449757 RENP00797 406 aa8.51□□□□□ -1.05
DDX39B-211ENST00000449757 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
DDX39B-211ENST00000449757 GRPP07492 148 aa8.51□□□□□ -1.05
DDX39B-211ENST00000449757 ACSM4P0C7M7 580 aa8.51□□□□□ -1.05
DDX39B-211ENST00000449757 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP8.51□□□□□ -1.05
DDX39B-211ENST00000449757 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
DDX39B-211ENST00000449757 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
DDX39B-211ENST00000449757 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
DDX39B-211ENST00000449757 POU4F2Q12837 409 aa8.51□□□□□ -1.05
DDX39B-211ENST00000449757 COX10Q12887 443 aa8.51□□□□□ -1.05
DDX39B-211ENST00000449757 KCNMB1Q16558 191 aa8.51□□□□□ -1.05
DDX39B-211ENST00000449757 COQ5Q5HYK3 327 aa8.51□□□□□ -1.05
DDX39B-211ENST00000449757 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa8.51□□□□□ -1.05
DDX39B-211ENST00000449757 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa8.51□□□□□ -1.05
DDX39B-211ENST00000449757 FAM162AQ96A26 154 aa8.51□□□□□ -1.05
DDX39B-211ENST00000449757 FN3KQ9H479 309 aa8.51□□□□□ -1.05
DDX39B-211ENST00000449757 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
DDX39B-211ENST00000449757 NRIP3Q9NQ35 241 aa8.51□□□□□ -1.05
DDX39B-211ENST00000449757 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
DDX39B-211ENST00000449757 SIRT7Q9NRC8 400 aa8.51□□□□□ -1.05
DDX39B-211ENST00000449757 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
DDX39B-211ENST00000449757 SIGLEC7Q9Y286 467 aa8.51□□□□□ -1.05
DDX39B-211ENST00000449757 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
DDX39B-211ENST00000449757 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa8.51□□□□□ -1.05
DDX39B-211ENST00000449757 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
DDX39B-211ENST00000449757 G3V4G9 280 aa8.5□□□□□ -1.05
DDX39B-211ENST00000449757 M0R135 149 aa8.5□□□□□ -1.05
DDX39B-211ENST00000449757 DCTN6O00399 190 aa8.5□□□□□ -1.05
DDX39B-211ENST00000449757 DVL1O14640 695 aa8.5□□□□□ -1.05
DDX39B-211ENST00000449757 PIN1P1O15428 100 aa8.5□□□□□ -1.05
DDX39B-211ENST00000449757 PAHP00439 452 aa8.5□□□□□ -1.05
DDX39B-211ENST00000449757 SERPINA1P01009 418 aa8.5□□□□□ -1.05
DDX39B-211ENST00000449757 NPPAP01160 153 aa8.5□□□□□ -1.05
DDX39B-211ENST00000449757 H1F0P07305 194 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
DDX39B-211ENST00000449757 FBP1P09467 338 aa8.5□□□□□ -1.05
DDX39B-211ENST00000449757 MDH1P40925 334 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
DDX39B-211ENST00000449757 TPTEP56180 551 aa8.5□□□□□ -1.05
DDX39B-211ENST00000449757 HIST1H3AP68431 136 aa8.5□□□□□ -1.05
DDX39B-211ENST00000449757 ECH1Q13011 328 aa8.5□□□□□ -1.05
DDX39B-211ENST00000449757 KLF10Q13118 480 aa8.5□□□□□ -1.05
DDX39B-211ENST00000449757 SLC36A3Q495N2 470 aa8.5□□□□□ -1.05
DDX39B-211ENST00000449757 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa8.5□□□□□ -1.05
DDX39B-211ENST00000449757 METTL21CQ5VZV1 264 aa8.5□□□□□ -1.05
DDX39B-211ENST00000449757 SLC18B1Q6NT16 456 aa8.5□□□□□ -1.05
DDX39B-211ENST00000449757 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa8.5□□□□□ -1.05
DDX39B-211ENST00000449757 ZNF826PQ6ZT77 177 aa8.5□□□□□ -1.05
DDX39B-211ENST00000449757 HIST2H3AQ71DI3 136 aa8.5□□□□□ -1.05
DDX39B-211ENST00000449757 NAA40Q86UY6 237 aa8.5□□□□□ -1.05
DDX39B-211ENST00000449757 FAM90A1Q86YD7 464 aa8.5□□□□□ -1.05
DDX39B-211ENST00000449757 OR2AE1Q8NHA4 323 aa8.5□□□□□ -1.05
DDX39B-211ENST00000449757 SLC7A13Q8TCU3 470 aa8.5□□□□□ -1.05
DDX39B-211ENST00000449757 RCN3Q96D15 328 aa8.5□□□□□ -1.05
DDX39B-211ENST00000449757 ZNF799Q96GE5 643 aa8.5□□□□□ -1.05
DDX39B-211ENST00000449757 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
DDX39B-211ENST00000449757 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
DDX39B-211ENST00000449757 SLC22A4Q9H015 551 aa8.5□□□□□ -1.05
DDX39B-211ENST00000449757 VPREB3Q9UKI3 123 aa8.5□□□□□ -1.05
DDX39B-211ENST00000449757 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
DDX39B-211ENST00000449757 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa8.49□□□□□ -1.05
DDX39B-211ENST00000449757 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa8.49□□□□□ -1.05
DDX39B-211ENST00000449757 A0A1B0GVI7 797 aa8.49□□□□□ -1.05
DDX39B-211ENST00000449757 A0A1B0GW55 424 aa8.49□□□□□ -1.05
DDX39B-211ENST00000449757 A0A1B0GWJ7 208 aa8.49□□□□□ -1.05
DDX39B-211ENST00000449757 CD300LBA8K4G0 201 aa8.49□□□□□ -1.05
DDX39B-211ENST00000449757 NDUFA2O43678 99 aa8.49□□□□□ -1.05
DDX39B-211ENST00000449757 GMDSO60547 372 aa8.49□□□□□ -1.05
DDX39B-211ENST00000449757 ECDO95905 644 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
DDX39B-211ENST00000449757 DUX4L2P0CJ85 424 aa8.49□□□□□ -1.05
DDX39B-211ENST00000449757 DUX4L3P0CJ86 424 aa8.49□□□□□ -1.05
DDX39B-211ENST00000449757 DUX4L4P0CJ87 422 aa8.49□□□□□ -1.05
DDX39B-211ENST00000449757 DUX4L5P0CJ88 424 aa8.49□□□□□ -1.05
DDX39B-211ENST00000449757 DUX4L6P0CJ89 424 aa8.49□□□□□ -1.05
DDX39B-211ENST00000449757 DUX4L7P0CJ90 424 aa8.49□□□□□ -1.05
DDX39B-211ENST00000449757 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
DDX39B-211ENST00000449757 NOS3P29474 1203 aa8.49□□□□□ -1.05
DDX39B-211ENST00000449757 LIPEQ05469 1076 aa8.49□□□□□ -1.05
DDX39B-211ENST00000449757 KLRD1Q13241 179 aa8.49□□□□□ -1.05
DDX39B-211ENST00000449757 IKZF1Q13422 519 aa8.49□□□□□ -1.05
DDX39B-211ENST00000449757 FAM189A2Q15884 450 aa8.49□□□□□ -1.05
DDX39B-211ENST00000449757 SNAI3Q3KNW1 292 aa8.49□□□□□ -1.05
DDX39B-211ENST00000449757 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
DDX39B-211ENST00000449757 SMARCD3Q6STE5 483 aa8.49□□□□□ -1.05
DDX39B-211ENST00000449757 COLCA1Q6ZS62 124 aa8.49□□□□□ -1.05
DDX39B-211ENST00000449757 Q6ZTK2 550 aa8.49□□□□□ -1.05
DDX39B-211ENST00000449757 CBLL1Q75N03 491 aa8.49□□□□□ -1.05
DDX39B-211ENST00000449757 ARPINQ7Z6K5 226 aa8.49□□□□□ -1.05
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