RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000273317.4

LIMD1-201, Transcript of LIM domains containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LIMD1, Length 11,331 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMD1-201ENST00000273317 NLRC3Q7RTR2 1065 aa7.28□□□□□ -1.24
LIMD1-201ENST00000273317 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa7.28□□□□□ -1.24
LIMD1-201ENST00000273317 CLRN3Q8NCR9 226 aa7.28□□□□□ -1.24
LIMD1-201ENST00000273317 FAM173AQ9BQD7 235 aa7.28□□□□□ -1.24
LIMD1-201ENST00000273317 CALHM2Q9HA72 323 aa7.28□□□□□ -1.24
LIMD1-201ENST00000273317 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa7.28□□□□□ -1.24
LIMD1-201ENST00000273317 ADAMTSL3P82987 1691 aa7.28□□□□□ -1.24
LIMD1-201ENST00000273317 TRIM77I1YAP6 450 aa7.28□□□□□ -1.24
LIMD1-201ENST00000273317 RPL12P30050 165 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
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LIMD1-201ENST00000273317 AKR1C3P42330 323 aa7.28□□□□□ -1.24
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LIMD1-201ENST00000273317 PIGTQ969N2 578 aa7.28□□□□□ -1.24
LIMD1-201ENST00000273317 ZNF727A8MUV8 499 aa7.28□□□□□ -1.24
LIMD1-201ENST00000273317 CA3P07451 260 aa7.28□□□□□ -1.24
LIMD1-201ENST00000273317 PPP1CBP62140 327 aa7.28□□□□□ -1.24
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LIMD1-201ENST00000273317 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.24
LIMD1-201ENST00000273317 SLC5A6Q9Y289 635 aa7.27□□□□□ -1.24
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LIMD1-201ENST00000273317 PDXPQ96GD0 296 aa7.27□□□□□ -1.25
LIMD1-201ENST00000273317 OR6C1Q96RD1 312 aa7.27□□□□□ -1.25
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LIMD1-201ENST00000273317 CTSLP07711 333 aa7.27□□□□□ -1.25
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LIMD1-201ENST00000273317 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa7.27□□□□□ -1.25
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LIMD1-201ENST00000273317 LYRM7Q5U5X0 104 aa7.27□□□□□ -1.25
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LIMD1-201ENST00000273317 TRIB1Q96RU8 372 aa7.27□□□□□ -1.25
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LIMD1-201ENST00000273317 LHX4Q969G2 390 aa7.27□□□□□ -1.25
LIMD1-201ENST00000273317 SPNS1Q9H2V7 528 aa7.27□□□□□ -1.25
LIMD1-201ENST00000273317 TXNIPQ9H3M7 391 aa7.27□□□□□ -1.25
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LIMD1-201ENST00000273317 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa7.27□□□□□ -1.25
LIMD1-201ENST00000273317 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
LIMD1-201ENST00000273317 GJA4P35212 333 aa7.27□□□□□ -1.25
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LIMD1-201ENST00000273317 Q8IYB0 196 aa7.27□□□□□ -1.25
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LIMD1-201ENST00000273317 SLAMF6Q96DU3 332 aa7.27□□□□□ -1.25
LIMD1-201ENST00000273317 NDUFB7P17568 137 aa7.26□□□□□ -1.25
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LIMD1-201ENST00000273317 ZPBPQ9BS86 351 aa7.26□□□□□ -1.25
LIMD1-201ENST00000273317 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
LIMD1-201ENST00000273317 MMP26Q9NRE1 261 aa7.26□□□□□ -1.25
LIMD1-201ENST00000273317 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
LIMD1-201ENST00000273317 ARPC3O15145 178 aa7.26□□□□□ -1.25
LIMD1-201ENST00000273317 HRH1P35367 487 aa7.26□□□□□ -1.25
LIMD1-201ENST00000273317 RACK1P63244 317 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
LIMD1-201ENST00000273317 EDARADDQ8WWZ3 215 aa7.26□□□□□ -1.25
LIMD1-201ENST00000273317 ARRDC3Q96B67 414 aa7.26□□□□□ -1.25
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