RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379615.3

PGGT1B-202, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 903 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-202ENST00000379615 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa13.16□□□□□ -0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 PTTG3PQ9NZH4 202 aa13.16□□□□□ -0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa13.16□□□□□ -0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP13.16□□□□□ -0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa13.15□□□□□ -0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 H0YHG0 523 aa13.15□□□□□ -0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 NDUFS8O00217 210 aa13.15□□□□□ -0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 NAT2P11245 290 aa13.15□□□□□ -0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 PSKH1P11801 424 aa13.15□□□□□ -0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 DAOP14920 347 aa13.15□□□□□ -0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 OPRL1P41146 370 aa13.15□□□□□ -0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 LRRC36Q1X8D7 754 aa13.15□□□□□ -0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 ALKBH6Q3KRA9 238 aa13.15□□□□□ -0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 KRT77Q7Z794 578 aa13.15□□□□□ -0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 GALNT4Q8N4A0 578 aa13.15□□□□□ -0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF540Q8NDQ6 660 aa13.15□□□□□ -0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 OR52H1Q8NGJ2 320 aa13.15□□□□□ -0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 UBASH3BQ8TF42 649 aa13.15□□□□□ -0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 Q96MT0 163 aa13.15□□□□□ -0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 MBOAT4Q96T53 435 aa13.15□□□□□ -0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 APOL4Q9BPW4 351 aa13.15□□□□□ -0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 TMUB1Q9BVT8 246 aa13.15□□□□□ -0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 MROQ9BYG7 248 aa13.15□□□□□ -0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 TPK1Q9H3S4 243 aa13.15□□□□□ -0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 OPA3Q9H6K4 179 aa13.15□□□□□ -0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 DECR2Q9NUI1 292 aa13.15□□□□□ -0.3
PGGT1B-202ENST00000379615 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa13.14□□□□□ -0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa13.14□□□□□ -0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa13.14□□□□□ -0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 SLC16A6O15403 523 aa13.14□□□□□ -0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF254O75437 659 aa13.14□□□□□ -0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 SLC25A16P16260 332 aa13.14□□□□□ -0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 TNFSF4P23510 183 aa13.14□□□□□ -0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 CX3CR1P49238 355 aa13.14□□□□□ -0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 MMP15P51511 669 aa13.14□□□□□ -0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 TNK1Q13470 666 aa13.14□□□□□ -0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 CARTPTQ16568 116 aa13.14□□□□□ -0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 OCLNQ16625 522 aa13.14□□□□□ -0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 DNM1P46Q6ZS02 220 aa13.14□□□□□ -0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 PGAP1Q75T13 922 aa13.14□□□□□ -0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 NAA40Q86UY6 237 aa13.14□□□□□ -0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 SLC35F2Q8IXU6 374 aa13.14□□□□□ -0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF525Q8N782 197 aa13.14□□□□□ -0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 EGLN1Q9GZT9 426 aa13.14□□□□□ -0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 FAM118AQ9NWS6 357 aa13.14□□□□□ -0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 CLN6Q9NWW5 311 aa13.14□□□□□ -0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa13.14□□□□□ -0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 E9PQ18 207 aa13.13□□□□□ -0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 XRCC2O43543 280 aa13.13□□□□□ -0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 SPRY3O43610 288 aa13.13□□□□□ -0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 ADH4P08319 380 aa13.13□□□□□ -0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 SBK2P0C263 348 aa13.13□□□□□ -0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 OR2T7P0C7T2 308 aa13.13□□□□□ -0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 CFL1P23528 166 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 TTC23Q5W5X9 447 aa13.13□□□□□ -0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 LPCAT4Q643R3 524 aa13.13□□□□□ -0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF786Q8N393 782 aa13.13□□□□□ -0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 OR51G2Q8NGK0 314 aa13.13□□□□□ -0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 OR2T27Q8NH04 317 aa13.13□□□□□ -0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 RDH5Q92781 318 aa13.13□□□□□ -0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 POM121Q96HA1 1249 aa13.13□□□□□ -0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 C18orf12Q96KH6 178 aa13.13□□□□□ -0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 AMELYQ99218 206 aa13.13□□□□□ -0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 PIMREGQ9BSJ6 248 aa13.13□□□□□ -0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 REG4Q9BYZ8 158 aa13.13□□□□□ -0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 OR10A2Q9H208 303 aa13.13□□□□□ -0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 POFUT1Q9H488 388 aa13.13□□□□□ -0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 ADGRL4Q9HBW9 690 aa13.13□□□□□ -0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa13.13□□□□□ -0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 TRIM64A6NGJ6 449 aa13.12□□□□□ -0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 TRIM64BA6NI03 449 aa13.12□□□□□ -0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 ACOD1A6NK06 481 aa13.12□□□□□ -0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 IQCF6A8MYZ5 107 aa13.12□□□□□ -0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 H7C1Q1 480 aa13.12□□□□□ -0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 TBX1O43435 398 aa13.12□□□□□ -0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 LY6HO94772 140 aa13.12□□□□□ -0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 PEX2P28328 305 aa13.12□□□□□ -0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 DCTDP32321 178 aa13.12□□□□□ -0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 MTNR1AP48039 350 aa13.12□□□□□ -0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 HCCSP53701 268 aa13.12□□□□□ -0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 CCL8P80075 99 aa13.12□□□□□ -0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 ROM1Q03395 351 aa13.12□□□□□ -0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 SLC34A1Q06495 639 aa13.12□□□□□ -0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 CDK5R2Q13319 367 aa13.12□□□□□ -0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 OR2T2Q6IF00 324 aa13.12□□□□□ -0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 LRRN1Q6UXK5 716 aa13.12□□□□□ -0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 USP51Q70EK9 711 aa13.12□□□□□ -0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF679Q8IYX0 411 aa13.12□□□□□ -0.31
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