RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541295.5

LMO3-225, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene LMO3, Length 3,498 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-225ENST00000541295 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
LMO3-225ENST00000541295 TEX101Q9BY14 249 aa5.56□□□□□ -1.52
LMO3-225ENST00000541295 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
LMO3-225ENST00000541295 ZBP1Q9H171 429 aa5.56□□□□□ -1.52
LMO3-225ENST00000541295 TLNRD1Q9H1K6 362 aa5.56□□□□□ -1.52
LMO3-225ENST00000541295 CWH43Q9H720 699 aa5.56□□□□□ -1.52
LMO3-225ENST00000541295 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP5.56□□□□□ -1.52
LMO3-225ENST00000541295 PACSIN3Q9UKS6 424 aa5.56□□□□□ -1.52
LMO3-225ENST00000541295 PSG8Q9UQ74 426 aa5.56□□□□□ -1.52
LMO3-225ENST00000541295 PTPRDP23468 1912 aa5.56□□□□□ -1.52
LMO3-225ENST00000541295 MICAL3Q7RTP6 2002 aa5.56□□□□□ -1.52
LMO3-225ENST00000541295 CEP290O15078 2479 aa5.56□□□□□ -1.52
LMO3-225ENST00000541295 A8MVM7 634 aa5.55□□□□□ -1.52
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LMO3-225ENST00000541295 RHOCP08134 193 aa5.55□□□□□ -1.52
LMO3-225ENST00000541295 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
LMO3-225ENST00000541295 TYRP14679 529 aa5.55□□□□□ -1.52
LMO3-225ENST00000541295 FUT3P21217 361 aa5.55□□□□□ -1.52
LMO3-225ENST00000541295 KITLGP21583 273 aa5.55□□□□□ -1.52
LMO3-225ENST00000541295 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
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LMO3-225ENST00000541295 WDR5P61964 334 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
LMO3-225ENST00000541295 UBA52P62987 128 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
LMO3-225ENST00000541295 FUT7Q11130 342 aa5.55□□□□□ -1.52
LMO3-225ENST00000541295 CRMP1Q14194 572 aa5.55□□□□□ -1.52
LMO3-225ENST00000541295 NSDHLQ15738 373 aa5.55□□□□□ -1.52
LMO3-225ENST00000541295 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa5.55□□□□□ -1.52
LMO3-225ENST00000541295 MS4A13Q5J8X5 152 aa5.55□□□□□ -1.52
LMO3-225ENST00000541295 TMEM123Q8N131 208 aa5.55□□□□□ -1.52
LMO3-225ENST00000541295 OR1N2Q8NGR9 330 aa5.55□□□□□ -1.52
LMO3-225ENST00000541295 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
LMO3-225ENST00000541295 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
LMO3-225ENST00000541295 LYSMD1Q96S90 227 aa5.55□□□□□ -1.52
LMO3-225ENST00000541295 CDCA4Q9BXL8 241 aa5.55□□□□□ -1.52
LMO3-225ENST00000541295 ARL6Q9H0F7 186 aa5.55□□□□□ -1.52
LMO3-225ENST00000541295 OR51J1Q9H342 316 aa5.55□□□□□ -1.52
LMO3-225ENST00000541295 GSTO2Q9H4Y5 243 aa5.55□□□□□ -1.52
LMO3-225ENST00000541295 P2RX2Q9UBL9 471 aa5.55□□□□□ -1.52
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LMO3-225ENST00000541295 CDHR4A6H8M9 788 aa5.55□□□□□ -1.52
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LMO3-225ENST00000541295 TCTAP57738 103 aa5.55□□□□□ -1.52
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LMO3-225ENST00000541295 OR11H4Q8NGC9 324 aa5.55□□□□□ -1.52
LMO3-225ENST00000541295 OR1P1Q8NH06 330 aa5.55□□□□□ -1.52
LMO3-225ENST00000541295 GGHQ92820 318 aa5.55□□□□□ -1.52
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LMO3-225ENST00000541295 C20orf144Q9BQM9 153 aa5.55□□□□□ -1.52
LMO3-225ENST00000541295 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
LMO3-225ENST00000541295 SLC46A2Q9BY10 475 aa5.55□□□□□ -1.52
LMO3-225ENST00000541295 CALHM2Q9HA72 323 aa5.55□□□□□ -1.52
LMO3-225ENST00000541295 SERHLQ9NQF3 203 aa5.55□□□□□ -1.52
LMO3-225ENST00000541295 HSPB8Q9UJY1 196 aa5.55□□□□□ -1.52
LMO3-225ENST00000541295 FBXO4Q9UKT5 387 aa5.55□□□□□ -1.52
LMO3-225ENST00000541295 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa5.55□□□□□ -1.52
LMO3-225ENST00000541295 LRP12Q9Y561 859 aa5.55□□□□□ -1.52
LMO3-225ENST00000541295 HIDE1A8MVS5 230 aa5.55□□□□□ -1.52
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LMO3-225ENST00000541295 ESDP10768 282 aa5.55□□□□□ -1.52
LMO3-225ENST00000541295 SRD5A2P31213 254 aa5.55□□□□□ -1.52
LMO3-225ENST00000541295 CD68P34810 354 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
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LMO3-225ENST00000541295 SH3BP2P78314 561 aa5.55□□□□□ -1.52
LMO3-225ENST00000541295 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
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LMO3-225ENST00000541295 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa5.55□□□□□ -1.52
LMO3-225ENST00000541295 DCAF12L2Q5VW00 463 aa5.55□□□□□ -1.52
LMO3-225ENST00000541295 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
LMO3-225ENST00000541295 TMEM198Q66K66 360 aa5.55□□□□□ -1.52
LMO3-225ENST00000541295 OR10K2Q6IF99 312 aa5.55□□□□□ -1.52
LMO3-225ENST00000541295 CD300LDQ6UXZ3 194 aa5.55□□□□□ -1.52
LMO3-225ENST00000541295 FAM219AQ8IW50 185 aa5.55□□□□□ -1.52
LMO3-225ENST00000541295 HIST3H2BBQ8N257 126 aa5.55□□□□□ -1.52
LMO3-225ENST00000541295 SLC5A8Q8N695 610 aa5.55□□□□□ -1.52
LMO3-225ENST00000541295 OR1L4Q8NGR5 311 aa5.55□□□□□ -1.52
LMO3-225ENST00000541295 UCN3Q969E3 161 aa5.55□□□□□ -1.52
LMO3-225ENST00000541295 RGMAQ96B86 450 aa5.55□□□□□ -1.52
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