RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498284.1

PTPRK-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 524 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-215ENST00000498284 CCNB1P14635 433 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRK-215ENST00000498284 ZNF823P16415 610 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRK-215ENST00000498284 GGT1P19440 569 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRK-215ENST00000498284 HMOX2P30519 316 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRK-215ENST00000498284 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP2.65□□□□□ -1.99
PTPRK-215ENST00000498284 GBE1Q04446 702 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRK-215ENST00000498284 OR7A5Q15622 319 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRK-215ENST00000498284 PSMD5Q16401 504 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRK-215ENST00000498284 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP2.65□□□□□ -1.99
PTPRK-215ENST00000498284 ARL9Q6T311 187 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRK-215ENST00000498284 PLET1Q6UQ28 207 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRK-215ENST00000498284 FAM92BQ6ZTR7 304 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRK-215ENST00000498284 GABRG1Q8N1C3 465 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRK-215ENST00000498284 TM4SF18Q96CE8 201 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRK-215ENST00000498284 FOPNLQ96NB1 174 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRK-215ENST00000498284 OR2A5Q96R48 311 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRK-215ENST00000498284 NEUROG2Q9H2A3 272 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRK-215ENST00000498284 EXO5Q9H790 373 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRK-215ENST00000498284 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRK-215ENST00000498284 TMEM9BQ9NQ34 198 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRK-215ENST00000498284 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP2.65□□□□□ -1.99
PTPRK-215ENST00000498284 DUX4Q9UBX2 424 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRK-215ENST00000498284 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRK-215ENST00000498284 CRB1P82279 1406 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRK-215ENST00000498284 C10orf71Q711Q0 1435 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRK-215ENST00000498284 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
PTPRK-215ENST00000498284 ABCC11Q96J66 1382 aa2.64□□□□□ -1.99
PTPRK-215ENST00000498284 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa2.64□□□□□ -1.99
PTPRK-215ENST00000498284 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa2.64□□□□□ -1.99
PTPRK-215ENST00000498284 CHST1O43916 411 aa2.64□□□□□ -1.99
PTPRK-215ENST00000498284 CLDN11O75508 207 aa2.64□□□□□ -1.99
PTPRK-215ENST00000498284 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP2.64□□□□□ -1.99
PTPRK-215ENST00000498284 ANXA8P13928 327 aa2.64□□□□□ -1.99
PTPRK-215ENST00000498284 PGAM1P18669 254 aa2.64□□□□□ -1.99
PTPRK-215ENST00000498284 WARSP23381 471 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
PTPRK-215ENST00000498284 NAMPTP43490 491 aa2.64□□□□□ -1.99
PTPRK-215ENST00000498284 ATP5OP48047 213 aa2.64□□□□□ -1.99
PTPRK-215ENST00000498284 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
PTPRK-215ENST00000498284 ZNF138P52744 262 aa2.64□□□□□ -1.99
PTPRK-215ENST00000498284 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP2.64□□□□□ -1.99
PTPRK-215ENST00000498284 ARG2P78540 354 aa2.64□□□□□ -1.99
PTPRK-215ENST00000498284 SP4Q02446 784 aa2.64□□□□□ -1.99
PTPRK-215ENST00000498284 SLAQ13239 276 aa2.64□□□□□ -1.99
PTPRK-215ENST00000498284 IL18Q14116 193 aa2.64□□□□□ -1.99
PTPRK-215ENST00000498284 C16orf72Q14CZ0 275 aa2.64□□□□□ -1.99
PTPRK-215ENST00000498284 TRAM2Q15035 370 aa2.64□□□□□ -1.99
PTPRK-215ENST00000498284 ANXA8L1Q5VT79 327 aa2.64□□□□□ -1.99
PTPRK-215ENST00000498284 TMEM53Q6P2H8 277 aa2.64□□□□□ -1.99
PTPRK-215ENST00000498284 SSX9Q7RTT3 188 aa2.64□□□□□ -1.99
PTPRK-215ENST00000498284 SCD5Q86SK9 330 aa2.64□□□□□ -1.99
PTPRK-215ENST00000498284 OFCC1Q8IZS5 231 aa2.64□□□□□ -1.99
PTPRK-215ENST00000498284 PGAM4Q8N0Y7 254 aa2.64□□□□□ -1.99
PTPRK-215ENST00000498284 BBOF1Q8ND07 529 aa2.64□□□□□ -1.99
PTPRK-215ENST00000498284 OR52K2Q8NGK3 314 aa2.64□□□□□ -1.99
PTPRK-215ENST00000498284 OR5W2Q8NH69 310 aa2.64□□□□□ -1.99
PTPRK-215ENST00000498284 NUBPLQ8TB37 319 aa2.64□□□□□ -1.99
PTPRK-215ENST00000498284 LRRC29Q8WV35 223 aa2.64□□□□□ -1.99
PTPRK-215ENST00000498284 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
PTPRK-215ENST00000498284 NRGNQ92686 78 aa2.64□□□□□ -1.99
PTPRK-215ENST00000498284 CHAC1Q9BUX1 264 aa2.64□□□□□ -1.99
PTPRK-215ENST00000498284 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
PTPRK-215ENST00000498284 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP2.64□□□□□ -1.99
PTPRK-215ENST00000498284 CTSFQ9UBX1 484 aa2.64□□□□□ -1.99
PTPRK-215ENST00000498284 ZNF222Q9UK12 451 aa2.64□□□□□ -1.99
PTPRK-215ENST00000498284 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa2.64□□□□□ -1.99
PTPRK-215ENST00000498284 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
PTPRK-215ENST00000498284 NUP155O75694 1391 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRK-215ENST00000498284 CPDO75976 1380 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRK-215ENST00000498284 LY75O60449 1722 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRK-215ENST00000498284 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP2.63□□□□□ -1.99
PTPRK-215ENST00000498284 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRK-215ENST00000498284 SMKR1H3BMG3 65 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRK-215ENST00000498284 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRK-215ENST00000498284 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP2.63□□□□□ -1.99
PTPRK-215ENST00000498284 AIREO43918 545 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRK-215ENST00000498284 CCNB2O95067 398 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRK-215ENST00000498284 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP2.63□□□□□ -1.99
PTPRK-215ENST00000498284 IGKV2D-28P01615 120 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRK-215ENST00000498284 ARG1P05089 322 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRK-215ENST00000498284 BCHEP06276 602 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRK-215ENST00000498284 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP2.63□□□□□ -1.99
PTPRK-215ENST00000498284 SERPINE2P07093 398 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRK-215ENST00000498284 STOMP27105 288 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRK-215ENST00000498284 ZNF726P1Q15940 193 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRK-215ENST00000498284 UBE2SQ16763 222 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRK-215ENST00000498284 GPR107Q5VW38 600 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRK-215ENST00000498284 METTL21CQ5VZV1 264 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRK-215ENST00000498284 TMEM220Q6QAJ8 160 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRK-215ENST00000498284 C12orf54Q6X4T0 127 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRK-215ENST00000498284 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP2.63□□□□□ -1.99
PTPRK-215ENST00000498284 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP2.63□□□□□ -1.99
PTPRK-215ENST00000498284 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP2.63□□□□□ -1.99
PTPRK-215ENST00000498284 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP2.63□□□□□ -1.99
PTPRK-215ENST00000498284 OR10G2Q8NGC3 310 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRK-215ENST00000498284 ABHD3Q8WU67 409 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRK-215ENST00000498284 TMEM230Q96A57 120 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRK-215ENST00000498284 NTAN1Q96AB6 310 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRK-215ENST00000498284 C8orf44Q96CB5 159 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRK-215ENST00000498284 PDXPQ96GD0 296 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRK-215ENST00000498284 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP2.63□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.1 ms