RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607882.5

RABGEF1-209, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 2,654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-209ENST00000607882 CXCR1P25024 350 aa11.04□□□□□ -0.64
RABGEF1-209ENST00000607882 CCKARP32238 428 aa11.04□□□□□ -0.64
RABGEF1-209ENST00000607882 ASCL1P50553 236 aa11.04□□□□□ -0.64
RABGEF1-209ENST00000607882 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
RABGEF1-209ENST00000607882 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa11.04□□□□□ -0.64
RABGEF1-209ENST00000607882 KLHL12Q53G59 568 aa11.04□□□□□ -0.64
RABGEF1-209ENST00000607882 TMEM99Q8N816 258 aa11.04□□□□□ -0.64
RABGEF1-209ENST00000607882 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
RABGEF1-209ENST00000607882 ALG8Q9BVK2 526 aa11.04□□□□□ -0.64
RABGEF1-209ENST00000607882 HCAR1Q9BXC0 346 aa11.04□□□□□ -0.64
RABGEF1-209ENST00000607882 ANKRD19PQ9H560 264 aa11.04□□□□□ -0.64
RABGEF1-209ENST00000607882 ASB6Q9NWX5 421 aa11.04□□□□□ -0.64
RABGEF1-209ENST00000607882 CALML5Q9NZT1 146 aa11.04□□□□□ -0.64
RABGEF1-209ENST00000607882 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
RABGEF1-209ENST00000607882 GPR37O15354 613 aa11.04□□□□□ -0.64
RABGEF1-209ENST00000607882 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
RABGEF1-209ENST00000607882 SLC16A1P53985 500 aa11.04□□□□□ -0.64
RABGEF1-209ENST00000607882 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
RABGEF1-209ENST00000607882 ACSM1Q08AH1 577 aa11.04□□□□□ -0.64
RABGEF1-209ENST00000607882 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa11.04□□□□□ -0.64
RABGEF1-209ENST00000607882 RIN1Q13671 783 aa11.04□□□□□ -0.64
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF674Q2M3X9 581 aa11.04□□□□□ -0.64
RABGEF1-209ENST00000607882 ARL9Q6T311 187 aa11.04□□□□□ -0.64
RABGEF1-209ENST00000607882 TMPPEQ6ZT21 453 aa11.04□□□□□ -0.64
RABGEF1-209ENST00000607882 ACBD7Q8N6N7 88 aa11.04□□□□□ -0.64
RABGEF1-209ENST00000607882 SAMD12Q8N8I0 201 aa11.04□□□□□ -0.64
RABGEF1-209ENST00000607882 SLC37A3Q8NCC5 494 aa11.04□□□□□ -0.64
RABGEF1-209ENST00000607882 OR10H4Q8NGA5 316 aa11.04□□□□□ -0.64
RABGEF1-209ENST00000607882 ST8SIA1Q92185 356 aa11.04□□□□□ -0.64
RABGEF1-209ENST00000607882 C3orf49Q96BT1 292 aa11.04□□□□□ -0.64
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF559Q9BR84 538 aa11.04□□□□□ -0.64
RABGEF1-209ENST00000607882 SFXN3Q9BWM7 321 aa11.04□□□□□ -0.64
RABGEF1-209ENST00000607882 OR52D1Q9H346 318 aa11.04□□□□□ -0.64
RABGEF1-209ENST00000607882 NIPAL2Q9H841 368 aa11.04□□□□□ -0.64
RABGEF1-209ENST00000607882 SERINC1Q9NRX5 453 aa11.04□□□□□ -0.64
RABGEF1-209ENST00000607882 PROCRQ9UNN8 238 aa11.04□□□□□ -0.64
RABGEF1-209ENST00000607882 A0A1B0GWA3 101 aa11.03□□□□□ -0.64
RABGEF1-209ENST00000607882 LYZL6O75951 148 aa11.03□□□□□ -0.64
RABGEF1-209ENST00000607882 SOX30O94993 753 aa11.03□□□□□ -0.64
RABGEF1-209ENST00000607882 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
RABGEF1-209ENST00000607882 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
RABGEF1-209ENST00000607882 QDPRP09417 244 aa11.03□□□□□ -0.64
RABGEF1-209ENST00000607882 AGTR1P30556 359 aa11.03□□□□□ -0.64
RABGEF1-209ENST00000607882 OR10A3P58181 314 aa11.03□□□□□ -0.64
RABGEF1-209ENST00000607882 MAB21L1Q13394 359 aa11.03□□□□□ -0.64
RABGEF1-209ENST00000607882 GPR176Q14439 515 aa11.03□□□□□ -0.64
RABGEF1-209ENST00000607882 ZMYND11Q15326 602 aa11.03□□□□□ -0.64
RABGEF1-209ENST00000607882 OR4M1Q8NGD0 313 aa11.03□□□□□ -0.64
RABGEF1-209ENST00000607882 RNF128Q8TEB7 428 aa11.03□□□□□ -0.64
RABGEF1-209ENST00000607882 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
RABGEF1-209ENST00000607882 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa11.03□□□□□ -0.64
RABGEF1-209ENST00000607882 LIN7BQ9HAP6 207 aa11.03□□□□□ -0.64
RABGEF1-209ENST00000607882 ASH2LQ9UBL3 628 aa11.03□□□□□ -0.64
RABGEF1-209ENST00000607882 A0A1W2PPR1 153 aa11.03□□□□□ -0.64
RABGEF1-209ENST00000607882 IGFBP2P18065 325 aa11.03□□□□□ -0.64
RABGEF1-209ENST00000607882 FXYD6P3P58550 94 aa11.03□□□□□ -0.64
RABGEF1-209ENST00000607882 RPS7P62081 194 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
RABGEF1-209ENST00000607882 TNK1Q13470 666 aa11.03□□□□□ -0.64
RABGEF1-209ENST00000607882 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa11.03□□□□□ -0.64
RABGEF1-209ENST00000607882 NIPAL3Q6P499 406 aa11.03□□□□□ -0.64
RABGEF1-209ENST00000607882 PFN4Q8NHR9 129 aa11.03□□□□□ -0.64
RABGEF1-209ENST00000607882 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
RABGEF1-209ENST00000607882 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa11.03□□□□□ -0.64
RABGEF1-209ENST00000607882 ABCG5Q9H222 651 aa11.03□□□□□ -0.64
RABGEF1-209ENST00000607882 C20orf141Q9NUB4 165 aa11.03□□□□□ -0.64
RABGEF1-209ENST00000607882 BABAM2Q9NXR7 383 aa11.03□□□□□ -0.64
RABGEF1-209ENST00000607882 RASD1Q9Y272 281 aa11.03□□□□□ -0.64
RABGEF1-209ENST00000607882 E9PI62 339 aa11.02□□□□□ -0.64
RABGEF1-209ENST00000607882 PF4V1P10720 104 aa11.02□□□□□ -0.64
RABGEF1-209ENST00000607882 TALDO1P37837 337 aa11.02□□□□□ -0.64
RABGEF1-209ENST00000607882 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.64
RABGEF1-209ENST00000607882 BCL2L15Q5TBC7 163 aa11.02□□□□□ -0.64
RABGEF1-209ENST00000607882 C11orf88Q6PI97 169 aa11.02□□□□□ -0.64
RABGEF1-209ENST00000607882 WDR88Q6ZMY6 472 aa11.02□□□□□ -0.64
RABGEF1-209ENST00000607882 LHFPL5Q8TAF8 219 aa11.02□□□□□ -0.64
RABGEF1-209ENST00000607882 EMC9Q9Y3B6 208 aa11.02□□□□□ -0.64
RABGEF1-209ENST00000607882 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP11.02□□□□□ -0.64
RABGEF1-209ENST00000607882 DAPL1A0PJW8 107 aa11.02□□□□□ -0.65
RABGEF1-209ENST00000607882 J3QRE1 110 aa11.02□□□□□ -0.65
RABGEF1-209ENST00000607882 CGAP01215 116 aa11.02□□□□□ -0.65
RABGEF1-209ENST00000607882 GAAP10253 952 aa11.02□□□□□ -0.65
RABGEF1-209ENST00000607882 IFI30P13284 250 aa11.02□□□□□ -0.65
RABGEF1-209ENST00000607882 ADH6P28332 368 aa11.02□□□□□ -0.65
RABGEF1-209ENST00000607882 SLC6A1P30531 599 aa11.02□□□□□ -0.65
RABGEF1-209ENST00000607882 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
RABGEF1-209ENST00000607882 MTNR1BP49286 362 aa11.02□□□□□ -0.65
RABGEF1-209ENST00000607882 RAC3P60763 192 aa11.02□□□□□ -0.65
RABGEF1-209ENST00000607882 EGR4Q05215 589 aa11.02□□□□□ -0.65
RABGEF1-209ENST00000607882 SLC3A1Q07837 685 aa11.02□□□□□ -0.65
RABGEF1-209ENST00000607882 FAM189A2Q15884 450 aa11.02□□□□□ -0.65
RABGEF1-209ENST00000607882 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
RABGEF1-209ENST00000607882 ALG10BQ5I7T1 473 aa11.02□□□□□ -0.65
RABGEF1-209ENST00000607882 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP11.02□□□□□ -0.65
RABGEF1-209ENST00000607882 RFT1Q96AA3 541 aa11.02□□□□□ -0.65
RABGEF1-209ENST00000607882 CREB3L1Q96BA8 519 aa11.02□□□□□ -0.65
RABGEF1-209ENST00000607882 C12orf57Q99622 126 aa11.02□□□□□ -0.65
RABGEF1-209ENST00000607882 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP11.02□□□□□ -0.65
RABGEF1-209ENST00000607882 OR51V1Q9H2C8 321 aa11.02□□□□□ -0.65
RABGEF1-209ENST00000607882 TRIM36Q9NQ86 728 aa11.02□□□□□ -0.65
RABGEF1-209ENST00000607882 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.9 ms