RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492485.5

TRIOBP-211, Transcript of TRIO and F-actin binding protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TRIOBP, Length 3,948 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOBP-211ENST00000492485 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
TRIOBP-211ENST00000492485 XRCC3O43542 346 aa11.14□□□□□ -0.63
TRIOBP-211ENST00000492485 SLC34A2O95436 690 aa11.14□□□□□ -0.63
TRIOBP-211ENST00000492485 TSFMP43897 325 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
TRIOBP-211ENST00000492485 OR2B11Q5JQS5 317 aa11.14□□□□□ -0.63
TRIOBP-211ENST00000492485 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa11.14□□□□□ -0.63
TRIOBP-211ENST00000492485 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa11.14□□□□□ -0.63
TRIOBP-211ENST00000492485 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa11.14□□□□□ -0.63
TRIOBP-211ENST00000492485 HIST2H3AQ71DI3 136 aa11.14□□□□□ -0.63
TRIOBP-211ENST00000492485 OR2L13Q8N349 312 aa11.14□□□□□ -0.63
TRIOBP-211ENST00000492485 SUMF2Q8NBJ7 301 aa11.14□□□□□ -0.63
TRIOBP-211ENST00000492485 OR51H1Q8NH63 302 aa11.14□□□□□ -0.63
TRIOBP-211ENST00000492485 SLC25A38Q96DW6 304 aa11.14□□□□□ -0.63
TRIOBP-211ENST00000492485 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
TRIOBP-211ENST00000492485 PIGQQ9BRB3 760 aa11.14□□□□□ -0.63
TRIOBP-211ENST00000492485 GPR173Q9NS66 373 aa11.14□□□□□ -0.63
TRIOBP-211ENST00000492485 LRP12Q9Y561 859 aa11.14□□□□□ -0.63
TRIOBP-211ENST00000492485 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa11.13□□□□□ -0.63
TRIOBP-211ENST00000492485 RER1O15258 196 aa11.13□□□□□ -0.63
TRIOBP-211ENST00000492485 IGHA1P01876 353 aa11.13□□□□□ -0.63
TRIOBP-211ENST00000492485 CISD3P0C7P0 127 aa11.13□□□□□ -0.63
TRIOBP-211ENST00000492485 PET100P0DJ07 73 aa11.13□□□□□ -0.63
TRIOBP-211ENST00000492485 ICAM2P13598 275 aa11.13□□□□□ -0.63
TRIOBP-211ENST00000492485 IL9P15248 144 aa11.13□□□□□ -0.63
TRIOBP-211ENST00000492485 FAHP16930 419 aa11.13□□□□□ -0.63
TRIOBP-211ENST00000492485 RAB32Q13637 225 aa11.13□□□□□ -0.63
TRIOBP-211ENST00000492485 SOHLH1Q5JUK2 328 aa11.13□□□□□ -0.63
TRIOBP-211ENST00000492485 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa11.13□□□□□ -0.63
TRIOBP-211ENST00000492485 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
TRIOBP-211ENST00000492485 NPEPL1Q8NDH3 523 aa11.13□□□□□ -0.63
TRIOBP-211ENST00000492485 OR14A16Q8NHC5 309 aa11.13□□□□□ -0.63
TRIOBP-211ENST00000492485 PRO1933Q9H354 126 aa11.13□□□□□ -0.63
TRIOBP-211ENST00000492485 ISYNA1Q9NPH2 558 aa11.13□□□□□ -0.63
TRIOBP-211ENST00000492485 MTFP1Q9UDX5 166 aa11.13□□□□□ -0.63
TRIOBP-211ENST00000492485 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
TRIOBP-211ENST00000492485 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa11.13□□□□□ -0.63
TRIOBP-211ENST00000492485 IGKV1D-16P01601 117 aa11.13□□□□□ -0.63
TRIOBP-211ENST00000492485 GLULP15104 373 aa11.13□□□□□ -0.63
TRIOBP-211ENST00000492485 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
TRIOBP-211ENST00000492485 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
TRIOBP-211ENST00000492485 SLC17A1Q14916 467 aa11.13□□□□□ -0.63
TRIOBP-211ENST00000492485 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
TRIOBP-211ENST00000492485 ETV3LQ6ZN32 361 aa11.13□□□□□ -0.63
TRIOBP-211ENST00000492485 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
TRIOBP-211ENST00000492485 BVESQ8NE79 360 aa11.13□□□□□ -0.63
TRIOBP-211ENST00000492485 MRGPRX1Q96LB2 322 aa11.13□□□□□ -0.63
TRIOBP-211ENST00000492485 ZNF681Q96N22 645 aa11.13□□□□□ -0.63
TRIOBP-211ENST00000492485 SCGB3A2Q96PL1 93 aa11.13□□□□□ -0.63
TRIOBP-211ENST00000492485 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa11.13□□□□□ -0.63
TRIOBP-211ENST00000492485 FGF21Q9NSA1 209 aa11.13□□□□□ -0.63
TRIOBP-211ENST00000492485 DKKL1Q9UK85 242 aa11.13□□□□□ -0.63
TRIOBP-211ENST00000492485 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
TRIOBP-211ENST00000492485 LILRB5O75023 590 aa11.13□□□□□ -0.63
TRIOBP-211ENST00000492485 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
TRIOBP-211ENST00000492485 ZP3P21754 424 aa11.13□□□□□ -0.63
TRIOBP-211ENST00000492485 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP11.13□□□□□ -0.63
TRIOBP-211ENST00000492485 SLC37A1P57057 533 aa11.13□□□□□ -0.63
TRIOBP-211ENST00000492485 ZXDAP98168 799 aa11.13□□□□□ -0.63
TRIOBP-211ENST00000492485 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
TRIOBP-211ENST00000492485 OR51F2Q8NH61 342 aa11.13□□□□□ -0.63
TRIOBP-211ENST00000492485 BORCS8Q96FH0 119 aa11.13□□□□□ -0.63
TRIOBP-211ENST00000492485 ZDHHC12Q96GR4 267 aa11.13□□□□□ -0.63
TRIOBP-211ENST00000492485 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
TRIOBP-211ENST00000492485 GLS2Q9UI32 602 aa11.13□□□□□ -0.63
TRIOBP-211ENST00000492485 CD207Q9UJ71 328 aa11.13□□□□□ -0.63
TRIOBP-211ENST00000492485 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
TRIOBP-211ENST00000492485 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa11.13□□□□□ -0.63
TRIOBP-211ENST00000492485 SPINT1O43278 529 aa11.12□□□□□ -0.63
TRIOBP-211ENST00000492485 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
TRIOBP-211ENST00000492485 MOSPD3O75425 235 aa11.12□□□□□ -0.63
TRIOBP-211ENST00000492485 NAT2P11245 290 aa11.12□□□□□ -0.63
TRIOBP-211ENST00000492485 ADRA2CP18825 462 aa11.12□□□□□ -0.63
TRIOBP-211ENST00000492485 FCGR2CP31995 323 aa11.12□□□□□ -0.63
TRIOBP-211ENST00000492485 RRADP55042 308 aa11.12□□□□□ -0.63
TRIOBP-211ENST00000492485 UBE2KP61086 200 aa11.12□□□□□ -0.63
TRIOBP-211ENST00000492485 ZNF626Q68DY1 528 aa11.12□□□□□ -0.63
TRIOBP-211ENST00000492485 ADGRG3Q86Y34 549 aa11.12□□□□□ -0.63
TRIOBP-211ENST00000492485 MCEMP1Q8IX19 187 aa11.12□□□□□ -0.63
TRIOBP-211ENST00000492485 SYS1Q8N2H4 156 aa11.12□□□□□ -0.63
TRIOBP-211ENST00000492485 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa11.12□□□□□ -0.63
TRIOBP-211ENST00000492485 PGLYRP3Q96LB9 341 aa11.12□□□□□ -0.63
TRIOBP-211ENST00000492485 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
TRIOBP-211ENST00000492485 NICN1Q9BSH3 213 aa11.12□□□□□ -0.63
TRIOBP-211ENST00000492485 RHOFQ9HBH0 211 aa11.12□□□□□ -0.63
TRIOBP-211ENST00000492485 ZNF304Q9HCX3 659 aa11.12□□□□□ -0.63
TRIOBP-211ENST00000492485 MMP25Q9NPA2 562 aa11.12□□□□□ -0.63
TRIOBP-211ENST00000492485 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
TRIOBP-211ENST00000492485 ANKRD36A6QL64 1941 aa11.12□□□□□ -0.63
TRIOBP-211ENST00000492485 HLA-HP01893 362 aa11.12□□□□□ -0.63
TRIOBP-211ENST00000492485 SPP1P10451 314 aa11.12□□□□□ -0.63
TRIOBP-211ENST00000492485 FASLGP48023 281 aa11.12□□□□□ -0.63
TRIOBP-211ENST00000492485 RHEBQ15382 184 aa11.12□□□□□ -0.63
TRIOBP-211ENST00000492485 ACTBL2Q562R1 376 aa11.12□□□□□ -0.63
TRIOBP-211ENST00000492485 ZNF695Q8IW36 515 aa11.12□□□□□ -0.63
TRIOBP-211ENST00000492485 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
TRIOBP-211ENST00000492485 HDAC8Q9BY41 377 aa11.12□□□□□ -0.63
TRIOBP-211ENST00000492485 AICDAQ9GZX7 198 aa11.12□□□□□ -0.63
TRIOBP-211ENST00000492485 C1orf198Q9H425 327 aa11.12□□□□□ -0.63
TRIOBP-211ENST00000492485 MYO16Q9Y6X6 1858 aa11.12□□□□□ -0.63
TRIOBP-211ENST00000492485 A0A087WUJ7 227 aa11.12□□□□□ -0.63
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