RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590608.1

ATP9B-223, Transcript of ATPase phospholipid transporting 9B (putative), human

TSL 3

Gene ATP9B, Length 594 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATP9B-223	ENST00000590608	OR51G1	Q8NGK1	321 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608	NDNF	Q8TB73	568 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608	LRRC20	Q8TCA0	184 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608	ASZ1	Q8WWH4	475 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608	OR8D1	Q8WZ84	308 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608	CREB3L1	Q96BA8	519 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608	SGTB	Q96EQ0	304 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608	RNF170	Q96K19	258 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608	NRTN	Q99748	197 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608	TMEM175	Q9BSA9	504 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608	SLC25A2	Q9BXI2	301 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608	DMAP1	Q9NPF5	467 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608	ZNF229	Q9UJW7	825 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608	TDRD6	O60522	2096 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608	SYCE1L	A8MT33	242 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608	C11orf94	C9JXX5	98 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608	LAD1	O00515	517 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608	RFXANK	O14593	260 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608	NEMF	O60524	1076 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608	CA11	O75493	328 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608	ZDHHC11B	P0C7U3	371 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608	ERG	P11308	486 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608	CSK	P41240	450 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608	ZNF121	P58317	390 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608	YWHAE	P62258	255 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608	RPS23	P62266	143 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608	CEMP1	Q6PRD7	247 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608	ARL9	Q6T311	187 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608	H2AFV	Q71UI9	128 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608	CAMK2N1	Q7Z7J9	78 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608	C11orf72	Q8NBR9	251 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608	NOXO1	Q8NFA2	376 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608	OR6Q1	Q8NGQ2	317 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608	OR6X1	Q8NH79	312 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608	MSANTD3	Q96H12	275 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608	ZIM3	Q96PE6	472 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608	TAAR1	Q96RJ0	339 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608	CALN1	Q9BXU9	219 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608	MAP1LC3C	Q9BXW4	147 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608	SPNS1	Q9H2V7	528 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608	PDF	Q9HBH1	243 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608	FBXO8	Q9NRD0	319 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608	CACNG2	Q9Y698	323 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		3.34	□□□□□ -1.87
ATP9B-223	ENST00000590608	AGRN	O00468	2067 aa		3.34	□□□□□ -1.88
ATP9B-223	ENST00000590608	PIKFYVE	Q9Y2I7	2098 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ATP9B-223	ENST00000590608		A0A1W2PRF3	423 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ATP9B-223	ENST00000590608		A0A1W2PRM7	423 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ATP9B-223	ENST00000590608	ERI2	A8K979	691 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
ATP9B-223	ENST00000590608	HACD1	B0YJ81	288 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ATP9B-223	ENST00000590608	ZNF879	B4DU55	563 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ATP9B-223	ENST00000590608	RNF113A	O15541	343 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
ATP9B-223	ENST00000590608	PLEKHA8P1	O95397	391 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ATP9B-223	ENST00000590608	PTTG1	O95997	202 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ATP9B-223	ENST00000590608	DCN	P07585	359 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
ATP9B-223	ENST00000590608	RET	P07949	1114 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ATP9B-223	ENST00000590608	CD3G	P09693	182 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ATP9B-223	ENST00000590608	TACSTD2	P09758	323 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ATP9B-223	ENST00000590608	PNMA6A	P0CW24	399 aa	Predicted RBP	3.33	□□□□□ -1.88
ATP9B-223	ENST00000590608	NDUFA8	P51970	172 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ATP9B-223	ENST00000590608	TNNC1	P63316	161 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ATP9B-223	ENST00000590608	PRR3	P79522	188 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
ATP9B-223	ENST00000590608	TFDP2	Q14188	446 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ATP9B-223	ENST00000590608	GPR176	Q14439	515 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ATP9B-223	ENST00000590608	PON2	Q15165	354 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ATP9B-223	ENST00000590608	PRMT9	Q6P2P2	845 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ATP9B-223	ENST00000590608	WDR82	Q6UXN9	313 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ATP9B-223	ENST00000590608	ZNF429	Q86V71	674 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ATP9B-223	ENST00000590608	METTL13	Q8N6R0	699 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ATP9B-223	ENST00000590608	LILRB4	Q8NHJ6	448 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ATP9B-223	ENST00000590608	SLC35E1	Q96K37	410 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ATP9B-223	ENST00000590608	UTP23	Q9BRU9	249 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
ATP9B-223	ENST00000590608	AGMAT	Q9BSE5	352 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ATP9B-223	ENST00000590608	SLIRP	Q9GZT3	109 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
ATP9B-223	ENST00000590608	ANKH	Q9HCJ1	492 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ATP9B-223	ENST00000590608	ZNF282	Q9UDV7	671 aa	Predicted RBP	3.33	□□□□□ -1.88
ATP9B-223	ENST00000590608	TP53TG3	Q9ULZ0	132 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ATP9B-223	ENST00000590608	SMAD5-AS1	Q9Y6J3	95 aa		3.33	□□□□□ -1.88
ATP9B-223	ENST00000590608	SMIM26	A0A096LP01	95 aa		3.32	□□□□□ -1.88
ATP9B-223	ENST00000590608		A6NDN8	102 aa		3.32	□□□□□ -1.88
ATP9B-223	ENST00000590608	ANKRD63	C9JTQ0	380 aa		3.32	□□□□□ -1.88
ATP9B-223	ENST00000590608		K7EN84	100 aa		3.32	□□□□□ -1.88
ATP9B-223	ENST00000590608	POLR1C	O15160	346 aa	Predicted RBP	3.32	□□□□□ -1.88
ATP9B-223	ENST00000590608	SLC16A7	O60669	478 aa		3.32	□□□□□ -1.88
ATP9B-223	ENST00000590608	PCCA	P05165	728 aa	Predicted RBP	3.32	□□□□□ -1.88
ATP9B-223	ENST00000590608	RHOXF2B	P0C7M4	288 aa		3.32	□□□□□ -1.88
ATP9B-223	ENST00000590608	OR8U9	P0C7N5	309 aa		3.32	□□□□□ -1.88
ATP9B-223	ENST00000590608	RAB5A	P20339	215 aa		3.32	□□□□□ -1.88
ATP9B-223	ENST00000590608	CCNO	P22674	350 aa		3.32	□□□□□ -1.88
ATP9B-223	ENST00000590608	IVD	P26440	423 aa		3.32	□□□□□ -1.88
ATP9B-223	ENST00000590608	HTR2C	P28335	458 aa		3.32	□□□□□ -1.88
ATP9B-223	ENST00000590608	UBE2E1	P51965	193 aa		3.32	□□□□□ -1.88
ATP9B-223	ENST00000590608	VSX2	P58304	361 aa	Predicted RBP	3.32	□□□□□ -1.88
ATP9B-223	ENST00000590608	CKAP4	Q07065	602 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
ATP9B-223	ENST00000590608	GINS1	Q14691	196 aa		3.32	□□□□□ -1.88
ATP9B-223	ENST00000590608	QPRT	Q15274	297 aa		3.32	□□□□□ -1.88
ATP9B-223	ENST00000590608	SNRNP35	Q16560	246 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
ATP9B-223	ENST00000590608	THEM4	Q5T1C6	240 aa		3.32	□□□□□ -1.88
ATP9B-223	ENST00000590608	CD300LG	Q6UXG3	332 aa		3.32	□□□□□ -1.88

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