RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510173.6

RBM4-208, Transcript of RNA binding motif protein 4, human

TSL 3

Gene RBM4, Length 782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM4-208	ENST00000510173	HTR5A	P47898	357 aa		12.1	□□□□□ -0.47
RBM4-208	ENST00000510173	ADARB1	P78563	741 aa	Known RBP	12.1	□□□□□ -0.47
RBM4-208	ENST00000510173	AQP6	Q13520	282 aa		12.1	□□□□□ -0.47
RBM4-208	ENST00000510173	ENDOG	Q14249	297 aa	Known RBP	12.1	□□□□□ -0.47
RBM4-208	ENST00000510173	SLC27A4	Q6P1M0	643 aa		12.1	□□□□□ -0.47
RBM4-208	ENST00000510173	RBMS3	Q6XE24	437 aa	Known RBP	12.1	□□□□□ -0.47
RBM4-208	ENST00000510173	C1orf229	Q6ZS94	237 aa	Predicted RBP	12.1	□□□□□ -0.47
RBM4-208	ENST00000510173	IGFN1	Q86VF2	1251 aa		12.1	□□□□□ -0.47
RBM4-208	ENST00000510173	KLHL36	Q8N4N3	616 aa		12.1	□□□□□ -0.47
RBM4-208	ENST00000510173	LRRC75A	Q8NAA5	344 aa		12.1	□□□□□ -0.47
RBM4-208	ENST00000510173	SGMS2	Q8NHU3	365 aa		12.1	□□□□□ -0.47
RBM4-208	ENST00000510173	HRASLS5	Q96KN8	279 aa		12.1	□□□□□ -0.47
RBM4-208	ENST00000510173	ZNF570	Q96NI8	536 aa		12.1	□□□□□ -0.47
RBM4-208	ENST00000510173	TSSK6	Q9BXA6	273 aa		12.1	□□□□□ -0.47
RBM4-208	ENST00000510173	BAIAP2	Q9UQB8	552 aa		12.1	□□□□□ -0.47
RBM4-208	ENST00000510173	GMPPB	Q9Y5P6	360 aa		12.1	□□□□□ -0.47
RBM4-208	ENST00000510173	NPTN	Q9Y639	398 aa		12.1	□□□□□ -0.47
RBM4-208	ENST00000510173	IFNL4	K9M1U5	179 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RBM4-208	ENST00000510173	SGCE	O43556	437 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RBM4-208	ENST00000510173	RGS9	O75916	674 aa	Predicted RBP	12.09	□□□□□ -0.47
RBM4-208	ENST00000510173	NGF	P01138	241 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RBM4-208	ENST00000510173	CD14	P08571	375 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RBM4-208	ENST00000510173	RGS6	P49758	472 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RBM4-208	ENST00000510173	CDC42	P60953	191 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RBM4-208	ENST00000510173	CDK5R2	Q13319	367 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RBM4-208	ENST00000510173	MED21	Q13503	144 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RBM4-208	ENST00000510173	GINS1	Q14691	196 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RBM4-208	ENST00000510173	PTGES3	Q15185	160 aa	Known RBP	12.09	□□□□□ -0.47
RBM4-208	ENST00000510173	TMEM155	Q4W5P6	130 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RBM4-208	ENST00000510173	OR2T33	Q8NG76	320 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RBM4-208	ENST00000510173	SAMD8	Q96LT4	415 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RBM4-208	ENST00000510173	PITX2	Q99697	317 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RBM4-208	ENST00000510173	IFT27	Q9BW83	186 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RBM4-208	ENST00000510173	EGLN3	Q9H6Z9	239 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RBM4-208	ENST00000510173	SLC25A19	Q9HC21	320 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RBM4-208	ENST00000510173	MSL2	Q9HCI7	577 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RBM4-208	ENST00000510173	TMEM106B	Q9NUM4	274 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RBM4-208	ENST00000510173	ATPIF1	Q9UII2	106 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RBM4-208	ENST00000510173	KLHL21	Q9UJP4	597 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RBM4-208	ENST00000510173	TEX13C	A0A0J9YWL9	993 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RBM4-208	ENST00000510173	PRSS37	A4D1T9	235 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RBM4-208	ENST00000510173	ZAR1L	A6NP61	321 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RBM4-208	ENST00000510173	DENR	O43583	198 aa	Known RBP	12.08	□□□□□ -0.48
RBM4-208	ENST00000510173	AVP	P01185	164 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RBM4-208	ENST00000510173	HMGN1	P05114	100 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RBM4-208	ENST00000510173	ADRA2C	P18825	462 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RBM4-208	ENST00000510173	KITLG	P21583	273 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RBM4-208	ENST00000510173	CPT2	P23786	658 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RBM4-208	ENST00000510173	GGT2	P36268	569 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RBM4-208	ENST00000510173	POLR2I	P36954	125 aa	Known RBP	12.08	□□□□□ -0.48
RBM4-208	ENST00000510173	LCN2	P80188	198 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RBM4-208	ENST00000510173	PSG7	Q13046	419 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RBM4-208	ENST00000510173	ARMCX4	Q5H9R4	360 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RBM4-208	ENST00000510173	SLX4IP	Q5VYV7	408 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RBM4-208	ENST00000510173	GPR139	Q6DWJ6	353 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RBM4-208	ENST00000510173	DPY19L2P2	Q6ZN68	376 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RBM4-208	ENST00000510173	ADCK1	Q86TW2	530 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RBM4-208	ENST00000510173	C8orf59	Q8N0T1	100 aa	Predicted RBP	12.08	□□□□□ -0.48
RBM4-208	ENST00000510173	MUC20	Q8N307	709 aa	Predicted RBP	12.08	□□□□□ -0.48
RBM4-208	ENST00000510173	DCLRE1C	Q96SD1	692 aa	Known RBP	12.08	□□□□□ -0.48
RBM4-208	ENST00000510173	SLC6A7	Q99884	636 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RBM4-208	ENST00000510173	ANKRD60	Q9BZ19	345 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RBM4-208	ENST00000510173	PLA2G12A	Q9BZM1	189 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RBM4-208	ENST00000510173	ZMAT3	Q9HA38	289 aa	Known RBP	12.08	□□□□□ -0.48
RBM4-208	ENST00000510173	DDX28	Q9NUL7	540 aa	Known RBP	12.08	□□□□□ -0.48
RBM4-208	ENST00000510173	IMPAD1	Q9NX62	359 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RBM4-208	ENST00000510173	PLEK2	Q9NYT0	353 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RBM4-208	ENST00000510173	IL19	Q9UHD0	177 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RBM4-208	ENST00000510173	PURG	Q9UJV8	347 aa	Known RBP	12.08	□□□□□ -0.48
RBM4-208	ENST00000510173	HSPE1-MOB4	S4R3N1	261 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RBM4-208	ENST00000510173	IDH3B	O43837	385 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RBM4-208	ENST00000510173	MPZL2	O60487	215 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RBM4-208	ENST00000510173	IGHV2-70	P01814	119 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RBM4-208	ENST00000510173	NOS3	P29474	1203 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RBM4-208	ENST00000510173	GRK5	P34947	590 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RBM4-208	ENST00000510173	LSM6	P62312	80 aa	Known RBP	12.07	□□□□□ -0.48
RBM4-208	ENST00000510173	BTG1	P62324	171 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RBM4-208	ENST00000510173	CDK5	Q00535	292 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RBM4-208	ENST00000510173	CLEC12A	Q5QGZ9	265 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RBM4-208	ENST00000510173	ZNF283	Q8N7M2	679 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RBM4-208	ENST00000510173	OR2Z1	Q8NG97	314 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RBM4-208	ENST00000510173	OR5L1	Q8NGL2	311 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RBM4-208	ENST00000510173	PLEKHA8	Q96JA3	519 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RBM4-208	ENST00000510173	GPX7	Q96SL4	187 aa	Predicted RBP	12.07	□□□□□ -0.48
RBM4-208	ENST00000510173	MRI1	Q9BV20	369 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RBM4-208	ENST00000510173	EMC7	Q9NPA0	242 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RBM4-208	ENST00000510173	PPP1R3C	Q9UQK1	317 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RBM4-208	ENST00000510173	LRCH1	Q9Y2L9	728 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RBM4-208	ENST00000510173	POLR3K	Q9Y2Y1	108 aa	Predicted RBP	12.07	□□□□□ -0.48
RBM4-208	ENST00000510173		E9PQ18	207 aa		12.06	□□□□□ -0.48
RBM4-208	ENST00000510173		H7C1C5	153 aa		12.06	□□□□□ -0.48
RBM4-208	ENST00000510173	SPRY1	O43609	319 aa	Predicted RBP	12.06	□□□□□ -0.48
RBM4-208	ENST00000510173	KHDRBS3	O75525	346 aa	Known RBP	12.06	□□□□□ -0.48
RBM4-208	ENST00000510173	FSHB	P01225	129 aa		12.06	□□□□□ -0.48
RBM4-208	ENST00000510173	IFNG	P01579	166 aa		12.06	□□□□□ -0.48
RBM4-208	ENST00000510173	SBK2	P0C263	348 aa		12.06	□□□□□ -0.48
RBM4-208	ENST00000510173	RAC2	P15153	192 aa		12.06	□□□□□ -0.48
RBM4-208	ENST00000510173	MYF6	P23409	242 aa		12.06	□□□□□ -0.48
RBM4-208	ENST00000510173	EPHA2	P29317	976 aa		12.06	□□□□□ -0.48
RBM4-208	ENST00000510173	SDHA	P31040	664 aa		12.06	□□□□□ -0.48

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