RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592759.5

POP4-213, Transcript of POP4 homolog, ribonuclease P/MRP subunit, human

TSL 4

Gene POP4, Length 550 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
POP4-213	ENST00000592759	MAP1A	P78559	2803 aa	Predicted RBP	10.74	□□□□□ -0.69
POP4-213	ENST00000592759	IGLV3-9	A0A075B6K5	115 aa		10.74	□□□□□ -0.69
POP4-213	ENST00000592759	ZNF878	C9JN71	531 aa		10.74	□□□□□ -0.69
POP4-213	ENST00000592759		F5H5K5	113 aa		10.74	□□□□□ -0.69
POP4-213	ENST00000592759	MAGEB4	O15481	346 aa	Predicted RBP	10.74	□□□□□ -0.69
POP4-213	ENST00000592759	MPZL2	O60487	215 aa		10.74	□□□□□ -0.69
POP4-213	ENST00000592759	CLPTM1	O96005	669 aa		10.74	□□□□□ -0.69
POP4-213	ENST00000592759	LYN	P07948	512 aa		10.74	□□□□□ -0.69
POP4-213	ENST00000592759	SERPINF1	P36955	418 aa		10.74	□□□□□ -0.69
POP4-213	ENST00000592759	MTNR1A	P48039	350 aa		10.74	□□□□□ -0.69
POP4-213	ENST00000592759	PPP1CB	P62140	327 aa		10.74	□□□□□ -0.69
POP4-213	ENST00000592759	GALK2	Q01415	458 aa		10.74	□□□□□ -0.69
POP4-213	ENST00000592759	ZNF85	Q03923	595 aa		10.74	□□□□□ -0.69
POP4-213	ENST00000592759	ZNF91	Q05481	1191 aa		10.74	□□□□□ -0.69
POP4-213	ENST00000592759	IL18R1	Q13478	541 aa		10.74	□□□□□ -0.69
POP4-213	ENST00000592759	ALKBH6	Q3KRA9	238 aa		10.74	□□□□□ -0.69
POP4-213	ENST00000592759	SPATA46	Q5T0L3	261 aa		10.74	□□□□□ -0.69
POP4-213	ENST00000592759	ZNF684	Q5T5D7	378 aa		10.74	□□□□□ -0.69
POP4-213	ENST00000592759	RHOU	Q7L0Q8	258 aa		10.74	□□□□□ -0.69
POP4-213	ENST00000592759	OR1J1	Q8NGS3	322 aa		10.74	□□□□□ -0.69
POP4-213	ENST00000592759	ABHD4	Q8TB40	342 aa		10.74	□□□□□ -0.69
POP4-213	ENST00000592759	SLC25A40	Q8TBP6	338 aa		10.74	□□□□□ -0.69
POP4-213	ENST00000592759	THEM6	Q8WUY1	208 aa		10.74	□□□□□ -0.69
POP4-213	ENST00000592759	MBD6	Q96DN6	1003 aa		10.74	□□□□□ -0.69
POP4-213	ENST00000592759	LGALS12	Q96DT0	336 aa		10.74	□□□□□ -0.69
POP4-213	ENST00000592759	RNFT2	Q96EX2	444 aa		10.74	□□□□□ -0.69
POP4-213	ENST00000592759	KCNJ15	Q99712	375 aa		10.74	□□□□□ -0.69
POP4-213	ENST00000592759	APOL4	Q9BPW4	351 aa		10.74	□□□□□ -0.69
POP4-213	ENST00000592759	ZNF649	Q9BS31	505 aa		10.74	□□□□□ -0.69
POP4-213	ENST00000592759	TTTY10	Q9BZA0	68 aa		10.74	□□□□□ -0.69
POP4-213	ENST00000592759	BCL2L14	Q9BZR8	327 aa		10.74	□□□□□ -0.69
POP4-213	ENST00000592759	OR2J1	Q9GZK6	312 aa		10.74	□□□□□ -0.69
POP4-213	ENST00000592759	PLK3	Q9H4B4	646 aa		10.74	□□□□□ -0.69
POP4-213	ENST00000592759	AMBN	Q9NP70	447 aa		10.74	□□□□□ -0.69
POP4-213	ENST00000592759	CBLN4	Q9NTU7	201 aa		10.74	□□□□□ -0.69
POP4-213	ENST00000592759	MRPS18A	Q9NVS2	196 aa	Known RBP	10.74	□□□□□ -0.69
POP4-213	ENST00000592759	CLN6	Q9NWW5	311 aa		10.74	□□□□□ -0.69
POP4-213	ENST00000592759	SLCO1C1	Q9NYB5	712 aa		10.74	□□□□□ -0.69
POP4-213	ENST00000592759	ZNF319	Q9P2F9	582 aa		10.74	□□□□□ -0.69
POP4-213	ENST00000592759	EXOG	Q9Y2C4	368 aa	Known RBP	10.74	□□□□□ -0.69
POP4-213	ENST00000592759	CMAHP	Q9Y471	501 aa		10.74	□□□□□ -0.69
POP4-213	ENST00000592759	SPEF1	Q9Y4P9	236 aa		10.74	□□□□□ -0.69
POP4-213	ENST00000592759	CREBBP	Q92793	2442 aa		10.74	□□□□□ -0.69
POP4-213	ENST00000592759	ITPR3	Q14573	2671 aa		10.73	□□□□□ -0.69
POP4-213	ENST00000592759		A0A1W2PQL4	384 aa	Predicted RBP	10.73	□□□□□ -0.69
POP4-213	ENST00000592759		M0R135	149 aa		10.73	□□□□□ -0.69
POP4-213	ENST00000592759	PSMD9	O00233	223 aa		10.73	□□□□□ -0.69
POP4-213	ENST00000592759	SRSF10	O75494	262 aa	Known RBP	10.73	□□□□□ -0.69
POP4-213	ENST00000592759	ABHD16A	O95870	558 aa		10.73	□□□□□ -0.69
POP4-213	ENST00000592759	LCK	P06239	509 aa		10.73	□□□□□ -0.69
POP4-213	ENST00000592759	DBT	P11182	482 aa	Known RBP	10.73	□□□□□ -0.69
POP4-213	ENST00000592759	PAX1	P15863	534 aa		10.73	□□□□□ -0.69
POP4-213	ENST00000592759	RAD52	P43351	418 aa		10.73	□□□□□ -0.69
POP4-213	ENST00000592759	SLC15A1	P46059	708 aa		10.73	□□□□□ -0.69
POP4-213	ENST00000592759	PRKX	P51817	358 aa		10.73	□□□□□ -0.69
POP4-213	ENST00000592759	IL5RA	Q01344	420 aa		10.73	□□□□□ -0.69
POP4-213	ENST00000592759	ROM1	Q03395	351 aa		10.73	□□□□□ -0.69
POP4-213	ENST00000592759	CDK5R2	Q13319	367 aa		10.73	□□□□□ -0.69
POP4-213	ENST00000592759	SNAI3	Q3KNW1	292 aa		10.73	□□□□□ -0.69
POP4-213	ENST00000592759	RGS7BP	Q6MZT1	257 aa	Predicted RBP	10.73	□□□□□ -0.69
POP4-213	ENST00000592759	LRRN1	Q6UXK5	716 aa		10.73	□□□□□ -0.69
POP4-213	ENST00000592759	IZUMO2	Q6UXV1	221 aa		10.73	□□□□□ -0.69
POP4-213	ENST00000592759	FBXL14	Q8N1E6	418 aa		10.73	□□□□□ -0.69
POP4-213	ENST00000592759	KLF14	Q8TD94	323 aa	Predicted RBP	10.73	□□□□□ -0.69
POP4-213	ENST00000592759	NINJ1	Q92982	152 aa		10.73	□□□□□ -0.69
POP4-213	ENST00000592759	RFK	Q969G6	155 aa		10.73	□□□□□ -0.69
POP4-213	ENST00000592759	ZNF799	Q96GE5	643 aa		10.73	□□□□□ -0.69
POP4-213	ENST00000592759	OR8B4	Q96RC9	309 aa		10.73	□□□□□ -0.69
POP4-213	ENST00000592759	CCL19	Q99731	98 aa		10.73	□□□□□ -0.69
POP4-213	ENST00000592759	SYT3	Q9BQG1	590 aa		10.73	□□□□□ -0.69
POP4-213	ENST00000592759	RHNO1	Q9BSD3	238 aa		10.73	□□□□□ -0.69
POP4-213	ENST00000592759	COPS4	Q9BT78	406 aa		10.73	□□□□□ -0.69
POP4-213	ENST00000592759	ELOVL3	Q9HB03	270 aa		10.73	□□□□□ -0.69
POP4-213	ENST00000592759	ZNF701	Q9NV72	531 aa	Predicted RBP	10.73	□□□□□ -0.69
POP4-213	ENST00000592759	EIF3K	Q9UBQ5	218 aa	Known RBP	10.73	□□□□□ -0.69
POP4-213	ENST00000592759	MRM2	Q9UI43	246 aa	Known RBP	10.73	□□□□□ -0.69
POP4-213	ENST00000592759	LAMP5	Q9UJQ1	280 aa		10.73	□□□□□ -0.69
POP4-213	ENST00000592759	AKAP8L	Q9ULX6	646 aa	Known RBP eCLIP	10.73	□□□□□ -0.69
POP4-213	ENST00000592759	HSPE1-MOB4	S4R3N1	261 aa		10.73	□□□□□ -0.69
POP4-213	ENST00000592759		B9A039	149 aa		10.72	□□□□□ -0.69
POP4-213	ENST00000592759	NDUFS7	O75251	213 aa		10.72	□□□□□ -0.69
POP4-213	ENST00000592759	SLC2A1	P11166	492 aa		10.72	□□□□□ -0.69
POP4-213	ENST00000592759	CDKN1A	P38936	164 aa		10.72	□□□□□ -0.69
POP4-213	ENST00000592759	EVX1	P49640	407 aa		10.72	□□□□□ -0.69
POP4-213	ENST00000592759	TPTE	P56180	551 aa		10.72	□□□□□ -0.69
POP4-213	ENST00000592759	CXCR4	P61073	352 aa		10.72	□□□□□ -0.69
POP4-213	ENST00000592759	RPS23	P62266	143 aa	Known RBP	10.72	□□□□□ -0.69
POP4-213	ENST00000592759	GRB2	P62993	217 aa	Known RBP	10.72	□□□□□ -0.69
POP4-213	ENST00000592759	PSG7	Q13046	419 aa		10.72	□□□□□ -0.69
POP4-213	ENST00000592759	DEFB113	Q30KQ7	82 aa		10.72	□□□□□ -0.69
POP4-213	ENST00000592759	AGAP6	Q5VW22	663 aa		10.72	□□□□□ -0.69
POP4-213	ENST00000592759	MBNL2	Q5VZF2	373 aa	Known RBP	10.72	□□□□□ -0.69
POP4-213	ENST00000592759	ZNF322	Q6U7Q0	402 aa	Predicted RBP	10.72	□□□□□ -0.69
POP4-213	ENST00000592759	DRAM2	Q6UX65	266 aa		10.72	□□□□□ -0.69
POP4-213	ENST00000592759	KRTAP1-3	Q8IUG1	177 aa		10.72	□□□□□ -0.69
POP4-213	ENST00000592759	IPCEF1	Q8WWN9	437 aa	Predicted RBP	10.72	□□□□□ -0.69
POP4-213	ENST00000592759	GTF3A	Q92664	365 aa	Known RBP	10.72	□□□□□ -0.69
POP4-213	ENST00000592759	APOBEC3D	Q96AK3	386 aa	Predicted RBP	10.72	□□□□□ -0.69
POP4-213	ENST00000592759	MNT	Q99583	582 aa		10.72	□□□□□ -0.69
POP4-213	ENST00000592759	TBX5	Q99593	518 aa		10.72	□□□□□ -0.69

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