RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-231	ENST00000552222	HIST2H3PS2	Q5TEC6	136 aa		11.76	□□□□□ -0.53
CS-231	ENST00000552222	NXNL2	Q5VZ03	156 aa		11.76	□□□□□ -0.53
CS-231	ENST00000552222	HIST2H3A	Q71DI3	136 aa		11.76	□□□□□ -0.53
CS-231	ENST00000552222	BCDIN3D	Q7Z5W3	292 aa	Known RBP	11.76	□□□□□ -0.53
CS-231	ENST00000552222	ZSCAN2	Q7Z7L9	614 aa	Predicted RBP	11.76	□□□□□ -0.53
CS-231	ENST00000552222	UBE2F	Q969M7	185 aa		11.76	□□□□□ -0.53
CS-231	ENST00000552222	MS4A3	Q96HJ5	214 aa		11.76	□□□□□ -0.53
CS-231	ENST00000552222	C1orf147	Q96MC9	270 aa	Predicted RBP	11.76	□□□□□ -0.53
CS-231	ENST00000552222	TMPRSS13	Q9BYE2	586 aa		11.76	□□□□□ -0.53
CS-231	ENST00000552222	WDR76	Q9H967	626 aa		11.76	□□□□□ -0.53
CS-231	ENST00000552222	IMPAD1	Q9NX62	359 aa		11.76	□□□□□ -0.53
CS-231	ENST00000552222	CYB5R1	Q9UHQ9	305 aa		11.76	□□□□□ -0.53
CS-231	ENST00000552222	POLR1D	Q9Y2S0	133 aa		11.76	□□□□□ -0.53
CS-231	ENST00000552222	IGHV2OR16-5	A0A0B4J2B6	119 aa		11.75	□□□□□ -0.53
CS-231	ENST00000552222	CCDC182	A6NF36	153 aa		11.75	□□□□□ -0.53
CS-231	ENST00000552222		H0YJX3	145 aa		11.75	□□□□□ -0.53
CS-231	ENST00000552222	HPX	P02790	462 aa		11.75	□□□□□ -0.53
CS-231	ENST00000552222	ZNF823	P16415	610 aa		11.75	□□□□□ -0.53
CS-231	ENST00000552222	GSTT1	P30711	240 aa		11.75	□□□□□ -0.53
CS-231	ENST00000552222	SNRPG	P62308	76 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
CS-231	ENST00000552222	ADARB1	P78563	741 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
CS-231	ENST00000552222	PLP2	Q04941	152 aa		11.75	□□□□□ -0.53
CS-231	ENST00000552222	SCRN3	Q0VDG4	424 aa		11.75	□□□□□ -0.53
CS-231	ENST00000552222	EFNB3	Q15768	340 aa		11.75	□□□□□ -0.53
CS-231	ENST00000552222	SLC25A30	Q5SVS4	291 aa		11.75	□□□□□ -0.53
CS-231	ENST00000552222	SLC18B1	Q6NT16	456 aa		11.75	□□□□□ -0.53
CS-231	ENST00000552222	CORO6	Q6QEF8	472 aa		11.75	□□□□□ -0.53
CS-231	ENST00000552222	MEPCE	Q7L2J0	689 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
CS-231	ENST00000552222	TIGD4	Q8IY51	512 aa		11.75	□□□□□ -0.53
CS-231	ENST00000552222	ALDH16A1	Q8IZ83	802 aa		11.75	□□□□□ -0.53
CS-231	ENST00000552222	SIGLECL1	Q8N7X8	197 aa		11.75	□□□□□ -0.53
CS-231	ENST00000552222	CPEB3	Q8NE35	698 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
CS-231	ENST00000552222	ZNF555	Q8NEP9	628 aa		11.75	□□□□□ -0.53
CS-231	ENST00000552222	IL17RD	Q8NFM7	739 aa		11.75	□□□□□ -0.53
CS-231	ENST00000552222	AKR7L	Q8NHP1	331 aa		11.75	□□□□□ -0.53
CS-231	ENST00000552222	YIPF5	Q969M3	257 aa		11.75	□□□□□ -0.53
CS-231	ENST00000552222	TEAD3	Q99594	435 aa		11.75	□□□□□ -0.53
CS-231	ENST00000552222	CDADC1	Q9BWV3	514 aa		11.75	□□□□□ -0.53
CS-231	ENST00000552222	C1orf198	Q9H425	327 aa		11.75	□□□□□ -0.53
CS-231	ENST00000552222	G6PC2	Q9NQR9	355 aa		11.75	□□□□□ -0.53
CS-231	ENST00000552222	GRIP1	Q9Y3R0	1128 aa		11.75	□□□□□ -0.53
CS-231	ENST00000552222	SOX21	Q9Y651	276 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
CS-231	ENST00000552222	IQCM	A0A1B0GVH7	501 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CS-231	ENST00000552222	RER1	O15258	196 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CS-231	ENST00000552222	SGCE	O43556	437 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CS-231	ENST00000552222	PTH	P01270	115 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CS-231	ENST00000552222	CRYAA	P02489	173 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CS-231	ENST00000552222	PSKH1	P11801	424 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CS-231	ENST00000552222	ZNF35	P13682	527 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CS-231	ENST00000552222	GABRB1	P18505	474 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CS-231	ENST00000552222	OMG	P23515	440 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CS-231	ENST00000552222	ENTPD1	P49961	510 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CS-231	ENST00000552222	LMO4	P61968	165 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CS-231	ENST00000552222	RPS7	P62081	194 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
CS-231	ENST00000552222	FOXL1	Q12952	345 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CS-231	ENST00000552222	HNRNPA0	Q13151	305 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
CS-231	ENST00000552222	CCDC92	Q53HC0	331 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
CS-231	ENST00000552222	TTC23	Q5W5X9	447 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CS-231	ENST00000552222	ZNF774	Q6NX45	483 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CS-231	ENST00000552222	CFAP77	Q6ZQR2	320 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CS-231	ENST00000552222	VASH1	Q7L8A9	365 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
CS-231	ENST00000552222	LINC00346	Q8IVM7	164 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CS-231	ENST00000552222	GID4	Q8IVV7	300 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CS-231	ENST00000552222	ENTHD1	Q8IYW4	607 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CS-231	ENST00000552222	DHRSX	Q8N5I4	330 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CS-231	ENST00000552222	GJC3	Q8NFK1	279 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CS-231	ENST00000552222	RHOXF1	Q8NHV9	184 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CS-231	ENST00000552222	CYGB	Q8WWM9	190 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CS-231	ENST00000552222	ZNF582	Q96NG8	517 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
CS-231	ENST00000552222	INTS14	Q96SY0	518 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CS-231	ENST00000552222	VCX3B	Q9H321	246 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CS-231	ENST00000552222	H2AFY2	Q9P0M6	372 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
CS-231	ENST00000552222	LOC100509620	A0A075B734	347 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CS-231	ENST00000552222	OR6C6	A6NF89	314 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CS-231	ENST00000552222	SLC22A31	A6NKX4	558 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CS-231	ENST00000552222		H0YAE9	185 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CS-231	ENST00000552222	ZNF593	O00488	134 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
CS-231	ENST00000552222	ALX3	O95076	343 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CS-231	ENST00000552222	PNP	P00491	289 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CS-231	ENST00000552222	COX5B	P10606	129 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CS-231	ENST00000552222	MDK	P21741	143 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
CS-231	ENST00000552222	STOM	P27105	288 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CS-231	ENST00000552222	HTR1F	P30939	366 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CS-231	ENST00000552222	RPS27	P42677	84 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
CS-231	ENST00000552222	OCLN	Q16625	522 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CS-231	ENST00000552222	AVPI1	Q5T686	147 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CS-231	ENST00000552222	LCN1P1	Q5VSP4	162 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CS-231	ENST00000552222	ERI1	Q8IV48	349 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
CS-231	ENST00000552222	BCL6B	Q8N143	479 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
CS-231	ENST00000552222	BPIFB2	Q8N4F0	458 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CS-231	ENST00000552222	SLC30A7	Q8NEW0	376 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CS-231	ENST00000552222	OR6N2	Q8NGY6	317 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CS-231	ENST00000552222	OR2AJ1	Q8NGZ0	328 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CS-231	ENST00000552222	NEU4	Q8WWR8	484 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
CS-231	ENST00000552222	POM121L2	Q96KW2	1035 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CS-231	ENST00000552222	APOL4	Q9BPW4	351 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CS-231	ENST00000552222	KCNS3	Q9BQ31	491 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CS-231	ENST00000552222	ADI1	Q9BV57	179 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CS-231	ENST00000552222	SUCNR1	Q9BXA5	334 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CS-231	ENST00000552222	DYNLRB1	Q9NP97	96 aa		11.73	□□□□□ -0.53

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