RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620505.1

TARDBP-222, Transcript of TAR DNA binding protein, human

TSL 5

Gene TARDBP, Length 657 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TARDBP-222	ENST00000620505	OR8G5	Q8NG78	346 aa		7.32	□□□□□ -1.24
TARDBP-222	ENST00000620505	OR13G1	Q8NGZ3	307 aa		7.32	□□□□□ -1.24
TARDBP-222	ENST00000620505	RAB40A	Q8WXH6	277 aa		7.32	□□□□□ -1.24
TARDBP-222	ENST00000620505	SLC25A28	Q96A46	364 aa		7.32	□□□□□ -1.24
TARDBP-222	ENST00000620505	RSRC1	Q96IZ7	334 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
TARDBP-222	ENST00000620505	ZNF582	Q96NG8	517 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
TARDBP-222	ENST00000620505	WAC	Q9BTA9	647 aa		7.32	□□□□□ -1.24
TARDBP-222	ENST00000620505	NDEL1	Q9GZM8	345 aa		7.32	□□□□□ -1.24
TARDBP-222	ENST00000620505	ZNF696	Q9H7X3	374 aa		7.32	□□□□□ -1.24
TARDBP-222	ENST00000620505	NMNAT1	Q9HAN9	279 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
TARDBP-222	ENST00000620505	SRA1	Q9HD15	236 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
TARDBP-222	ENST00000620505	TUBG2	Q9NRH3	451 aa		7.32	□□□□□ -1.24
TARDBP-222	ENST00000620505	UFSP2	Q9NUQ7	469 aa		7.32	□□□□□ -1.24
TARDBP-222	ENST00000620505	SIGLEC7	Q9Y286	467 aa		7.32	□□□□□ -1.24
TARDBP-222	ENST00000620505	LRCH1	Q9Y2L9	728 aa		7.32	□□□□□ -1.24
TARDBP-222	ENST00000620505	LHFPL6	Q9Y693	200 aa		7.32	□□□□□ -1.24
TARDBP-222	ENST00000620505		V9GYQ6	96 aa		7.32	□□□□□ -1.24
TARDBP-222	ENST00000620505	TRBV4-1	A0A0J9YWV2	114 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TARDBP-222	ENST00000620505	UNC119B	A6NIH7	251 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TARDBP-222	ENST00000620505	DCTN6	O00399	190 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TARDBP-222	ENST00000620505	H1F0	P07305	194 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
TARDBP-222	ENST00000620505	COX4I1	P13073	169 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TARDBP-222	ENST00000620505	FPR3	P25089	353 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TARDBP-222	ENST00000620505	SDHA	P31040	664 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TARDBP-222	ENST00000620505	OMP	P47874	163 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TARDBP-222	ENST00000620505	MTNR1A	P48039	350 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TARDBP-222	ENST00000620505	PITPNB	P48739	271 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TARDBP-222	ENST00000620505	FXYD6P3	P58550	94 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TARDBP-222	ENST00000620505	FGF12	P61328	243 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TARDBP-222	ENST00000620505	LSM6	P62312	80 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
TARDBP-222	ENST00000620505	IL13RA1	P78552	427 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TARDBP-222	ENST00000620505	GUCA2A	Q02747	115 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TARDBP-222	ENST00000620505	PAX2	Q02962	417 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TARDBP-222	ENST00000620505	SEC23B	Q15437	767 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TARDBP-222	ENST00000620505	DEFB112	Q30KQ8	113 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TARDBP-222	ENST00000620505	GPR139	Q6DWJ6	353 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TARDBP-222	ENST00000620505	LRRN1	Q6UXK5	716 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TARDBP-222	ENST00000620505	FBXW12	Q6X9E4	464 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TARDBP-222	ENST00000620505	NAA40	Q86UY6	237 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TARDBP-222	ENST00000620505	OR8B3	Q8NGG8	313 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TARDBP-222	ENST00000620505	OR5L1	Q8NGL2	311 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TARDBP-222	ENST00000620505	OR10S1	Q8NGN2	331 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TARDBP-222	ENST00000620505	OR52J3	Q8NH60	311 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TARDBP-222	ENST00000620505	SLC7A13	Q8TCU3	470 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TARDBP-222	ENST00000620505	APOBEC3D	Q96AK3	386 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
TARDBP-222	ENST00000620505	TMIGD2	Q96BF3	282 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TARDBP-222	ENST00000620505	UPRT	Q96BW1	309 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TARDBP-222	ENST00000620505	NEIL1	Q96FI4	390 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
TARDBP-222	ENST00000620505	PLEKHA8	Q96JA3	519 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TARDBP-222	ENST00000620505	COG8	Q96MW5	612 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TARDBP-222	ENST00000620505	ERMAP	Q96PL5	475 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
TARDBP-222	ENST00000620505	OR8B2	Q96RD0	313 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TARDBP-222	ENST00000620505	NUDT16L1	Q9BRJ7	211 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
TARDBP-222	ENST00000620505	CDADC1	Q9BWV3	514 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TARDBP-222	ENST00000620505	FN3K	Q9H479	309 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TARDBP-222	ENST00000620505	MARCH7	Q9H992	704 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TARDBP-222	ENST00000620505	ZMAT3	Q9HA38	289 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
TARDBP-222	ENST00000620505	NRIP3	Q9NQ35	241 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TARDBP-222	ENST00000620505	TMEM100	Q9NV29	134 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TARDBP-222	ENST00000620505	VSX1	Q9NZR4	365 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
TARDBP-222	ENST00000620505	MIOX	Q9UGB7	285 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TARDBP-222	ENST00000620505	AURKC	Q9UQB9	309 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TARDBP-222	ENST00000620505	TMEM5	Q9Y2B1	443 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TARDBP-222	ENST00000620505	ENPP4	Q9Y6X5	453 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TARDBP-222	ENST00000620505	LRRC30	A6NM36	301 aa		7.3	□□□□□ -1.24
TARDBP-222	ENST00000620505	IQCF6	A8MYZ5	107 aa		7.3	□□□□□ -1.24
TARDBP-222	ENST00000620505		F5H5K5	113 aa		7.3	□□□□□ -1.24
TARDBP-222	ENST00000620505	AHCYL1	O43865	530 aa		7.3	□□□□□ -1.24
TARDBP-222	ENST00000620505	FAM20B	O75063	409 aa		7.3	□□□□□ -1.24
TARDBP-222	ENST00000620505	PLAT	P00750	562 aa		7.3	□□□□□ -1.24
TARDBP-222	ENST00000620505	IRF2	P14316	349 aa		7.3	□□□□□ -1.24
TARDBP-222	ENST00000620505	RGS6	P49758	472 aa		7.3	□□□□□ -1.24
TARDBP-222	ENST00000620505	RPS6KA3	P51812	740 aa		7.3	□□□□□ -1.24
TARDBP-222	ENST00000620505	MAB21L1	Q13394	359 aa		7.3	□□□□□ -1.24
TARDBP-222	ENST00000620505	MPPED2	Q15777	294 aa		7.3	□□□□□ -1.24
TARDBP-222	ENST00000620505	RSPO1	Q2MKA7	263 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
TARDBP-222	ENST00000620505	ZNF404	Q494X3	552 aa		7.3	□□□□□ -1.24
TARDBP-222	ENST00000620505	SFRP4	Q6FHJ7	346 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
TARDBP-222	ENST00000620505	C16orf87	Q6PH81	154 aa		7.3	□□□□□ -1.24
TARDBP-222	ENST00000620505	CFAP77	Q6ZQR2	320 aa		7.3	□□□□□ -1.24
TARDBP-222	ENST00000620505	ARPIN	Q7Z6K5	226 aa		7.3	□□□□□ -1.24
TARDBP-222	ENST00000620505	FITM2	Q8N6M3	262 aa		7.3	□□□□□ -1.24
TARDBP-222	ENST00000620505	KIR3DL3	Q8N743	410 aa		7.3	□□□□□ -1.24
TARDBP-222	ENST00000620505	RNF148	Q8N7C7	305 aa		7.3	□□□□□ -1.24
TARDBP-222	ENST00000620505	FAM86B1	Q8N7N1	296 aa		7.3	□□□□□ -1.24
TARDBP-222	ENST00000620505	FAM156A	Q8NDB6	213 aa		7.3	□□□□□ -1.24
TARDBP-222	ENST00000620505	GJC3	Q8NFK1	279 aa		7.3	□□□□□ -1.24
TARDBP-222	ENST00000620505	OR4K13	Q8NH42	304 aa		7.3	□□□□□ -1.24
TARDBP-222	ENST00000620505	RP9	Q8TA86	221 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
TARDBP-222	ENST00000620505	SLCO4A1	Q96BD0	722 aa		7.3	□□□□□ -1.24
TARDBP-222	ENST00000620505	NMNAT3	Q96T66	252 aa		7.3	□□□□□ -1.24
TARDBP-222	ENST00000620505	PITX2	Q99697	317 aa		7.3	□□□□□ -1.24
TARDBP-222	ENST00000620505	COQ7	Q99807	217 aa		7.3	□□□□□ -1.24
TARDBP-222	ENST00000620505	KCTD14	Q9BQ13	255 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
TARDBP-222	ENST00000620505	SLC30A2	Q9BRI3	323 aa		7.3	□□□□□ -1.24
TARDBP-222	ENST00000620505	PCGF1	Q9BSM1	259 aa		7.3	□□□□□ -1.24
TARDBP-222	ENST00000620505	HCAR1	Q9BXC0	346 aa		7.3	□□□□□ -1.24
TARDBP-222	ENST00000620505	NSRP1	Q9H0G5	558 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
TARDBP-222	ENST00000620505	RASSF4	Q9H2L5	321 aa		7.3	□□□□□ -1.24
TARDBP-222	ENST00000620505	MMADHC	Q9H3L0	296 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24

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