RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534160.1

GMDS-AS1-212, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene GMDS-AS1, Length 720 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDS-AS1-212ENST00000534160 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
GMDS-AS1-212ENST00000534160 ABCB10Q9NRK6 738 aa5.11□□□□□ -1.59
GMDS-AS1-212ENST00000534160 SPATA7Q9P0W8 599 aa5.11□□□□□ -1.59
GMDS-AS1-212ENST00000534160 TAC3Q9UHF0 121 aa5.11□□□□□ -1.59
GMDS-AS1-212ENST00000534160 OR51F1A6NGY5 319 aa5.1□□□□□ -1.59
GMDS-AS1-212ENST00000534160 DHRS7CA6NNS2 312 aa5.1□□□□□ -1.59
GMDS-AS1-212ENST00000534160 IQCF5A8MTL0 148 aa5.1□□□□□ -1.59
GMDS-AS1-212ENST00000534160 OR1I1O60431 355 aa5.1□□□□□ -1.59
GMDS-AS1-212ENST00000534160 STX11O75558 287 aa5.1□□□□□ -1.59
GMDS-AS1-212ENST00000534160 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
GMDS-AS1-212ENST00000534160 IGHV3-23P01764 117 aa5.1□□□□□ -1.59
GMDS-AS1-212ENST00000534160 MSNP26038 577 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
GMDS-AS1-212ENST00000534160 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP5.1□□□□□ -1.59
GMDS-AS1-212ENST00000534160 OR3A4PP47883 348 aa5.1□□□□□ -1.59
GMDS-AS1-212ENST00000534160 MTTPP55157 894 aa5.1□□□□□ -1.59
GMDS-AS1-212ENST00000534160 RPL8P62917 257 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
GMDS-AS1-212ENST00000534160 KCNJ2P63252 427 aa5.1□□□□□ -1.59
GMDS-AS1-212ENST00000534160 KLHL30Q0D2K2 578 aa5.1□□□□□ -1.59
GMDS-AS1-212ENST00000534160 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
GMDS-AS1-212ENST00000534160 B3GNT7Q8NFL0 401 aa5.1□□□□□ -1.59
GMDS-AS1-212ENST00000534160 OR5T3Q8NGG3 340 aa5.1□□□□□ -1.59
GMDS-AS1-212ENST00000534160 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa5.1□□□□□ -1.59
GMDS-AS1-212ENST00000534160 IL1F10Q8WWZ1 152 aa5.1□□□□□ -1.59
GMDS-AS1-212ENST00000534160 LRRC45Q96CN5 670 aa5.1□□□□□ -1.59
GMDS-AS1-212ENST00000534160 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP5.1□□□□□ -1.59
GMDS-AS1-212ENST00000534160 VAT1Q99536 393 aa5.1□□□□□ -1.59
GMDS-AS1-212ENST00000534160 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
GMDS-AS1-212ENST00000534160 TBL1YQ9BQ87 522 aa5.1□□□□□ -1.59
GMDS-AS1-212ENST00000534160 SFXN3Q9BWM7 321 aa5.1□□□□□ -1.59
GMDS-AS1-212ENST00000534160 GBA3Q9H227 469 aa5.1□□□□□ -1.59
GMDS-AS1-212ENST00000534160 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP5.1□□□□□ -1.59
GMDS-AS1-212ENST00000534160 ANAPC11Q9NYG5 84 aa5.1□□□□□ -1.59
GMDS-AS1-212ENST00000534160 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP5.1□□□□□ -1.59
GMDS-AS1-212ENST00000534160 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
GMDS-AS1-212ENST00000534160 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
GMDS-AS1-212ENST00000534160 ZNF254O75437 659 aa5.09□□□□□ -1.59
GMDS-AS1-212ENST00000534160 PROSCO94903 275 aa5.09□□□□□ -1.59
GMDS-AS1-212ENST00000534160 SLC35G6P0C7Q6 338 aa5.09□□□□□ -1.59
GMDS-AS1-212ENST00000534160 CCL3P10147 92 aa5.09□□□□□ -1.59
GMDS-AS1-212ENST00000534160 HNF1AP20823 631 aa5.09□□□□□ -1.59
GMDS-AS1-212ENST00000534160 CRYGSP22914 178 aa5.09□□□□□ -1.59
GMDS-AS1-212ENST00000534160 ADRA1AP35348 466 aa5.09□□□□□ -1.59
GMDS-AS1-212ENST00000534160 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
GMDS-AS1-212ENST00000534160 SKP1P63208 163 aa5.09□□□□□ -1.59
GMDS-AS1-212ENST00000534160 BTG2P78543 158 aa5.09□□□□□ -1.59
GMDS-AS1-212ENST00000534160 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
GMDS-AS1-212ENST00000534160 RCAN2Q14206 197 aa5.09□□□□□ -1.59
GMDS-AS1-212ENST00000534160 PRPSAP1Q14558 356 aa5.09□□□□□ -1.59
GMDS-AS1-212ENST00000534160 POU6F1Q14863 301 aa5.09□□□□□ -1.59
GMDS-AS1-212ENST00000534160 PRAMEF20Q5VT98 475 aa5.09□□□□□ -1.59
GMDS-AS1-212ENST00000534160 VN1R4Q7Z5H5 301 aa5.09□□□□□ -1.59
GMDS-AS1-212ENST00000534160 CCDC50Q8IVM0 306 aa5.09□□□□□ -1.59
GMDS-AS1-212ENST00000534160 GCNT2Q8N0V5 402 aa5.09□□□□□ -1.59
GMDS-AS1-212ENST00000534160 KRT222Q8N1A0 295 aa5.09□□□□□ -1.59
GMDS-AS1-212ENST00000534160 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa5.09□□□□□ -1.59
GMDS-AS1-212ENST00000534160 OR2L5Q8NG80 312 aa5.09□□□□□ -1.59
GMDS-AS1-212ENST00000534160 HAUS1Q96CS2 278 aa5.09□□□□□ -1.59
GMDS-AS1-212ENST00000534160 SDSLQ96GA7 329 aa5.09□□□□□ -1.59
GMDS-AS1-212ENST00000534160 CYYR1Q96J86 154 aa5.09□□□□□ -1.59
GMDS-AS1-212ENST00000534160 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa5.09□□□□□ -1.59
GMDS-AS1-212ENST00000534160 SLC30A2Q9BRI3 323 aa5.09□□□□□ -1.59
GMDS-AS1-212ENST00000534160 ANGPTL4Q9BY76 406 aa5.09□□□□□ -1.59
GMDS-AS1-212ENST00000534160 NMUR2Q9GZQ4 415 aa5.09□□□□□ -1.59
GMDS-AS1-212ENST00000534160 EHD1Q9H4M9 534 aa5.09□□□□□ -1.59
GMDS-AS1-212ENST00000534160 SH2D2AQ9NP31 389 aa5.09□□□□□ -1.59
GMDS-AS1-212ENST00000534160 RDH8Q9NYR8 311 aa5.09□□□□□ -1.59
GMDS-AS1-212ENST00000534160 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
GMDS-AS1-212ENST00000534160 USF3Q68DE3 2245 aa5.09□□□□□ -1.59
GMDS-AS1-212ENST00000534160 TGP01266 2768 aa5.08□□□□□ -1.6
GMDS-AS1-212ENST00000534160 DSCAMO60469 2012 aa5.08□□□□□ -1.6
GMDS-AS1-212ENST00000534160 CHST10O43529 356 aa5.08□□□□□ -1.6
GMDS-AS1-212ENST00000534160 TCF21O43680 179 aa5.08□□□□□ -1.6
GMDS-AS1-212ENST00000534160 FOXN2P32314 431 aa5.08□□□□□ -1.6
GMDS-AS1-212ENST00000534160 ACTG1P63261 375 aa5.08□□□□□ -1.6
GMDS-AS1-212ENST00000534160 VLDLRP98155 873 aa5.08□□□□□ -1.6
GMDS-AS1-212ENST00000534160 BDH1Q02338 343 aa5.08□□□□□ -1.6
GMDS-AS1-212ENST00000534160 RELAQ04206 551 aa5.08□□□□□ -1.6
GMDS-AS1-212ENST00000534160 TMEM249Q2WGJ8 235 aa5.08□□□□□ -1.6
GMDS-AS1-212ENST00000534160 DEFB134Q4QY38 66 aa5.08□□□□□ -1.6
GMDS-AS1-212ENST00000534160 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
GMDS-AS1-212ENST00000534160 ZNF544Q6NX49 715 aa5.08□□□□□ -1.6
GMDS-AS1-212ENST00000534160 OPN5Q6U736 354 aa5.08□□□□□ -1.6
GMDS-AS1-212ENST00000534160 CYS1Q717R9 158 aa5.08□□□□□ -1.6
GMDS-AS1-212ENST00000534160 ZNF550Q7Z398 422 aa5.08□□□□□ -1.6
GMDS-AS1-212ENST00000534160 CEND1Q8N111 149 aa5.08□□□□□ -1.6
GMDS-AS1-212ENST00000534160 C3orf56Q8N813 242 aa5.08□□□□□ -1.6
GMDS-AS1-212ENST00000534160 OR5AU1Q8NGC0 362 aa5.08□□□□□ -1.6
GMDS-AS1-212ENST00000534160 OR9A1PQ8NGU1 263 aa5.08□□□□□ -1.6
GMDS-AS1-212ENST00000534160 PRAP1Q96NZ9 151 aa5.08□□□□□ -1.6
GMDS-AS1-212ENST00000534160 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP5.08□□□□□ -1.64e-6■□□□□ 9.5
GMDS-AS1-212ENST00000534160 PANX2Q96RD6 677 aa5.08□□□□□ -1.6
GMDS-AS1-212ENST00000534160 RHBGQ9H310 441 aa5.08□□□□□ -1.6
GMDS-AS1-212ENST00000534160 CALHM2Q9HA72 323 aa5.08□□□□□ -1.6
GMDS-AS1-212ENST00000534160 WIF1Q9Y5W5 379 aa5.08□□□□□ -1.6
GMDS-AS1-212ENST00000534160 MGAM2Q2M2H8 2515 aa5.08□□□□□ -1.6
GMDS-AS1-212ENST00000534160 CR1P17927 2039 aa5.07□□□□□ -1.6
GMDS-AS1-212ENST00000534160 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa5.07□□□□□ -1.6
GMDS-AS1-212ENST00000534160 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa5.07□□□□□ -1.6
GMDS-AS1-212ENST00000534160 A0A0U1RQV5 110 aa5.07□□□□□ -1.6
GMDS-AS1-212ENST00000534160 CST8O60676 142 aa5.07□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.1 ms