RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000259365.8

TMOD1-201, Transcript of tropomodulin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMOD1, Length 3,343 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1-201ENST00000259365 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
TMOD1-201ENST00000259365 HSD11B2P80365 405 aa11.94□□□□□ -0.5
TMOD1-201ENST00000259365 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
TMOD1-201ENST00000259365 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
TMOD1-201ENST00000259365 CEP250Q9BV73 2442 aa11.93□□□□□ -0.5
TMOD1-201ENST00000259365 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
TMOD1-201ENST00000259365 WDPCPO95876 746 aa11.93□□□□□ -0.5
TMOD1-201ENST00000259365 ITGB2P05107 769 aa11.93□□□□□ -0.5
TMOD1-201ENST00000259365 UBBP0CG47 229 aa11.93□□□□□ -0.5
TMOD1-201ENST00000259365 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
TMOD1-201ENST00000259365 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
TMOD1-201ENST00000259365 CASRP41180 1078 aa11.93□□□□□ -0.5
TMOD1-201ENST00000259365 FXYD4P59646 89 aa11.93□□□□□ -0.5
TMOD1-201ENST00000259365 FGL1Q08830 312 aa11.93□□□□□ -0.5
TMOD1-201ENST00000259365 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
TMOD1-201ENST00000259365 DNM1P34Q6PK57 102 aa11.93□□□□□ -0.5
TMOD1-201ENST00000259365 C20orf196Q8IYI0 205 aa11.93□□□□□ -0.5
TMOD1-201ENST00000259365 OR5M8Q8NGP6 311 aa11.93□□□□□ -0.5
TMOD1-201ENST00000259365 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa11.93□□□□□ -0.5
TMOD1-201ENST00000259365 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
TMOD1-201ENST00000259365 FBRSQ9HAH7 460 aa11.93□□□□□ -0.5
TMOD1-201ENST00000259365 A0A0D9SG52 128 aa11.93□□□□□ -0.5
TMOD1-201ENST00000259365 MEGF11A6BM72 1044 aa11.93□□□□□ -0.5
TMOD1-201ENST00000259365 OR6C76A6NM76 312 aa11.93□□□□□ -0.5
TMOD1-201ENST00000259365 HPP00738 406 aa11.93□□□□□ -0.5
TMOD1-201ENST00000259365 MPGP29372 298 aa11.93□□□□□ -0.5
TMOD1-201ENST00000259365 LYG2Q86SG7 212 aa11.93□□□□□ -0.5
TMOD1-201ENST00000259365 TMEM229BQ8NBD8 167 aa11.93□□□□□ -0.5
TMOD1-201ENST00000259365 OR4K17Q8NGC6 315 aa11.93□□□□□ -0.5
TMOD1-201ENST00000259365 OR6K3Q8NGY3 331 aa11.93□□□□□ -0.5
TMOD1-201ENST00000259365 OR51F2Q8NH61 342 aa11.93□□□□□ -0.5
TMOD1-201ENST00000259365 TMEM234Q8WY98 164 aa11.93□□□□□ -0.5
TMOD1-201ENST00000259365 MARC2Q969Z3 335 aa11.93□□□□□ -0.5
TMOD1-201ENST00000259365 C20orf24Q9BUV8 137 aa11.93□□□□□ -0.5
TMOD1-201ENST00000259365 SLC22A11Q9NSA0 550 aa11.93□□□□□ -0.5
TMOD1-201ENST00000259365 EHFQ9NZC4 300 aa11.93□□□□□ -0.5
TMOD1-201ENST00000259365 RAB27BO00194 218 aa11.93□□□□□ -0.5
TMOD1-201ENST00000259365 RAMP1O60894 148 aa11.93□□□□□ -0.5
TMOD1-201ENST00000259365 NFYBP25208 207 aa11.93□□□□□ -0.5
TMOD1-201ENST00000259365 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
TMOD1-201ENST00000259365 UBA52P62987 128 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
TMOD1-201ENST00000259365 RNF4P78317 190 aa11.93□□□□□ -0.5
TMOD1-201ENST00000259365 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa11.93□□□□□ -0.5
TMOD1-201ENST00000259365 OR52H1Q8NGJ2 320 aa11.93□□□□□ -0.5
TMOD1-201ENST00000259365 SDHAF3Q9NRP4 125 aa11.93□□□□□ -0.5
TMOD1-201ENST00000259365 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
TMOD1-201ENST00000259365 RABL2BQ9UNT1 228 aa11.93□□□□□ -0.5
TMOD1-201ENST00000259365 ESPL1Q14674 2120 aa11.92□□□□□ -0.5
TMOD1-201ENST00000259365 TMEM200CA6NKL6 621 aa11.92□□□□□ -0.5
TMOD1-201ENST00000259365 ALG1L2C9J202 215 aa11.92□□□□□ -0.5
TMOD1-201ENST00000259365 MS4A18H0YCH9 400 aa11.92□□□□□ -0.5
TMOD1-201ENST00000259365 PSMB6P28072 239 aa11.92□□□□□ -0.5
TMOD1-201ENST00000259365 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
TMOD1-201ENST00000259365 ASCL1P50553 236 aa11.92□□□□□ -0.5
TMOD1-201ENST00000259365 UNC119Q13432 240 aa11.92□□□□□ -0.5
TMOD1-201ENST00000259365 MS4A18Q3C1V0 323 aa11.92□□□□□ -0.5
TMOD1-201ENST00000259365 SP6Q3SY56 376 aa11.92□□□□□ -0.5
TMOD1-201ENST00000259365 FNDC7Q5VTL7 733 aa11.92□□□□□ -0.5
TMOD1-201ENST00000259365 H3F3CQ6NXT2 135 aa11.92□□□□□ -0.5
TMOD1-201ENST00000259365 OR5H2Q8NGV7 314 aa11.92□□□□□ -0.5
TMOD1-201ENST00000259365 NUBPLQ8TB37 319 aa11.92□□□□□ -0.5
TMOD1-201ENST00000259365 PGAM5Q96HS1 289 aa11.92□□□□□ -0.5
TMOD1-201ENST00000259365 RAB22AQ9UL26 194 aa11.92□□□□□ -0.5
TMOD1-201ENST00000259365 A8MXK9 166 aa11.92□□□□□ -0.5
TMOD1-201ENST00000259365 TRIM77I1YAP6 450 aa11.92□□□□□ -0.5
TMOD1-201ENST00000259365 FGF2P09038 288 aa11.92□□□□□ -0.5
TMOD1-201ENST00000259365 RPA2P15927 270 aa11.92□□□□□ -0.5
TMOD1-201ENST00000259365 ANOS1P23352 680 aa11.92□□□□□ -0.5
TMOD1-201ENST00000259365 OPRM1P35372 400 aa11.92□□□□□ -0.5
TMOD1-201ENST00000259365 ISXQ2M1V0 245 aa11.92□□□□□ -0.5
TMOD1-201ENST00000259365 PDSS1Q5T2R2 415 aa11.92□□□□□ -0.5
TMOD1-201ENST00000259365 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
TMOD1-201ENST00000259365 SLC39A7Q92504 469 aa11.92□□□□□ -0.5
TMOD1-201ENST00000259365 ARPC5LQ9BPX5 153 aa11.92□□□□□ -0.5
TMOD1-201ENST00000259365 C1orf198Q9H425 327 aa11.92□□□□□ -0.5
TMOD1-201ENST00000259365 WBP1LQ9NX94 342 aa11.92□□□□□ -0.5
TMOD1-201ENST00000259365 C5orf63A6NC05 138 aa11.91□□□□□ -0.5
TMOD1-201ENST00000259365 STMND1H3BQB6 276 aa11.91□□□□□ -0.5
TMOD1-201ENST00000259365 ANGPTL7O43827 346 aa11.91□□□□□ -0.5
TMOD1-201ENST00000259365 OR2J2O76002 312 aa11.91□□□□□ -0.5
TMOD1-201ENST00000259365 TTRP02766 147 aa11.91□□□□□ -0.5
TMOD1-201ENST00000259365 CD1AP06126 327 aa11.91□□□□□ -0.5
TMOD1-201ENST00000259365 ZNF43P17038 809 aa11.91□□□□□ -0.5
TMOD1-201ENST00000259365 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
TMOD1-201ENST00000259365 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
TMOD1-201ENST00000259365 UEVLDQ8IX04 471 aa11.91□□□□□ -0.5
TMOD1-201ENST00000259365 SLC22A24Q8N4F4 322 aa11.91□□□□□ -0.5
TMOD1-201ENST00000259365 OR1N1Q8NGS0 311 aa11.91□□□□□ -0.5
TMOD1-201ENST00000259365 AIFM2Q9BRQ8 373 aa11.91□□□□□ -0.5
TMOD1-201ENST00000259365 TMEM59Q9BXS4 323 aa11.91□□□□□ -0.5
TMOD1-201ENST00000259365 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
TMOD1-201ENST00000259365 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
TMOD1-201ENST00000259365 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa11.91□□□□□ -0.5
TMOD1-201ENST00000259365 AUP1Q9Y679 476 aa11.91□□□□□ -0.5
TMOD1-201ENST00000259365 ZNF217O75362 1048 aa11.91□□□□□ -0.5
TMOD1-201ENST00000259365 TXNDC12O95881 172 aa11.91□□□□□ -0.5
TMOD1-201ENST00000259365 MYBPHQ13203 477 aa11.91□□□□□ -0.5
TMOD1-201ENST00000259365 OR10G3Q8NGC4 313 aa11.91□□□□□ -0.5
TMOD1-201ENST00000259365 OR6C1Q96RD1 312 aa11.91□□□□□ -0.5
TMOD1-201ENST00000259365 MFRPQ9BY79 579 aa11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.8 ms