RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331222.5

CLN8-201, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLN8, Length 7,169 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-201ENST00000331222 YKT6O15498 198 aa9.61□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 SOD1P00441 154 aa9.61□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 PRSS12P56730 875 aa9.61□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 ZNF90Q03938 601 aa9.61□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 CD300LGQ6UXG3 332 aa9.61□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 GABRG1Q8N1C3 465 aa9.61□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 ZNF318Q5VUA4 2279 aa9.61□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 FIGNL2A6NMB9 653 aa9.61□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 CD14P08571 375 aa9.61□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 PPP2CBP62714 309 aa9.61□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 PPP2CAP67775 309 aa9.61□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 Q499Y3 187 aa9.61□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 KCNE4Q8WWG9 221 aa9.61□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 COMMD5Q9GZQ3 224 aa9.61□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa9.61□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 NQO2P16083 231 aa9.61□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 CNR1P21554 472 aa9.61□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 ARR3P36575 388 aa9.61□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 WFDC3Q8IUB2 231 aa9.61□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 C17orf78Q8N4C9 275 aa9.61□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 OR6S1Q8NH40 331 aa9.61□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 FIZ1Q96SL8 496 aa9.61□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 MMACHCQ9Y4U1 282 aa9.61□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 OR2M5A3KFT3 312 aa9.6□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 OR6C68A6NDL8 312 aa9.6□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 C3orf80F5H4A9 247 aa9.6□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 M0R135 149 aa9.6□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 CDK2AP1O14519 115 aa9.6□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 PAPLNO95428 1278 aa9.6□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 MPGP29372 298 aa9.6□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 HOXC13P31276 330 aa9.6□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 SLC6A12P48065 614 aa9.6□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 AMTP48728 403 aa9.6□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 ZNF266Q14584 549 aa9.6□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 TOR2AQ5JU69 321 aa9.6□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 GRINAQ7Z429 371 aa9.6□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 OR11G2Q8NGC1 345 aa9.6□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 OR2AE1Q8NHA4 323 aa9.6□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 ZNF799Q96GE5 643 aa9.6□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 GPR171O14626 319 aa9.6□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 SLC25A4P12235 298 aa9.6□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 NPPBP16860 134 aa9.6□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa9.6□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 OLIG1Q8TAK6 271 aa9.6□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 CTDSP1Q9GZU7 261 aa9.6□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 LRP6O75581 1613 aa9.6□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 C4AP0C0L4 1744 aa9.6□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 TFF2Q03403 129 aa9.6□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 PLK5Q496M5 336 aa9.6□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 TUSC5Q8IXB3 177 aa9.6□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 OR2M2Q96R28 347 aa9.6□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa9.6□□□□□ -0.87
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CLN8-201ENST00000331222 AKR1C3P42330 323 aa9.6□□□□□ -0.87
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CLN8-201ENST00000331222 FCRL1Q96LA6 429 aa9.6□□□□□ -0.87
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CLN8-201ENST00000331222 RNFT1Q5M7Z0 435 aa9.6□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 PXDC1Q5TGL8 231 aa9.6□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 TRNP1Q6NT89 227 aa9.6□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 PAQR9Q6ZVX9 377 aa9.6□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 C20orf196Q8IYI0 205 aa9.6□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa9.6□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 ARRDC2Q8TBH0 407 aa9.6□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa9.6□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa9.6□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 A0A1W2PR48 441 aa9.6□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 GATCO43716 136 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 HRH1P35367 487 aa9.6□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 OPRK1P41145 380 aa9.6□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 METRNLQ641Q3 311 aa9.6□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 Q6ZS52 159 aa9.6□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 SLC24A4Q8NFF2 622 aa9.6□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 OR1L4Q8NGR5 311 aa9.6□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 WBP2Q969T9 261 aa9.6□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 GNRHR2Q96P88 292 aa9.6□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 PSENENQ9NZ42 101 aa9.6□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 HS3ST2Q9Y278 367 aa9.6□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 CEPT1Q9Y6K0 416 aa9.6□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa9.59□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 FABP1P07148 127 aa9.59□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 KRTDAPP60985 99 aa9.59□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 NXNL2Q5VZ03 156 aa9.59□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 SLC35B4Q969S0 331 aa9.59□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 LTB4R2Q9NPC1 389 aa9.59□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 A4GALTQ9NPC4 353 aa9.59□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 AUP1Q9Y679 476 aa9.59□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 ZBTB42B2RXF5 422 aa9.59□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 GFYI3L273 518 aa9.59□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 LYZL6O75951 148 aa9.59□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 FCGR2CP31995 323 aa9.59□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 CASP3P42574 277 aa9.59□□□□□ -0.87
CLN8-201ENST00000331222 RPS23P62266 143 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
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