RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487565.5

GARNL3-218, Transcript of GTPase activating Rap/RanGAP domain like 3, humanhuman

TSL 4

Gene GARNL3, Length 554 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3-218ENST00000487565 ST7LQ8TDW4 575 aa6.66□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 THEM6Q8WUY1 208 aa6.66□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 RNF133Q8WVZ7 376 aa6.66□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 MUCL1Q96DR8 90 aa6.66□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 FBXO17Q96EF6 278 aa6.66□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 BOD1Q96IK1 185 aa6.66□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 OR8B4Q96RC9 309 aa6.66□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 AMELYQ99218 206 aa6.66□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 ATF6BQ99941 703 aa6.66□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 CDCA4Q9BXL8 241 aa6.66□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 OR10A4Q9H209 315 aa6.66□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 NOX3Q9HBY0 568 aa6.66□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 CENPMQ9NSP4 180 aa6.66□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 ATPIF1Q9UII2 106 aa6.66□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 GNG8Q9UK08 70 aa6.66□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 ERGIC3Q9Y282 383 aa6.66□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa6.66□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 TMEM129A0AVI4 362 aa6.65□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 MAGEA13PA6NCF6 341 aa6.65□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 OR6C6A6NF89 314 aa6.65□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 PRR32B1ATL7 298 aa6.65□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 J3QKU1 62 aa6.65□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 MT-ND5P03915 603 aa6.65□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 RPSAP08865 295 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 LIMS3P0CW19 117 aa6.65□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 LIMS4P0CW20 117 aa6.65□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 SMIM18P0DKX4 95 aa6.65□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 ATP6V1B1P15313 513 aa6.65□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 APLNRP35414 380 aa6.65□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 OPRL1P41146 370 aa6.65□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 ETV1P50549 477 aa6.65□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 RIDAP52758 137 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 RAB1AP62820 205 aa6.65□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 GRB2P62993 217 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 HIST1H3AP68431 136 aa6.65□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 PSG4Q00888 419 aa6.65□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 ROM1Q03395 351 aa6.65□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 ECH1Q13011 328 aa6.65□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 GALEQ14376 348 aa6.65□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 IRF3Q14653 427 aa6.65□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 PPA1Q15181 289 aa6.65□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 CDONQ4KMG0 1287 aa6.65□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 TP53I3Q53FA7 332 aa6.65□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa6.65□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 RNLSQ5VYX0 342 aa6.65□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 LRRN1Q6UXK5 716 aa6.65□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa6.65□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 HIST2H3AQ71DI3 136 aa6.65□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 ZNF367Q7RTV3 350 aa6.65□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 LHFPL3Q86UP9 236 aa6.65□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 SYS1Q8N2H4 156 aa6.65□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 YIPF7Q8N8F6 280 aa6.65□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 WDR31Q8NA23 367 aa6.65□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 OR1F12Q8NHA8 337 aa6.65□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 AKR7LQ8NHP1 331 aa6.65□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 FGFBP3Q8TAT2 258 aa6.65□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 FCGR1BQ92637 280 aa6.65□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 SPTSSAQ969W0 71 aa6.65□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 C4orf36Q96KX1 117 aa6.65□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 SIGLEC11Q96RL6 698 aa6.65□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 COQ7Q99807 217 aa6.65□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 MED18Q9BUE0 208 aa6.65□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 MROQ9BYG7 248 aa6.65□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa6.65□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 WNT5BQ9H1J7 359 aa6.65□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 TRIM36Q9NQ86 728 aa6.65□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 ACOXLQ9NUZ1 547 aa6.65□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa6.65□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 ZNF224Q9NZL3 707 aa6.65□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa6.65□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 LRP12Q9Y561 859 aa6.65□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 SLC25A15Q9Y619 301 aa6.65□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 ESPL1Q14674 2120 aa6.65□□□□□ -1.35
GARNL3-218ENST00000487565 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
GARNL3-218ENST00000487565 TRIM64A6NGJ6 449 aa6.64□□□□□ -1.35
GARNL3-218ENST00000487565 C9orf118A6NHY6 69 aa6.64□□□□□ -1.35
GARNL3-218ENST00000487565 METTL15A6NJ78 407 aa6.64□□□□□ -1.35
GARNL3-218ENST00000487565 J3QLW9 94 aa6.64□□□□□ -1.35
GARNL3-218ENST00000487565 PSMD9O00233 223 aa6.64□□□□□ -1.35
GARNL3-218ENST00000487565 SYNGR3O43761 229 aa6.64□□□□□ -1.35
GARNL3-218ENST00000487565 ZNF254O75437 659 aa6.64□□□□□ -1.35
GARNL3-218ENST00000487565 SULT1C4O75897 302 aa6.64□□□□□ -1.35
GARNL3-218ENST00000487565 ABHD16AO95870 558 aa6.64□□□□□ -1.35
GARNL3-218ENST00000487565 PTHP01270 115 aa6.64□□□□□ -1.35
GARNL3-218ENST00000487565 ADRA2AP08913 450 aa6.64□□□□□ -1.35
GARNL3-218ENST00000487565 COX5BP10606 129 aa6.64□□□□□ -1.35
GARNL3-218ENST00000487565 CBR1P16152 277 aa6.64□□□□□ -1.35
GARNL3-218ENST00000487565 ZNF19P17023 458 aa6.64□□□□□ -1.35
GARNL3-218ENST00000487565 PAX7P23759 505 aa6.64□□□□□ -1.35
GARNL3-218ENST00000487565 PSMB9P28065 219 aa6.64□□□□□ -1.35
GARNL3-218ENST00000487565 MAP2K4P45985 399 aa6.64□□□□□ -1.35
GARNL3-218ENST00000487565 SLC6A9P48067 706 aa6.64□□□□□ -1.35
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