RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530036.1

RPUSD4-204, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 4, human

TSL 3

Gene RPUSD4, Length 566 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPUSD4-204	ENST00000530036	OR8B4	Q96RC9	309 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPUSD4-204	ENST00000530036	KCNJ15	Q99712	375 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPUSD4-204	ENST00000530036	APOL4	Q9BPW4	351 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPUSD4-204	ENST00000530036	SYT3	Q9BQG1	590 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPUSD4-204	ENST00000530036	COPS4	Q9BT78	406 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPUSD4-204	ENST00000530036	CLN6	Q9NWW5	311 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPUSD4-204	ENST00000530036	H2AFY2	Q9P0M6	372 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RPUSD4-204	ENST00000530036	EIF3K	Q9UBQ5	218 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RPUSD4-204	ENST00000530036	AASS	Q9UDR5	926 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPUSD4-204	ENST00000530036	CGGBP1	Q9UFW8	167 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RPUSD4-204	ENST00000530036	LAMP5	Q9UJQ1	280 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPUSD4-204	ENST00000530036	AKAP8L	Q9ULX6	646 aa	Known RBP eCLIP	4.85	□□□□□ -1.63
RPUSD4-204	ENST00000530036	FZR1	Q9UM11	496 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPUSD4-204	ENST00000530036	COPS3	Q9UNS2	423 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPUSD4-204	ENST00000530036	LRCH1	Q9Y2L9	728 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPUSD4-204	ENST00000530036	STARD10	Q9Y365	291 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPUSD4-204	ENST00000530036	GRIP1	Q9Y3R0	1128 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPUSD4-204	ENST00000530036	LRP12	Q9Y561	859 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPUSD4-204	ENST00000530036	TMEM14A	Q9Y6G1	99 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPUSD4-204	ENST00000530036	HSPE1-MOB4	S4R3N1	261 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPUSD4-204	ENST00000530036	PMF1-BGLAP	U3KQ54	211 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPUSD4-204	ENST00000530036	ABCA2	Q9BZC7	2435 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPUSD4-204	ENST00000530036	DNHD1	Q96M86	4753 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPUSD4-204	ENST00000530036	NSD1	Q96L73	2696 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RPUSD4-204	ENST00000530036	TLN2	Q9Y4G6	2542 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPUSD4-204	ENST00000530036	MED13L	Q71F56	2210 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPUSD4-204	ENST00000530036	YLPM1	P49750	1951 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RPUSD4-204	ENST00000530036		A0A1B0GWJ7	208 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPUSD4-204	ENST00000530036	C5orf63	A6NC05	138 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPUSD4-204	ENST00000530036	ZSCAN5B	A6NJL1	495 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPUSD4-204	ENST00000530036	SNTN	A6NMZ2	147 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPUSD4-204	ENST00000530036	PHYH	O14832	338 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPUSD4-204	ENST00000530036	NDUFS7	O75251	213 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPUSD4-204	ENST00000530036	ZNF254	O75437	659 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPUSD4-204	ENST00000530036	SRSF10	O75494	262 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RPUSD4-204	ENST00000530036	APOL3	O95236	402 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPUSD4-204	ENST00000530036	CLIC3	O95833	236 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPUSD4-204	ENST00000530036	IGHA1	P01876	353 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPUSD4-204	ENST00000530036	APOC1	P02654	83 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPUSD4-204	ENST00000530036	ADH4	P08319	380 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPUSD4-204	ENST00000530036	GNAO1	P09471	354 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPUSD4-204	ENST00000530036	H2BFM	P0C1H6	154 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPUSD4-204	ENST00000530036	BMP4	P12644	408 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPUSD4-204	ENST00000530036	RAC2	P15153	192 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPUSD4-204	ENST00000530036	KITLG	P21583	273 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPUSD4-204	ENST00000530036	HSD11B1	P28845	292 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPUSD4-204	ENST00000530036	GCH1	P30793	250 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPUSD4-204	ENST00000530036	DCTD	P32321	178 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPUSD4-204	ENST00000530036	SLC6A9	P48067	706 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPUSD4-204	ENST00000530036	CX3CR1	P49238	355 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPUSD4-204	ENST00000530036	PRKX	P51817	358 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPUSD4-204	ENST00000530036	HCCS	P53701	268 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPUSD4-204	ENST00000530036	ATP5J2	P56134	94 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPUSD4-204	ENST00000530036	CXCR4	P61073	352 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPUSD4-204	ENST00000530036	ACTC1	P68032	377 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPUSD4-204	ENST00000530036	ACTA1	P68133	377 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPUSD4-204	ENST00000530036	IL5RA	Q01344	420 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPUSD4-204	ENST00000530036	PSG7	Q13046	419 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPUSD4-204	ENST00000530036	GK2	Q14410	553 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RPUSD4-204	ENST00000530036	SNAI3	Q3KNW1	292 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPUSD4-204	ENST00000530036	ALKBH6	Q3KRA9	238 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPUSD4-204	ENST00000530036	ZNF684	Q5T5D7	378 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPUSD4-204	ENST00000530036	ZNF322	Q6U7Q0	402 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RPUSD4-204	ENST00000530036	PRSS57	Q6UWY2	283 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPUSD4-204	ENST00000530036	LRRN1	Q6UXK5	716 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPUSD4-204	ENST00000530036	SPNS3	Q6ZMD2	512 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPUSD4-204	ENST00000530036	SPATC1	Q76KD6	591 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPUSD4-204	ENST00000530036	SSX6	Q7RTT6	188 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPUSD4-204	ENST00000530036	THAP5	Q7Z6K1	395 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPUSD4-204	ENST00000530036	KRT77	Q7Z794	578 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPUSD4-204	ENST00000530036	ZNF679	Q8IYX0	411 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPUSD4-204	ENST00000530036	C8orf59	Q8N0T1	100 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RPUSD4-204	ENST00000530036	ZNF283	Q8N7M2	679 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPUSD4-204	ENST00000530036	OR5L1	Q8NGL2	311 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPUSD4-204	ENST00000530036	FBLIM1	Q8WUP2	373 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPUSD4-204	ENST00000530036	THEM6	Q8WUY1	208 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPUSD4-204	ENST00000530036	ASB17	Q8WXJ9	295 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPUSD4-204	ENST00000530036	SPSB4	Q96A44	273 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPUSD4-204	ENST00000530036	HAVCR1	Q96D42	359 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPUSD4-204	ENST00000530036	RNFT2	Q96EX2	444 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPUSD4-204	ENST00000530036	TRMT61A	Q96FX7	289 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RPUSD4-204	ENST00000530036	PERP	Q96FX8	193 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPUSD4-204	ENST00000530036		Q96MT0	163 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPUSD4-204	ENST00000530036	SORCS2	Q96PQ0	1159 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPUSD4-204	ENST00000530036	MS4A5	Q9H3V2	200 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPUSD4-204	ENST00000530036	OPA3	Q9H6K4	179 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPUSD4-204	ENST00000530036	NIPAL2	Q9H841	368 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPUSD4-204	ENST00000530036	BARX1	Q9HBU1	254 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RPUSD4-204	ENST00000530036	CENPM	Q9NSP4	180 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPUSD4-204	ENST00000530036	MRPS18A	Q9NVS2	196 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RPUSD4-204	ENST00000530036	SLCO1C1	Q9NYB5	712 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPUSD4-204	ENST00000530036	DUSP13	Q9UII6	198 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPUSD4-204	ENST00000530036	EXOG	Q9Y2C4	368 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RPUSD4-204	ENST00000530036	MTOR	P42345	2549 aa		4.84	□□□□□ -1.64
RPUSD4-204	ENST00000530036	DYSF	O75923	2080 aa		4.84	□□□□□ -1.64
RPUSD4-204	ENST00000530036	PRPF8	Q6P2Q9	2335 aa	Known RBP eCLIP	4.83	□□□□□ -1.64	2e-9	■■■■□ 19.6
RPUSD4-204	ENST00000530036	hCG_38984	A0A1B0GV85	526 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RPUSD4-204	ENST00000530036		A0A1W2PPW3	197 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RPUSD4-204	ENST00000530036		A0A1W2PQL4	384 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RPUSD4-204	ENST00000530036	ACOD1	A6NK06	481 aa		4.83	□□□□□ -1.64

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