RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574099.1

CCDC40-211, Transcript of coiled-coil domain containing 40, humanhuman

TSL 4

Gene CCDC40, Length 537 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC40-211ENST00000574099 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa14.49□□□□□ -0.09
CCDC40-211ENST00000574099 RASSF4Q9H2L5 321 aa14.49□□□□□ -0.09
CCDC40-211ENST00000574099 SMURF1Q9HCE7 757 aa14.49□□□□□ -0.09
CCDC40-211ENST00000574099 TMEM100Q9NV29 134 aa14.49□□□□□ -0.09
CCDC40-211ENST00000574099 ERVK-18Q9QC07 812 aa14.49□□□□□ -0.09
CCDC40-211ENST00000574099 NDUFAF1Q9Y375 327 aa14.49□□□□□ -0.09
CCDC40-211ENST00000574099 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa14.49□□□□□ -0.09
CCDC40-211ENST00000574099 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa14.48□□□□□ -0.09
CCDC40-211ENST00000574099 ANGPT2O15123 496 aa14.48□□□□□ -0.09
CCDC40-211ENST00000574099 RER1O15258 196 aa14.48□□□□□ -0.09
CCDC40-211ENST00000574099 CTLA4P16410 223 aa14.48□□□□□ -0.09
CCDC40-211ENST00000574099 FUT4P22083 530 aa14.48□□□□□ -0.09
CCDC40-211ENST00000574099 RGS6P49758 472 aa14.48□□□□□ -0.09
CCDC40-211ENST00000574099 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
CCDC40-211ENST00000574099 ARF6P62330 175 aa14.48□□□□□ -0.09
CCDC40-211ENST00000574099 MAB21L1Q13394 359 aa14.48□□□□□ -0.09
CCDC40-211ENST00000574099 MPPED2Q15777 294 aa14.48□□□□□ -0.09
CCDC40-211ENST00000574099 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa14.48□□□□□ -0.09
CCDC40-211ENST00000574099 CCDC80Q76M96 950 aa14.48□□□□□ -0.09
CCDC40-211ENST00000574099 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
CCDC40-211ENST00000574099 MRAPQ8TCY5 172 aa14.48□□□□□ -0.09
CCDC40-211ENST00000574099 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
CCDC40-211ENST00000574099 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
CCDC40-211ENST00000574099 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
CCDC40-211ENST00000574099 DPAGT1Q9H3H5 408 aa14.48□□□□□ -0.09
CCDC40-211ENST00000574099 C16orf95Q9H693 158 aa14.48□□□□□ -0.09
CCDC40-211ENST00000574099 BAG5Q9UL15 447 aa14.48□□□□□ -0.09
CCDC40-211ENST00000574099 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
CCDC40-211ENST00000574099 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa14.47□□□□□ -0.09
CCDC40-211ENST00000574099 J3QW42 95 aa14.47□□□□□ -0.09
CCDC40-211ENST00000574099 ADAM20O43506 726 aa14.47□□□□□ -0.09
CCDC40-211ENST00000574099 LIPFP07098 398 aa14.47□□□□□ -0.09
CCDC40-211ENST00000574099 RPL4P36578 427 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
CCDC40-211ENST00000574099 GATA4P43694 442 aa14.47□□□□□ -0.09
CCDC40-211ENST00000574099 SLC18A1P54219 525 aa14.47□□□□□ -0.09
CCDC40-211ENST00000574099 FHL1Q13642 323 aa14.47□□□□□ -0.09
CCDC40-211ENST00000574099 MESTQ5EB52 335 aa14.47□□□□□ -0.09
CCDC40-211ENST00000574099 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
CCDC40-211ENST00000574099 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
CCDC40-211ENST00000574099 NRMQ8IXM6 262 aa14.47□□□□□ -0.09
CCDC40-211ENST00000574099 PIP4P2Q8N4L2 257 aa14.47□□□□□ -0.09
CCDC40-211ENST00000574099 DPP10Q8N608 796 aa14.47□□□□□ -0.09
CCDC40-211ENST00000574099 Q8TCH9 128 aa14.47□□□□□ -0.09
CCDC40-211ENST00000574099 LRRC8CQ8TDW0 803 aa14.47□□□□□ -0.09
CCDC40-211ENST00000574099 LRTOMTQ8WZ04 291 aa14.47□□□□□ -0.09
CCDC40-211ENST00000574099 Q96M85 177 aa14.47□□□□□ -0.09
CCDC40-211ENST00000574099 C7orf26Q96N11 449 aa14.47□□□□□ -0.09
CCDC40-211ENST00000574099 ECSITQ9BQ95 431 aa14.47□□□□□ -0.09
CCDC40-211ENST00000574099 GRHPRQ9UBQ7 328 aa14.47□□□□□ -0.09
CCDC40-211ENST00000574099 POLR1DQ9Y2S0 133 aa14.47□□□□□ -0.09
CCDC40-211ENST00000574099 FAM96BQ9Y3D0 163 aa14.47□□□□□ -0.09
CCDC40-211ENST00000574099 XKRYO14609 159 aa14.46□□□□□ -0.09
CCDC40-211ENST00000574099 OPN1MWP04001 364 aa14.46□□□□□ -0.09
CCDC40-211ENST00000574099 OPN1MW2P0DN77 364 aa14.46□□□□□ -0.09
CCDC40-211ENST00000574099 OPN1MW3P0DN78 364 aa14.46□□□□□ -0.09
CCDC40-211ENST00000574099 SLC9A3P48764 834 aa14.46□□□□□ -0.09
CCDC40-211ENST00000574099 GZMMP51124 257 aa14.46□□□□□ -0.09
CCDC40-211ENST00000574099 OR8B8Q15620 311 aa14.46□□□□□ -0.09
CCDC40-211ENST00000574099 CROCCP2Q86T23 111 aa14.46□□□□□ -0.09
CCDC40-211ENST00000574099 OAFQ86UD1 273 aa14.46□□□□□ -0.09
CCDC40-211ENST00000574099 C11orf44Q8N8P7 122 aa14.46□□□□□ -0.09
CCDC40-211ENST00000574099 ZNF570Q96NI8 536 aa14.46□□□□□ -0.09
CCDC40-211ENST00000574099 HCAR1Q9BXC0 346 aa14.46□□□□□ -0.09
CCDC40-211ENST00000574099 PARD6BQ9BYG5 372 aa14.46□□□□□ -0.09
CCDC40-211ENST00000574099 VPREB3Q9UKI3 123 aa14.46□□□□□ -0.09
CCDC40-211ENST00000574099 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
CCDC40-211ENST00000574099 PRSS37A4D1T9 235 aa14.45□□□□□ -0.1
CCDC40-211ENST00000574099 BTBD17A6NE02 478 aa14.45□□□□□ -0.1
CCDC40-211ENST00000574099 EFCAB9A8MZ26 197 aa14.45□□□□□ -0.1
CCDC40-211ENST00000574099 IMPA2O14732 288 aa14.45□□□□□ -0.1
CCDC40-211ENST00000574099 OR10H3O60404 316 aa14.45□□□□□ -0.1
CCDC40-211ENST00000574099 RAD23AP54725 363 aa14.45□□□□□ -0.1
CCDC40-211ENST00000574099 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP14.45□□□□□ -0.1
CCDC40-211ENST00000574099 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP14.45□□□□□ -0.1
CCDC40-211ENST00000574099 ST3GAL3Q11203 375 aa14.45□□□□□ -0.1
CCDC40-211ENST00000574099 COX10Q12887 443 aa14.45□□□□□ -0.1
CCDC40-211ENST00000574099 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP14.45□□□□□ -0.1
CCDC40-211ENST00000574099 REC114Q7Z4M0 266 aa14.45□□□□□ -0.1
CCDC40-211ENST00000574099 VMO1Q7Z5L0 202 aa14.45□□□□□ -0.1
CCDC40-211ENST00000574099 RHCGQ9UBD6 479 aa14.45□□□□□ -0.1
CCDC40-211ENST00000574099 RNF7Q9UBF6 113 aa14.45□□□□□ -0.1
CCDC40-211ENST00000574099 LGALS8O00214 317 aa14.44□□□□□ -0.1
CCDC40-211ENST00000574099 SLC16A7O60669 478 aa14.44□□□□□ -0.1
CCDC40-211ENST00000574099 FCN3O75636 299 aa14.44□□□□□ -0.1
CCDC40-211ENST00000574099 TSPAN9O75954 239 aa14.44□□□□□ -0.1
CCDC40-211ENST00000574099 GYPAP02724 150 aa14.44□□□□□ -0.1
CCDC40-211ENST00000574099 CD200P41217 278 aa14.44□□□□□ -0.1
CCDC40-211ENST00000574099 GPR4P46093 362 aa14.44□□□□□ -0.1
CCDC40-211ENST00000574099 YAP1P46937 504 aaKnown RBP14.44□□□□□ -0.1
CCDC40-211ENST00000574099 KCNJ8Q15842 424 aa14.44□□□□□ -0.1
CCDC40-211ENST00000574099 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP14.44□□□□□ -0.1
CCDC40-211ENST00000574099 Q6ZTK2 550 aa14.44□□□□□ -0.1
CCDC40-211ENST00000574099 BTN2A1Q7KYR7 527 aa14.44□□□□□ -0.1
CCDC40-211ENST00000574099 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa14.44□□□□□ -0.1
CCDC40-211ENST00000574099 ERGIC1Q969X5 290 aa14.44□□□□□ -0.1
CCDC40-211ENST00000574099 PRRC1Q96M27 445 aa14.44□□□□□ -0.1
CCDC40-211ENST00000574099 SYT4Q9H2B2 425 aa14.44□□□□□ -0.1
CCDC40-211ENST00000574099 TOR3AQ9H497 397 aa14.44□□□□□ -0.1
CCDC40-211ENST00000574099 ZNRD1Q9P1U0 126 aa14.44□□□□□ -0.1
CCDC40-211ENST00000574099 ATPIF1Q9UII2 106 aa14.44□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.3 ms