RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424993.1

SNX18P3-201, Transcript of sorting nexin 18 pseudogene 3, humanhuman

BASIC

Gene SNX18P3, Length 835 nt, Biotype transcribed unprocessed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18P3-201ENST00000424993 SP140LQ9H930 580 aa6.51□□□□□ -1.37
SNX18P3-201ENST00000424993 ELOVL3Q9HB03 270 aa6.51□□□□□ -1.37
SNX18P3-201ENST00000424993 BRD7Q9NPI1 651 aa6.51□□□□□ -1.37
SNX18P3-201ENST00000424993 CA10Q9NS85 328 aa6.51□□□□□ -1.37
SNX18P3-201ENST00000424993 SCN3BQ9NY72 215 aa6.51□□□□□ -1.37
SNX18P3-201ENST00000424993 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa6.51□□□□□ -1.37
SNX18P3-201ENST00000424993 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
SNX18P3-201ENST00000424993 LAMP5Q9UJQ1 280 aa6.51□□□□□ -1.37
SNX18P3-201ENST00000424993 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
SNX18P3-201ENST00000424993 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
SNX18P3-201ENST00000424993 STARD10Q9Y365 291 aa6.51□□□□□ -1.37
SNX18P3-201ENST00000424993 TPRKBQ9Y3C4 175 aa6.51□□□□□ -1.37
SNX18P3-201ENST00000424993 SPEF1Q9Y4P9 236 aa6.51□□□□□ -1.37
SNX18P3-201ENST00000424993 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SNX18P3-201ENST00000424993 TMEM129A0AVI4 362 aa6.5□□□□□ -1.37
SNX18P3-201ENST00000424993 TRIM64BA6NI03 449 aa6.5□□□□□ -1.37
SNX18P3-201ENST00000424993 SLC1A7O00341 560 aa6.5□□□□□ -1.37
SNX18P3-201ENST00000424993 ABHD16AO95870 558 aa6.5□□□□□ -1.37
SNX18P3-201ENST00000424993 ADRA2AP08913 450 aa6.5□□□□□ -1.37
SNX18P3-201ENST00000424993 TACSTD2P09758 323 aa6.5□□□□□ -1.37
SNX18P3-201ENST00000424993 H2BFMP0C1H6 154 aa6.5□□□□□ -1.37
SNX18P3-201ENST00000424993 ACSM4P0C7M7 580 aa6.5□□□□□ -1.37
SNX18P3-201ENST00000424993 CRHBPP24387 322 aa6.5□□□□□ -1.37
SNX18P3-201ENST00000424993 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SNX18P3-201ENST00000424993 TTKP33981 857 aa6.5□□□□□ -1.37
SNX18P3-201ENST00000424993 GLRXP35754 106 aa6.5□□□□□ -1.37
SNX18P3-201ENST00000424993 CDKN1AP38936 164 aa6.5□□□□□ -1.37
SNX18P3-201ENST00000424993 MPV17P39210 176 aa6.5□□□□□ -1.37
SNX18P3-201ENST00000424993 EVX1P49640 407 aa6.5□□□□□ -1.37
SNX18P3-201ENST00000424993 TPTEP56180 551 aa6.5□□□□□ -1.37
SNX18P3-201ENST00000424993 ST3GAL4Q11206 333 aa6.5□□□□□ -1.37
SNX18P3-201ENST00000424993 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SNX18P3-201ENST00000424993 CDONQ4KMG0 1287 aa6.5□□□□□ -1.37
SNX18P3-201ENST00000424993 TMEM255AQ5JRV8 349 aa6.5□□□□□ -1.37
SNX18P3-201ENST00000424993 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SNX18P3-201ENST00000424993 FDX2Q6P4F2 183 aa6.5□□□□□ -1.37
SNX18P3-201ENST00000424993 PRSS45Q7RTY3 260 aa6.5□□□□□ -1.37
SNX18P3-201ENST00000424993 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SNX18P3-201ENST00000424993 MUC15Q8N387 334 aa6.5□□□□□ -1.37
SNX18P3-201ENST00000424993 ZNF283Q8N7M2 679 aa6.5□□□□□ -1.37
SNX18P3-201ENST00000424993 ZNF611Q8N823 705 aa6.5□□□□□ -1.37
SNX18P3-201ENST00000424993 OR10H4Q8NGA5 316 aa6.5□□□□□ -1.37
SNX18P3-201ENST00000424993 OR52I1Q8NGK6 324 aa6.5□□□□□ -1.37
SNX18P3-201ENST00000424993 SLC25A40Q8TBP6 338 aa6.5□□□□□ -1.37
SNX18P3-201ENST00000424993 TMEM171Q8WVE6 324 aa6.5□□□□□ -1.37
SNX18P3-201ENST00000424993 PIGTQ969N2 578 aa6.5□□□□□ -1.37
SNX18P3-201ENST00000424993 SPTSSAQ969W0 71 aa6.5□□□□□ -1.37
SNX18P3-201ENST00000424993 PPP1R14AQ96A00 147 aa6.5□□□□□ -1.37
SNX18P3-201ENST00000424993 PERPQ96FX8 193 aa6.5□□□□□ -1.37
SNX18P3-201ENST00000424993 TMEM80Q96HE8 168 aa6.5□□□□□ -1.37
SNX18P3-201ENST00000424993 OR8B4Q96RC9 309 aa6.5□□□□□ -1.37
SNX18P3-201ENST00000424993 CCL19Q99731 98 aa6.5□□□□□ -1.37
SNX18P3-201ENST00000424993 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa6.5□□□□□ -1.37
SNX18P3-201ENST00000424993 CDCA4Q9BXL8 241 aa6.5□□□□□ -1.37
SNX18P3-201ENST00000424993 MROQ9BYG7 248 aa6.5□□□□□ -1.37
SNX18P3-201ENST00000424993 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SNX18P3-201ENST00000424993 OR2J1Q9GZK6 312 aa6.5□□□□□ -1.37
SNX18P3-201ENST00000424993 ZNF442Q9H7R0 627 aa6.5□□□□□ -1.37
SNX18P3-201ENST00000424993 PTTG3PQ9NZH4 202 aa6.5□□□□□ -1.37
SNX18P3-201ENST00000424993 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SNX18P3-201ENST00000424993 DUSP13Q9UII6 198 aa6.5□□□□□ -1.37
SNX18P3-201ENST00000424993 ZNF391Q9UJN7 358 aa6.5□□□□□ -1.37
SNX18P3-201ENST00000424993 BLOC1S6Q9UL45 172 aa6.5□□□□□ -1.37
SNX18P3-201ENST00000424993 MYRFQ9Y2G1 1151 aa6.5□□□□□ -1.37
SNX18P3-201ENST00000424993 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SNX18P3-201ENST00000424993 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SNX18P3-201ENST00000424993 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa6.5□□□□□ -1.37
SNX18P3-201ENST00000424993 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa6.5□□□□□ -1.37
SNX18P3-201ENST00000424993 PLCE1Q9P212 2302 aa6.49□□□□□ -1.37
SNX18P3-201ENST00000424993 USF3Q68DE3 2245 aa6.49□□□□□ -1.37
SNX18P3-201ENST00000424993 DAPL1A0PJW8 107 aa6.49□□□□□ -1.37
SNX18P3-201ENST00000424993 VSTM5A8MXK1 200 aa6.49□□□□□ -1.37
SNX18P3-201ENST00000424993 M0R135 149 aa6.49□□□□□ -1.37
SNX18P3-201ENST00000424993 ST8SIA5O15466 376 aa6.49□□□□□ -1.37
SNX18P3-201ENST00000424993 TBX1O43435 398 aa6.49□□□□□ -1.37
SNX18P3-201ENST00000424993 XPNPEP2O43895 674 aa6.49□□□□□ -1.37
SNX18P3-201ENST00000424993 NDUFS7O75251 213 aa6.49□□□□□ -1.37
SNX18P3-201ENST00000424993 LCATP04180 440 aa6.49□□□□□ -1.37
SNX18P3-201ENST00000424993 CDK1P06493 297 aa6.49□□□□□ -1.37
SNX18P3-201ENST00000424993 LIMS3P0CW19 117 aa6.49□□□□□ -1.37
SNX18P3-201ENST00000424993 LIMS4P0CW20 117 aa6.49□□□□□ -1.37
SNX18P3-201ENST00000424993 ZNF250P15622 560 aa6.49□□□□□ -1.37
SNX18P3-201ENST00000424993 HSD11B1P28845 292 aa6.49□□□□□ -1.37
SNX18P3-201ENST00000424993 SERPINF1P36955 418 aa6.49□□□□□ -1.37
SNX18P3-201ENST00000424993 RBMXP38159 391 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
SNX18P3-201ENST00000424993 ALDH3B1P43353 468 aa6.49□□□□□ -1.37
SNX18P3-201ENST00000424993 SLC6A9P48067 706 aa6.49□□□□□ -1.37
SNX18P3-201ENST00000424993 CX3CR1P49238 355 aa6.49□□□□□ -1.37
SNX18P3-201ENST00000424993 GABARAPL2P60520 117 aa6.49□□□□□ -1.37
SNX18P3-201ENST00000424993 PPP1CBP62140 327 aa6.49□□□□□ -1.37
SNX18P3-201ENST00000424993 ACTA2P62736 377 aa6.49□□□□□ -1.37
SNX18P3-201ENST00000424993 ACTG2P63267 376 aa6.49□□□□□ -1.37
SNX18P3-201ENST00000424993 MVKQ03426 396 aa6.49□□□□□ -1.37
SNX18P3-201ENST00000424993 ZNF85Q03923 595 aa6.49□□□□□ -1.37
SNX18P3-201ENST00000424993 ACSM1Q08AH1 577 aa6.49□□□□□ -1.37
SNX18P3-201ENST00000424993 SNAI3Q3KNW1 292 aa6.49□□□□□ -1.37
SNX18P3-201ENST00000424993 CCDC58Q4VC31 144 aa6.49□□□□□ -1.37
SNX18P3-201ENST00000424993 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
SNX18P3-201ENST00000424993 Q6ZSR3 168 aa6.49□□□□□ -1.37
SNX18P3-201ENST00000424993 KRT74Q7RTS7 529 aa6.49□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.5 ms