RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534382.5

CTSB-231, Transcript of cathepsin B, human

TSL 4

Gene CTSB, Length 764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTSB-231	ENST00000534382	SPRY3	O43610	288 aa		12.37	□□□□□ -0.43
CTSB-231	ENST00000534382	RAC2	P15153	192 aa		12.37	□□□□□ -0.43
CTSB-231	ENST00000534382	KITLG	P21583	273 aa		12.37	□□□□□ -0.43
CTSB-231	ENST00000534382	ACHE	P22303	614 aa		12.37	□□□□□ -0.43
CTSB-231	ENST00000534382	COL8A2	P25067	703 aa		12.37	□□□□□ -0.43
CTSB-231	ENST00000534382	TPTE	P56180	551 aa		12.37	□□□□□ -0.43
CTSB-231	ENST00000534382	GGTLC2	Q14390	218 aa		12.37	□□□□□ -0.43
CTSB-231	ENST00000534382	PTGES3	Q15185	160 aa	Known RBP	12.37	□□□□□ -0.43
CTSB-231	ENST00000534382	SNAPC1	Q16533	368 aa		12.37	□□□□□ -0.43
CTSB-231	ENST00000534382	TMEM249	Q2WGJ8	235 aa		12.37	□□□□□ -0.43
CTSB-231	ENST00000534382	FAM209A	Q5JX71	171 aa		12.37	□□□□□ -0.43
CTSB-231	ENST00000534382	KDM4D	Q6B0I6	523 aa		12.37	□□□□□ -0.43
CTSB-231	ENST00000534382	ZFP1	Q6P2D0	407 aa		12.37	□□□□□ -0.43
CTSB-231	ENST00000534382	FBXW12	Q6X9E4	464 aa		12.37	□□□□□ -0.43
CTSB-231	ENST00000534382	CPO	Q8IVL8	374 aa		12.37	□□□□□ -0.43
CTSB-231	ENST00000534382	SPTSSA	Q969W0	71 aa		12.37	□□□□□ -0.43
CTSB-231	ENST00000534382	INTS14	Q96SY0	518 aa		12.37	□□□□□ -0.43
CTSB-231	ENST00000534382	GABARAPL1	Q9H0R8	117 aa		12.37	□□□□□ -0.43
CTSB-231	ENST00000534382	SEMA6A	Q9H2E6	1030 aa		12.37	□□□□□ -0.43
CTSB-231	ENST00000534382	MARCH7	Q9H992	704 aa		12.37	□□□□□ -0.43
CTSB-231	ENST00000534382	CHODL	Q9H9P2	273 aa		12.37	□□□□□ -0.43
CTSB-231	ENST00000534382	DECR2	Q9NUI1	292 aa		12.37	□□□□□ -0.43
CTSB-231	ENST00000534382	TVP23B	Q9NYZ1	205 aa		12.37	□□□□□ -0.43
CTSB-231	ENST00000534382	ZDHHC8	Q9ULC8	765 aa		12.37	□□□□□ -0.43
CTSB-231	ENST00000534382	CHD3	Q12873	2000 aa	Known RBP	12.37	□□□□□ -0.43
CTSB-231	ENST00000534382	HIVEP2	P31629	2446 aa		12.36	□□□□□ -0.43
CTSB-231	ENST00000534382	IGHV4-61	A0A0C4DH41	118 aa		12.36	□□□□□ -0.43
CTSB-231	ENST00000534382	ZSCAN5B	A6NJL1	495 aa		12.36	□□□□□ -0.43
CTSB-231	ENST00000534382	PRODH	O43272	600 aa		12.36	□□□□□ -0.43
CTSB-231	ENST00000534382	TPD52L2	O43399	206 aa	Known RBP	12.36	□□□□□ -0.43
CTSB-231	ENST00000534382	MITF	O75030	526 aa	Predicted RBP	12.36	□□□□□ -0.43
CTSB-231	ENST00000534382	IGHV1-46	P01743	117 aa		12.36	□□□□□ -0.43
CTSB-231	ENST00000534382	ADH4	P08319	380 aa		12.36	□□□□□ -0.43
CTSB-231	ENST00000534382	TST	Q16762	297 aa	Known RBP	12.36	□□□□□ -0.43
CTSB-231	ENST00000534382	KLHL12	Q53G59	568 aa		12.36	□□□□□ -0.43
CTSB-231	ENST00000534382	ZMAT1	Q5H9K5	638 aa		12.36	□□□□□ -0.43
CTSB-231	ENST00000534382	SHF	Q7M4L6	423 aa		12.36	□□□□□ -0.43
CTSB-231	ENST00000534382	NAA40	Q86UY6	237 aa		12.36	□□□□□ -0.43
CTSB-231	ENST00000534382	ERI1	Q8IV48	349 aa	Known RBP	12.36	□□□□□ -0.43
CTSB-231	ENST00000534382	TIGD4	Q8IY51	512 aa		12.36	□□□□□ -0.43
CTSB-231	ENST00000534382	C10orf67	Q8IYJ2	551 aa		12.36	□□□□□ -0.43
CTSB-231	ENST00000534382	OR6N2	Q8NGY6	317 aa		12.36	□□□□□ -0.43
CTSB-231	ENST00000534382	ST7L	Q8TDW4	575 aa		12.36	□□□□□ -0.43
CTSB-231	ENST00000534382	YIPF5	Q969M3	257 aa		12.36	□□□□□ -0.43
CTSB-231	ENST00000534382	SLAMF6	Q96DU3	332 aa		12.36	□□□□□ -0.43
CTSB-231	ENST00000534382	DIRC2	Q96SL1	478 aa		12.36	□□□□□ -0.43
CTSB-231	ENST00000534382	MSL2	Q9HCI7	577 aa		12.36	□□□□□ -0.43
CTSB-231	ENST00000534382	CENPM	Q9NSP4	180 aa		12.36	□□□□□ -0.43
CTSB-231	ENST00000534382	PTTG3P	Q9NZH4	202 aa		12.36	□□□□□ -0.43
CTSB-231	ENST00000534382	OAZ3	Q9UMX2	235 aa		12.36	□□□□□ -0.43
CTSB-231	ENST00000534382	SETD2	Q9BYW2	2564 aa	Predicted RBP	12.36	□□□□□ -0.43
CTSB-231	ENST00000534382	ZAN	Q9Y493	2812 aa		12.35	□□□□□ -0.43
CTSB-231	ENST00000534382	C2CD3	Q4AC94	2353 aa		12.35	□□□□□ -0.43
CTSB-231	ENST00000534382	IGHV1-69-2	A0A0G2JMI3	117 aa		12.35	□□□□□ -0.43
CTSB-231	ENST00000534382		M0R135	149 aa		12.35	□□□□□ -0.43
CTSB-231	ENST00000534382	CD5L	O43866	347 aa		12.35	□□□□□ -0.43
CTSB-231	ENST00000534382	RP2	O75695	350 aa		12.35	□□□□□ -0.43
CTSB-231	ENST00000534382	LCAT	P04180	440 aa		12.35	□□□□□ -0.43
CTSB-231	ENST00000534382	TACSTD2	P09758	323 aa		12.35	□□□□□ -0.43
CTSB-231	ENST00000534382	OTX1	P32242	354 aa	Predicted RBP	12.35	□□□□□ -0.43
CTSB-231	ENST00000534382	CRYBB2	P43320	205 aa		12.35	□□□□□ -0.43
CTSB-231	ENST00000534382	TMEM33	P57088	247 aa		12.35	□□□□□ -0.43
CTSB-231	ENST00000534382	CDK5R2	Q13319	367 aa		12.35	□□□□□ -0.43
CTSB-231	ENST00000534382	EIF2B1	Q14232	305 aa	Known RBP	12.35	□□□□□ -0.43
CTSB-231	ENST00000534382	HLX	Q14774	488 aa	Predicted RBP	12.35	□□□□□ -0.43
CTSB-231	ENST00000534382	TAF13	Q15543	124 aa		12.35	□□□□□ -0.43
CTSB-231	ENST00000534382	SLC35D3	Q5M8T2	416 aa		12.35	□□□□□ -0.43
CTSB-231	ENST00000534382	USP51	Q70EK9	711 aa		12.35	□□□□□ -0.43
CTSB-231	ENST00000534382	CXXC5	Q7LFL8	322 aa	Known RBP	12.35	□□□□□ -0.43
CTSB-231	ENST00000534382	DPY19L4	Q7Z388	723 aa		12.35	□□□□□ -0.43
CTSB-231	ENST00000534382	ZMYND19	Q96E35	227 aa	Predicted RBP	12.35	□□□□□ -0.43
CTSB-231	ENST00000534382	ZNF799	Q96GE5	643 aa		12.35	□□□□□ -0.43
CTSB-231	ENST00000534382	RAB3IP	Q96QF0	476 aa	Predicted RBP	12.35	□□□□□ -0.43
CTSB-231	ENST00000534382	KCNJ15	Q99712	375 aa		12.35	□□□□□ -0.43
CTSB-231	ENST00000534382	PKP2	Q99959	881 aa		12.35	□□□□□ -0.43
CTSB-231	ENST00000534382	COPS4	Q9BT78	406 aa		12.35	□□□□□ -0.43
CTSB-231	ENST00000534382	PRRG3	Q9BZD7	231 aa		12.35	□□□□□ -0.43
CTSB-231	ENST00000534382	SAP30L	Q9HAJ7	183 aa		12.35	□□□□□ -0.43
CTSB-231	ENST00000534382	ZNF275	Q9NSD4	429 aa	Predicted RBP	12.35	□□□□□ -0.43
CTSB-231	ENST00000534382	ZKSCAN7	Q9P0L1	754 aa	Predicted RBP	12.35	□□□□□ -0.43
CTSB-231	ENST00000534382	ENOPH1	Q9UHY7	261 aa		12.35	□□□□□ -0.43
CTSB-231	ENST00000534382	TMEFF2	Q9UIK5	374 aa	Predicted RBP	12.35	□□□□□ -0.43
CTSB-231	ENST00000534382	SAC3D1	A6NKF1	404 aa		12.34	□□□□□ -0.43
CTSB-231	ENST00000534382	ZAR1L	A6NP61	321 aa		12.34	□□□□□ -0.43
CTSB-231	ENST00000534382	ZNF878	C9JN71	531 aa		12.34	□□□□□ -0.43
CTSB-231	ENST00000534382		H3BNX3	289 aa		12.34	□□□□□ -0.43
CTSB-231	ENST00000534382	TLX2	O43763	284 aa	Predicted RBP	12.34	□□□□□ -0.43
CTSB-231	ENST00000534382	CDC14B	O60729	498 aa		12.34	□□□□□ -0.43
CTSB-231	ENST00000534382	LILRA1	O75019	489 aa		12.34	□□□□□ -0.43
CTSB-231	ENST00000534382	CD55	P08174	381 aa		12.34	□□□□□ -0.43
CTSB-231	ENST00000534382	SLC2A5	P22732	501 aa		12.34	□□□□□ -0.43
CTSB-231	ENST00000534382	IGFBP5	P24593	272 aa		12.34	□□□□□ -0.43
CTSB-231	ENST00000534382	EPHA2	P29317	976 aa		12.34	□□□□□ -0.43
CTSB-231	ENST00000534382	SLC15A1	P46059	708 aa		12.34	□□□□□ -0.43
CTSB-231	ENST00000534382	GPR6	P46095	362 aa	Predicted RBP	12.34	□□□□□ -0.43
CTSB-231	ENST00000534382	SLC6A9	P48067	706 aa		12.34	□□□□□ -0.43
CTSB-231	ENST00000534382	SLX4IP	Q5VYV7	408 aa		12.34	□□□□□ -0.43
CTSB-231	ENST00000534382	CYB5R2	Q6BCY4	276 aa		12.34	□□□□□ -0.43
CTSB-231	ENST00000534382	OR2T2	Q6IF00	324 aa		12.34	□□□□□ -0.43
CTSB-231	ENST00000534382	DRAM2	Q6UX65	266 aa		12.34	□□□□□ -0.43

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