RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463041.1

PTPRF-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRF, Length 298 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-210ENST00000463041 MEGF10Q96KG7 1140 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRF-210ENST00000463041 SIGLEC11Q96RL6 698 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRF-210ENST00000463041 BTBD10Q9BSF8 475 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRF-210ENST00000463041 SUCNR1Q9BXA5 334 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRF-210ENST00000463041 TSSK6Q9BXA6 273 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRF-210ENST00000463041 DGCR6LQ9BY27 220 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRF-210ENST00000463041 SLC22A4Q9H015 551 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRF-210ENST00000463041 C1orf21Q9H246 121 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRF-210ENST00000463041 EGLN3Q9H6Z9 239 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRF-210ENST00000463041 REEP1Q9H902 201 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRF-210ENST00000463041 TMEM165Q9HC07 324 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRF-210ENST00000463041 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
PTPRF-210ENST00000463041 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
PTPRF-210ENST00000463041 DCAF16Q9NXF7 216 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRF-210ENST00000463041 OPN4Q9UHM6 478 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRF-210ENST00000463041 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
PTPRF-210ENST00000463041 F5H0A9 414 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
PTPRF-210ENST00000463041 H0YL77 283 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRF-210ENST00000463041 TRAPPC2LH3BP13 241 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRF-210ENST00000463041 TRIM77I1YAP6 450 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRF-210ENST00000463041 M0R135 149 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRF-210ENST00000463041 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
PTPRF-210ENST00000463041 MLNRO43193 412 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRF-210ENST00000463041 GMDSO60547 372 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRF-210ENST00000463041 IFNGP01579 166 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRF-210ENST00000463041 RAP2AP10114 183 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRF-210ENST00000463041 IRF2P14316 349 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRF-210ENST00000463041 ZNF12P17014 697 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRF-210ENST00000463041 ADRA2CP18825 462 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRF-210ENST00000463041 ATP6V1B2P21281 511 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRF-210ENST00000463041 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
PTPRF-210ENST00000463041 PYCR1P32322 319 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRF-210ENST00000463041 GATA4P43694 442 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRF-210ENST00000463041 ERFP50548 548 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRF-210ENST00000463041 HILS1P60008 231 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRF-210ENST00000463041 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
PTPRF-210ENST00000463041 ZMYND11Q15326 602 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRF-210ENST00000463041 ESCO2Q56NI9 601 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRF-210ENST00000463041 DRAM2Q6UX65 266 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRF-210ENST00000463041 CYB561A3Q8NBI2 242 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRF-210ENST00000463041 AQP11Q8NBQ7 271 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRF-210ENST00000463041 PLPP7Q8NBV4 271 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRF-210ENST00000463041 SLC37A3Q8NCC5 494 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRF-210ENST00000463041 PROKR2Q8NFJ6 384 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRF-210ENST00000463041 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRF-210ENST00000463041 OR2T33Q8NG76 320 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRF-210ENST00000463041 FAM216AQ8WUB2 273 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRF-210ENST00000463041 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
PTPRF-210ENST00000463041 ASB9Q96DX5 294 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRF-210ENST00000463041 ZNF799Q96GE5 643 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRF-210ENST00000463041 PLEKHA8Q96JA3 519 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRF-210ENST00000463041 MAP6Q96JE9 813 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRF-210ENST00000463041 LRGUKQ96M69 825 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRF-210ENST00000463041 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
PTPRF-210ENST00000463041 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRF-210ENST00000463041 FN3KQ9H479 309 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRF-210ENST00000463041 SP140LQ9H930 580 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRF-210ENST00000463041 WDR76Q9H967 626 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRF-210ENST00000463041 NTN4Q9HB63 628 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRF-210ENST00000463041 MMP26Q9NRE1 261 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRF-210ENST00000463041 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
PTPRF-210ENST00000463041 TAS2R1Q9NYW7 299 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRF-210ENST00000463041 MIOXQ9UGB7 285 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRF-210ENST00000463041 TENM1Q9UKZ4 2725 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRF-210ENST00000463041 LRCH1Q9Y2L9 728 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRF-210ENST00000463041 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
PTPRF-210ENST00000463041 INSIG2Q9Y5U4 225 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRF-210ENST00000463041 AUP1Q9Y679 476 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRF-210ENST00000463041 TVP23AA6NH52 213 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRF-210ENST00000463041 CD300LBA8K4G0 201 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRF-210ENST00000463041 CEACAM18A8MTB9 384 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRF-210ENST00000463041 A8MXK9 166 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRF-210ENST00000463041 F5H5P2 479 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRF-210ENST00000463041 ACOT8O14734 319 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRF-210ENST00000463041 CST1P01037 141 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRF-210ENST00000463041 FSHBP01225 129 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRF-210ENST00000463041 APOC1P02654 83 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRF-210ENST00000463041 HLA-DPB1P04440 258 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRF-210ENST00000463041 PPIAL4GP0DN37 164 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRF-210ENST00000463041 SPI1P17947 270 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRF-210ENST00000463041 DDOSTP39656 456 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRF-210ENST00000463041 PMELP40967 661 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRF-210ENST00000463041 CD200P41217 278 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRF-210ENST00000463041 SLC15A1P46059 708 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRF-210ENST00000463041 ENTPD1P49961 510 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRF-210ENST00000463041 MMP16P51512 607 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRF-210ENST00000463041 RAD23AP54725 363 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRF-210ENST00000463041 PAX8Q06710 450 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRF-210ENST00000463041 MZT1Q08AG7 82 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRF-210ENST00000463041 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
PTPRF-210ENST00000463041 ZNF154Q13106 437 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRF-210ENST00000463041 MAB21L1Q13394 359 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRF-210ENST00000463041 TAF13Q15543 124 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRF-210ENST00000463041 OR8G1Q15617 311 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRF-210ENST00000463041 C12orf54Q6X4T0 127 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRF-210ENST00000463041 RHOUQ7L0Q8 258 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRF-210ENST00000463041 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
PTPRF-210ENST00000463041 DCXRQ7Z4W1 244 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRF-210ENST00000463041 MOGAT3Q86VF5 341 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRF-210ENST00000463041 KLBQ86Z14 1044 aa6.11□□□□□ -1.43
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