RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246199.5

C20orf173-201, Transcript of chromosome 20 open reading frame 173, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene C20orf173, Length 1,034 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C20orf173-201ENST00000246199 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
C20orf173-201ENST00000246199 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
C20orf173-201ENST00000246199 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa8.17□□□□□ -1.1
C20orf173-201ENST00000246199 RASSF4Q9H2L5 321 aa8.17□□□□□ -1.1
C20orf173-201ENST00000246199 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa8.17□□□□□ -1.1
C20orf173-201ENST00000246199 CENPMQ9NSP4 180 aa8.17□□□□□ -1.1
C20orf173-201ENST00000246199 NUP50Q9UKX7 468 aa8.17□□□□□ -1.1
C20orf173-201ENST00000246199 FAM183AA6NL82 134 aa8.16□□□□□ -1.1
C20orf173-201ENST00000246199 C3orf80F5H4A9 247 aa8.16□□□□□ -1.1
C20orf173-201ENST00000246199 IFNL4K9M1U5 179 aa8.16□□□□□ -1.1
C20orf173-201ENST00000246199 SPARCP09486 303 aa8.16□□□□□ -1.1
C20orf173-201ENST00000246199 RPS2P15880 293 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
C20orf173-201ENST00000246199 SPI1P17947 270 aa8.16□□□□□ -1.1
C20orf173-201ENST00000246199 COMPP49747 757 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
C20orf173-201ENST00000246199 RAD23AP54725 363 aa8.16□□□□□ -1.1
C20orf173-201ENST00000246199 GNB2P62879 340 aa8.16□□□□□ -1.1
C20orf173-201ENST00000246199 POU4F2Q12837 409 aa8.16□□□□□ -1.1
C20orf173-201ENST00000246199 MALLQ13021 153 aa8.16□□□□□ -1.1
C20orf173-201ENST00000246199 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
C20orf173-201ENST00000246199 OR8G1Q15617 311 aa8.16□□□□□ -1.1
C20orf173-201ENST00000246199 PCK2Q16822 640 aa8.16□□□□□ -1.1
C20orf173-201ENST00000246199 MICAQ29983 383 aa8.16□□□□□ -1.1
C20orf173-201ENST00000246199 ZNF404Q494X3 552 aa8.16□□□□□ -1.1
C20orf173-201ENST00000246199 SPATS1Q496A3 300 aa8.16□□□□□ -1.1
C20orf173-201ENST00000246199 ARMCX4Q5H9R4 360 aa8.16□□□□□ -1.1
C20orf173-201ENST00000246199 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
C20orf173-201ENST00000246199 OR2T5Q6IEZ7 315 aa8.16□□□□□ -1.1
C20orf173-201ENST00000246199 ZNF841Q6ZN19 808 aa8.16□□□□□ -1.1
C20orf173-201ENST00000246199 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa8.16□□□□□ -1.1
C20orf173-201ENST00000246199 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
C20orf173-201ENST00000246199 IQCF1Q8N6M8 205 aa8.16□□□□□ -1.1
C20orf173-201ENST00000246199 C3orf56Q8N813 242 aa8.16□□□□□ -1.1
C20orf173-201ENST00000246199 OR2T29Q8NH02 315 aa8.16□□□□□ -1.1
C20orf173-201ENST00000246199 RAB40AQ8WXH6 277 aa8.16□□□□□ -1.1
C20orf173-201ENST00000246199 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
C20orf173-201ENST00000246199 SPTSSAQ969W0 71 aa8.16□□□□□ -1.1
C20orf173-201ENST00000246199 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
C20orf173-201ENST00000246199 SLAMF6Q96DU3 332 aa8.16□□□□□ -1.1
C20orf173-201ENST00000246199 MRI1Q9BV20 369 aa8.16□□□□□ -1.1
C20orf173-201ENST00000246199 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
C20orf173-201ENST00000246199 TBC1D23Q9NUY8 699 aa8.16□□□□□ -1.1
C20orf173-201ENST00000246199 NDE1Q9NXR1 346 aa8.16□□□□□ -1.1
C20orf173-201ENST00000246199 MIOXQ9UGB7 285 aa8.16□□□□□ -1.1
C20orf173-201ENST00000246199 OR5V1Q9UGF6 321 aa8.16□□□□□ -1.1
C20orf173-201ENST00000246199 LRCH1Q9Y2L9 728 aa8.16□□□□□ -1.1
C20orf173-201ENST00000246199 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
C20orf173-201ENST00000246199 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa8.16□□□□□ -1.1
C20orf173-201ENST00000246199 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa8.15□□□□□ -1.1
C20orf173-201ENST00000246199 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa8.15□□□□□ -1.1
C20orf173-201ENST00000246199 DHRS12A0PJE2 317 aa8.15□□□□□ -1.1
C20orf173-201ENST00000246199 GGT3PA6NGU5 568 aa8.15□□□□□ -1.1
C20orf173-201ENST00000246199 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa8.15□□□□□ -1.1
C20orf173-201ENST00000246199 ACOT8O14734 319 aa8.15□□□□□ -1.1
C20orf173-201ENST00000246199 FCN3O75636 299 aa8.15□□□□□ -1.1
C20orf173-201ENST00000246199 GRPP07492 148 aa8.15□□□□□ -1.1
C20orf173-201ENST00000246199 EGR1P18146 543 aa8.15□□□□□ -1.1
C20orf173-201ENST00000246199 FMO3P31513 532 aa8.15□□□□□ -1.1
C20orf173-201ENST00000246199 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
C20orf173-201ENST00000246199 CD200P41217 278 aa8.15□□□□□ -1.1
C20orf173-201ENST00000246199 GATA4P43694 442 aa8.15□□□□□ -1.1
C20orf173-201ENST00000246199 PITPNBP48739 271 aa8.15□□□□□ -1.1
C20orf173-201ENST00000246199 ENTPD1P49961 510 aa8.15□□□□□ -1.1
C20orf173-201ENST00000246199 MNAT1P51948 309 aa8.15□□□□□ -1.1
C20orf173-201ENST00000246199 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
C20orf173-201ENST00000246199 ZNF181Q2M3W8 571 aa8.15□□□□□ -1.1
C20orf173-201ENST00000246199 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
C20orf173-201ENST00000246199 AWAT1Q58HT5 328 aa8.15□□□□□ -1.1
C20orf173-201ENST00000246199 LINC01590Q5TEZ4 76 aa8.15□□□□□ -1.1
C20orf173-201ENST00000246199 LCN8Q6JVE9 175 aa8.15□□□□□ -1.1
C20orf173-201ENST00000246199 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa8.15□□□□□ -1.1
C20orf173-201ENST00000246199 ZNF826PQ6ZT77 177 aa8.15□□□□□ -1.1
C20orf173-201ENST00000246199 DOK3Q7L591 496 aa8.15□□□□□ -1.1
C20orf173-201ENST00000246199 LINC00471Q8N535 108 aa8.15□□□□□ -1.1
C20orf173-201ENST00000246199 OR6K6Q8NGW6 343 aa8.15□□□□□ -1.1
C20orf173-201ENST00000246199 Q8TCH9 128 aa8.15□□□□□ -1.1
C20orf173-201ENST00000246199 SGK3Q96BR1 496 aa8.15□□□□□ -1.1
C20orf173-201ENST00000246199 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
C20orf173-201ENST00000246199 JMJD8Q96S16 334 aa8.15□□□□□ -1.1
C20orf173-201ENST00000246199 AMELYQ99218 206 aa8.15□□□□□ -1.1
C20orf173-201ENST00000246199 FEVQ99581 238 aa8.15□□□□□ -1.1
C20orf173-201ENST00000246199 COPS4Q9BT78 406 aa8.15□□□□□ -1.1
C20orf173-201ENST00000246199 DGCR6LQ9BY27 220 aa8.15□□□□□ -1.1
C20orf173-201ENST00000246199 MAGIXQ9H6Y5 334 aa8.15□□□□□ -1.1
C20orf173-201ENST00000246199 TAS2R1Q9NYW7 299 aa8.15□□□□□ -1.1
C20orf173-201ENST00000246199 ZNF319Q9P2F9 582 aa8.15□□□□□ -1.1
C20orf173-201ENST00000246199 CTSZQ9UBR2 303 aa8.15□□□□□ -1.1
C20orf173-201ENST00000246199 KCNG2Q9UJ96 466 aa8.15□□□□□ -1.1
C20orf173-201ENST00000246199 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa8.15□□□□□ -1.11
C20orf173-201ENST00000246199 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa8.14□□□□□ -1.11
C20orf173-201ENST00000246199 LRRC30A6NM36 301 aa8.14□□□□□ -1.11
C20orf173-201ENST00000246199 C22orf46C9J442 243 aa8.14□□□□□ -1.11
C20orf173-201ENST00000246199 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
C20orf173-201ENST00000246199 PRKACGP22612 351 aa8.14□□□□□ -1.11
C20orf173-201ENST00000246199 SLC25A1P53007 311 aa8.14□□□□□ -1.11
C20orf173-201ENST00000246199 BAMBIQ13145 260 aa8.14□□□□□ -1.11
C20orf173-201ENST00000246199 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
C20orf173-201ENST00000246199 TAF13Q15543 124 aa8.14□□□□□ -1.11
C20orf173-201ENST00000246199 TEX30Q5JUR7 227 aa8.14□□□□□ -1.11
C20orf173-201ENST00000246199 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
C20orf173-201ENST00000246199 DRAM2Q6UX65 266 aa8.14□□□□□ -1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.9 ms