RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370826.3

RABGGTB-202, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGGTB, Length 512 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-202ENST00000370826 HSDL1Q3SXM5 330 aa2.01□□□□□ -2.09
RABGGTB-202ENST00000370826 DNLZQ5SXM8 178 aa2.01□□□□□ -2.09
RABGGTB-202ENST00000370826 C9orf135Q5VTT2 229 aa2.01□□□□□ -2.09
RABGGTB-202ENST00000370826 UBE2UQ5VVX9 321 aa2.01□□□□□ -2.09
RABGGTB-202ENST00000370826 H3F3CQ6NXT2 135 aa2.01□□□□□ -2.09
RABGGTB-202ENST00000370826 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa2.01□□□□□ -2.09
RABGGTB-202ENST00000370826 SLC16A13Q7RTY0 426 aa2.01□□□□□ -2.09
RABGGTB-202ENST00000370826 SPATA24Q86W54 205 aa2.01□□□□□ -2.09
RABGGTB-202ENST00000370826 WDFY1Q8IWB7 410 aa2.01□□□□□ -2.09
RABGGTB-202ENST00000370826 GATSQ8NAP1 163 aa2.01□□□□□ -2.09
RABGGTB-202ENST00000370826 LRRC29Q8WV35 223 aa2.01□□□□□ -2.09
RABGGTB-202ENST00000370826 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP2.01□□□□□ -2.09
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RABGGTB-202ENST00000370826 ITFG2Q969R8 447 aa2.01□□□□□ -2.09
RABGGTB-202ENST00000370826 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa2.01□□□□□ -2.09
RABGGTB-202ENST00000370826 C8orf44Q96CB5 159 aa2.01□□□□□ -2.09
RABGGTB-202ENST00000370826 MSANTD3Q96H12 275 aa2.01□□□□□ -2.09
RABGGTB-202ENST00000370826 FBXO44Q9H4M3 255 aa2.01□□□□□ -2.09
RABGGTB-202ENST00000370826 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP2.01□□□□□ -2.09
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RABGGTB-202ENST00000370826 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa2.01□□□□□ -2.09
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RABGGTB-202ENST00000370826 PITPNC1Q9UKF7 332 aa2.01□□□□□ -2.09
RABGGTB-202ENST00000370826 S4R3C0 116 aa2.01□□□□□ -2.09
RABGGTB-202ENST00000370826 NEURL4Q96JN8 1562 aa2.01□□□□□ -2.09
RABGGTB-202ENST00000370826 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa2□□□□□ -2.09
RABGGTB-202ENST00000370826 A0A1W2PPV4 95 aa2□□□□□ -2.09
RABGGTB-202ENST00000370826 C5orf63A6NC05 138 aa2□□□□□ -2.09
RABGGTB-202ENST00000370826 A8MUU9 505 aa2□□□□□ -2.09
RABGGTB-202ENST00000370826 K7EM74 188 aa2□□□□□ -2.09
RABGGTB-202ENST00000370826 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP2□□□□□ -2.09
RABGGTB-202ENST00000370826 SIRPB1O00241 398 aa2□□□□□ -2.09
RABGGTB-202ENST00000370826 NDUFAB1O14561 156 aa2□□□□□ -2.09
RABGGTB-202ENST00000370826 CETN3O15182 167 aa2□□□□□ -2.09
RABGGTB-202ENST00000370826 KDELR3O43731 214 aa2□□□□□ -2.09
RABGGTB-202ENST00000370826 REM1O75628 298 aa2□□□□□ -2.09
RABGGTB-202ENST00000370826 IL4P05112 153 aa2□□□□□ -2.09
RABGGTB-202ENST00000370826 CLTAP09496 248 aa2□□□□□ -2.09
RABGGTB-202ENST00000370826 STAG3L2P0CL84 134 aa2□□□□□ -2.09
RABGGTB-202ENST00000370826 ERGP11308 486 aa2□□□□□ -2.09
RABGGTB-202ENST00000370826 RRM2P31350 389 aa2□□□□□ -2.09
RABGGTB-202ENST00000370826 RAB10P61026 200 aa2□□□□□ -2.09
RABGGTB-202ENST00000370826 PPP1CBP62140 327 aa2□□□□□ -2.09
RABGGTB-202ENST00000370826 PRR3P79522 188 aaKnown RBP2□□□□□ -2.09
RABGGTB-202ENST00000370826 XIAPP98170 497 aa2□□□□□ -2.09
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RABGGTB-202ENST00000370826 C22orf42Q6IC83 251 aa2□□□□□ -2.09
RABGGTB-202ENST00000370826 NPSR1Q6W5P4 371 aa2□□□□□ -2.09
RABGGTB-202ENST00000370826 SLC16A14Q7RTX9 510 aa2□□□□□ -2.09
RABGGTB-202ENST00000370826 SNX20Q7Z614 316 aa2□□□□□ -2.09
RABGGTB-202ENST00000370826 COX18Q8N8Q8 333 aa2□□□□□ -2.09
RABGGTB-202ENST00000370826 C11orf72Q8NBR9 251 aa2□□□□□ -2.09
RABGGTB-202ENST00000370826 OR4A4PQ8NGN8 299 aa2□□□□□ -2.09
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RABGGTB-202ENST00000370826 MTCH1Q9NZJ7 389 aa2□□□□□ -2.09
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RABGGTB-202ENST00000370826 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP1.99□□□□□ -2.09
RABGGTB-202ENST00000370826 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa1.99□□□□□ -2.09
RABGGTB-202ENST00000370826 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa1.99□□□□□ -2.09
RABGGTB-202ENST00000370826 H7C417 338 aa1.99□□□□□ -2.09
RABGGTB-202ENST00000370826 PSMD11O00231 422 aa1.99□□□□□ -2.09
RABGGTB-202ENST00000370826 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP1.99□□□□□ -2.09
RABGGTB-202ENST00000370826 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP1.99□□□□□ -2.09
RABGGTB-202ENST00000370826 ARG1P05089 322 aa1.99□□□□□ -2.09
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF688P0C7X2 276 aa1.99□□□□□ -2.09
RABGGTB-202ENST00000370826 CT45A6P0DMU7 189 aa1.99□□□□□ -2.09
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RABGGTB-202ENST00000370826 CT45A7P0DMV0 189 aa1.99□□□□□ -2.09
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RABGGTB-202ENST00000370826 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP1.99□□□□□ -2.09
RABGGTB-202ENST00000370826 MPV17L2Q567V2 206 aa1.99□□□□□ -2.09
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RABGGTB-202ENST00000370826 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP1.99□□□□□ -2.09
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