RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554698.5

SDR39U1-208, Transcript of short chain dehydrogenase/reductase family 39U member 1, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene SDR39U1, Length 1,364 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SDR39U1-208	ENST00000554698	SELENOV	P59797	346 aa		18.37	■□□□□ 0.53
SDR39U1-208	ENST00000554698	SMN1	Q16637	294 aa	Known RBP	18.37	■□□□□ 0.53
SDR39U1-208	ENST00000554698	TMEM255A	Q5JRV8	349 aa		18.37	■□□□□ 0.53
SDR39U1-208	ENST00000554698	FBXW12	Q6X9E4	464 aa		18.37	■□□□□ 0.53
SDR39U1-208	ENST00000554698	PRSS45	Q7RTY3	260 aa		18.37	■□□□□ 0.53
SDR39U1-208	ENST00000554698	KRT77	Q7Z794	578 aa		18.37	■□□□□ 0.53
SDR39U1-208	ENST00000554698	HIST2H2AB	Q8IUE6	130 aa	Predicted RBP	18.37	■□□□□ 0.53
SDR39U1-208	ENST00000554698	ZNF679	Q8IYX0	411 aa		18.37	■□□□□ 0.53
SDR39U1-208	ENST00000554698	ZNF283	Q8N7M2	679 aa		18.37	■□□□□ 0.53
SDR39U1-208	ENST00000554698	OR10H4	Q8NGA5	316 aa		18.37	■□□□□ 0.53
SDR39U1-208	ENST00000554698	MRO	Q9BYG7	248 aa		18.37	■□□□□ 0.53
SDR39U1-208	ENST00000554698	AMBN	Q9NP70	447 aa		18.37	■□□□□ 0.53
SDR39U1-208	ENST00000554698	MRPS18A	Q9NVS2	196 aa	Known RBP	18.37	■□□□□ 0.53
SDR39U1-208	ENST00000554698	RPL36	Q9Y3U8	105 aa	Known RBP	18.37	■□□□□ 0.53
SDR39U1-208	ENST00000554698	ANOS1	P23352	680 aa		18.36	■□□□□ 0.53
SDR39U1-208	ENST00000554698	DCTD	P32321	178 aa		18.36	■□□□□ 0.53
SDR39U1-208	ENST00000554698	VHL	P40337	213 aa		18.36	■□□□□ 0.53
SDR39U1-208	ENST00000554698	PPOX	P50336	477 aa		18.36	■□□□□ 0.53
SDR39U1-208	ENST00000554698	EGR3	Q06889	387 aa		18.36	■□□□□ 0.53
SDR39U1-208	ENST00000554698	SNAI3	Q3KNW1	292 aa		18.36	■□□□□ 0.53
SDR39U1-208	ENST00000554698	SSX6	Q7RTT6	188 aa		18.36	■□□□□ 0.53
SDR39U1-208	ENST00000554698	TBX5	Q99593	518 aa		18.36	■□□□□ 0.53
SDR39U1-208	ENST00000554698	TTTY10	Q9BZA0	68 aa		18.36	■□□□□ 0.53
SDR39U1-208	ENST00000554698	PCDHGB1	Q9Y5G3	927 aa		18.36	■□□□□ 0.53
SDR39U1-208	ENST00000554698	PMF1-BGLAP	U3KQ54	211 aa		18.36	■□□□□ 0.53
SDR39U1-208	ENST00000554698	C5orf63	A6NC05	138 aa		18.35	■□□□□ 0.53
SDR39U1-208	ENST00000554698	PSMD9	O00233	223 aa		18.35	■□□□□ 0.53
SDR39U1-208	ENST00000554698	SLC2A1	P11166	492 aa		18.35	■□□□□ 0.53
SDR39U1-208	ENST00000554698	RAC2	P15153	192 aa		18.35	■□□□□ 0.53
SDR39U1-208	ENST00000554698	HSPA13	P48723	471 aa		18.35	■□□□□ 0.53
SDR39U1-208	ENST00000554698	PTH2R	P49190	550 aa		18.35	■□□□□ 0.53
SDR39U1-208	ENST00000554698	ZNF121	P58317	390 aa	Predicted RBP	18.35	■□□□□ 0.53
SDR39U1-208	ENST00000554698	PSMA6	P60900	246 aa	Known RBP	18.35	■□□□□ 0.53
SDR39U1-208	ENST00000554698	ACTC1	P68032	377 aa		18.35	■□□□□ 0.53
SDR39U1-208	ENST00000554698	ACTA1	P68133	377 aa		18.35	■□□□□ 0.53
SDR39U1-208	ENST00000554698	RAB40B	Q12829	278 aa		18.35	■□□□□ 0.53
SDR39U1-208	ENST00000554698	PSG7	Q13046	419 aa		18.35	■□□□□ 0.53
SDR39U1-208	ENST00000554698	CDK5R2	Q13319	367 aa		18.35	■□□□□ 0.53
SDR39U1-208	ENST00000554698	ZNF684	Q5T5D7	378 aa		18.35	■□□□□ 0.53
SDR39U1-208	ENST00000554698	THAP5	Q7Z6K1	395 aa		18.35	■□□□□ 0.53
SDR39U1-208	ENST00000554698	LRRC75A-AS1	Q8N1F1	130 aa		18.35	■□□□□ 0.53
SDR39U1-208	ENST00000554698	HAVCR1	Q96D42	359 aa		18.35	■□□□□ 0.53
SDR39U1-208	ENST00000554698	FOXC2	Q99958	501 aa		18.35	■□□□□ 0.53
SDR39U1-208	ENST00000554698	PTTG3P	Q9NZH4	202 aa		18.35	■□□□□ 0.53
SDR39U1-208	ENST00000554698		A0A1W2PPW3	197 aa		18.34	■□□□□ 0.53
SDR39U1-208	ENST00000554698		M0R233	179 aa		18.34	■□□□□ 0.53
SDR39U1-208	ENST00000554698	KITLG	P21583	273 aa		18.34	■□□□□ 0.53
SDR39U1-208	ENST00000554698	ZNF85	Q03923	595 aa		18.34	■□□□□ 0.53
SDR39U1-208	ENST00000554698	HLX	Q14774	488 aa	Predicted RBP	18.34	■□□□□ 0.53
SDR39U1-208	ENST00000554698	MOG	Q16653	247 aa		18.34	■□□□□ 0.53
SDR39U1-208	ENST00000554698	LAIR2	Q6ISS4	152 aa		18.34	■□□□□ 0.53
SDR39U1-208	ENST00000554698	CMBL	Q96DG6	245 aa		18.34	■□□□□ 0.53
SDR39U1-208	ENST00000554698	SP140L	Q9H930	580 aa		18.34	■□□□□ 0.53
SDR39U1-208	ENST00000554698	TAAR3P	Q9P1P4	343 aa		18.34	■□□□□ 0.53
SDR39U1-208	ENST00000554698	MRM2	Q9UI43	246 aa	Known RBP	18.34	■□□□□ 0.53
SDR39U1-208	ENST00000554698	IKZF2	Q9UKS7	526 aa		18.34	■□□□□ 0.53
SDR39U1-208	ENST00000554698	OTOG	Q6ZRI0	2925 aa		18.33	■□□□□ 0.53
SDR39U1-208	ENST00000554698	FADS2	O95864	444 aa	Known RBP	18.33	■□□□□ 0.53
SDR39U1-208	ENST00000554698	ALDH3B1	P43353	468 aa		18.33	■□□□□ 0.53
SDR39U1-208	ENST00000554698	MALL	Q13021	153 aa		18.33	■□□□□ 0.53
SDR39U1-208	ENST00000554698	GK2	Q14410	553 aa	Predicted RBP	18.33	■□□□□ 0.53
SDR39U1-208	ENST00000554698	ACBD7	Q8N6N7	88 aa		18.33	■□□□□ 0.53
SDR39U1-208	ENST00000554698	OR52H1	Q8NGJ2	320 aa		18.33	■□□□□ 0.53
SDR39U1-208	ENST00000554698	TRMT61A	Q96FX7	289 aa	Known RBP	18.33	■□□□□ 0.53
SDR39U1-208	ENST00000554698	ANKRD60	Q9BZ19	345 aa		18.33	■□□□□ 0.53
SDR39U1-208	ENST00000554698	CXXC4	Q9H2H0	198 aa		18.33	■□□□□ 0.53
SDR39U1-208	ENST00000554698	DYNLRB1	Q9NP97	96 aa		18.33	■□□□□ 0.53
SDR39U1-208	ENST00000554698	GPR160	Q9UJ42	338 aa		18.33	■□□□□ 0.53
SDR39U1-208	ENST00000554698	MAGEB4	O15481	346 aa	Predicted RBP	18.32	■□□□□ 0.52
SDR39U1-208	ENST00000554698	SULT1C4	O75897	302 aa		18.32	■□□□□ 0.52
SDR39U1-208	ENST00000554698	IGHA1	P01876	353 aa		18.32	■□□□□ 0.52
SDR39U1-208	ENST00000554698	ANXA2	P07355	339 aa	Known RBP	18.32	■□□□□ 0.52
SDR39U1-208	ENST00000554698	ADRA2A	P08913	450 aa		18.32	■□□□□ 0.52
SDR39U1-208	ENST00000554698	MMP15	P51511	669 aa		18.32	■□□□□ 0.52
SDR39U1-208	ENST00000554698	RIDA	P52758	137 aa	Known RBP	18.32	■□□□□ 0.52
SDR39U1-208	ENST00000554698	NKPD1	Q17RQ9	610 aa		18.32	■□□□□ 0.52
SDR39U1-208	ENST00000554698	KLHL22	Q53GT1	634 aa		18.32	■□□□□ 0.52
SDR39U1-208	ENST00000554698	GLYATL3	Q5SZD4	288 aa		18.32	■□□□□ 0.52
SDR39U1-208	ENST00000554698	FAM57B	Q71RH2	274 aa		18.32	■□□□□ 0.52
SDR39U1-208	ENST00000554698	SPSB4	Q96A44	273 aa		18.32	■□□□□ 0.52
SDR39U1-208	ENST00000554698	PERP	Q96FX8	193 aa		18.32	■□□□□ 0.52
SDR39U1-208	ENST00000554698	MS4A5	Q9H3V2	200 aa		18.32	■□□□□ 0.52
SDR39U1-208	ENST00000554698	FAM206A	Q9NX38	181 aa		18.32	■□□□□ 0.52
SDR39U1-208	ENST00000554698	ZNF319	Q9P2F9	582 aa		18.32	■□□□□ 0.52
SDR39U1-208	ENST00000554698	PURG	Q9UJV8	347 aa	Known RBP	18.32	■□□□□ 0.52
SDR39U1-208	ENST00000554698	MYRF	Q9Y2G1	1151 aa		18.32	■□□□□ 0.52
SDR39U1-208	ENST00000554698	USF3	Q68DE3	2245 aa		18.32	■□□□□ 0.52
SDR39U1-208	ENST00000554698	DAPL1	A0PJW8	107 aa		18.31	■□□□□ 0.52
SDR39U1-208	ENST00000554698	ACOD1	A6NK06	481 aa		18.31	■□□□□ 0.52
SDR39U1-208	ENST00000554698	SRSF10	O75494	262 aa	Known RBP	18.31	■□□□□ 0.52
SDR39U1-208	ENST00000554698	KRT8	P05787	483 aa		18.31	■□□□□ 0.52
SDR39U1-208	ENST00000554698	MYF6	P23409	242 aa		18.31	■□□□□ 0.52
SDR39U1-208	ENST00000554698	MMP16	P51512	607 aa		18.31	■□□□□ 0.52
SDR39U1-208	ENST00000554698	ATP5J2	P56134	94 aa		18.31	■□□□□ 0.52
SDR39U1-208	ENST00000554698	ZNF92	Q03936	586 aa		18.31	■□□□□ 0.52
SDR39U1-208	ENST00000554698	ZNF829	Q3KNS6	432 aa	Predicted RBP	18.31	■□□□□ 0.52
SDR39U1-208	ENST00000554698	ALKBH6	Q3KRA9	238 aa		18.31	■□□□□ 0.52
SDR39U1-208	ENST00000554698	OR52I1	Q8NGK6	324 aa		18.31	■□□□□ 0.52
SDR39U1-208	ENST00000554698	REPIN1	Q9BWE0	567 aa	Known RBP	18.31	■□□□□ 0.52
SDR39U1-208	ENST00000554698	FGF20	Q9NP95	211 aa	Predicted RBP	18.31	■□□□□ 0.52

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