RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512193.5

NEK1-208, Transcript of NIMA related kinase 1, human

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEK1, Length 4,430 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEK1-208	ENST00000512193	GAL	P22466	123 aa		7.28	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	IL2RG	P31785	369 aa		7.28	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	EPHA4	P54764	986 aa		7.28	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	FMOD	Q06828	376 aa		7.28	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	SOHLH1	Q5JUK2	328 aa		7.28	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	OR52W1	Q6IF63	320 aa		7.28	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	ABI3BP	Q7Z7G0	1075 aa		7.28	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	CNEP1R1	Q8N9A8	125 aa		7.28	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	C4orf45	Q96LM5	186 aa		7.28	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	FLRT3	Q9NZU0	649 aa		7.28	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	BOK	Q9UMX3	212 aa	Predicted RBP	7.28	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	NOSIP	Q9Y314	301 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	SIT1	Q9Y3P8	196 aa		7.28	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	CENPVL1	A0A0U1RR11	272 aa		7.27	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	GLS	O94925	669 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	MSL3P1	P0C860	447 aa		7.27	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	GRB2	P62993	217 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	UBE2I	P63279	158 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	TGFBR3	Q03167	851 aa		7.27	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF85	Q03923	595 aa		7.27	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	PTCRA	Q6ISU1	281 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	GLDN	Q6ZMI3	551 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	TMEM200A	Q86VY9	491 aa		7.27	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	MAML2	Q8IZL2	1156 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	OR56B2P	Q8NGI1	322 aa		7.27	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	OR1J2	Q8NGS2	313 aa		7.27	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	SLC25A43	Q8WUT9	341 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	SGK3	Q96BR1	496 aa		7.27	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	MVB12A	Q96EY5	273 aa		7.27	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF681	Q96N22	645 aa		7.27	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	PBOV1	Q9GZY1	135 aa		7.27	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	PADI1	Q9ULC6	663 aa		7.27	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	IGHV5-51	A0A0C4DH38	117 aa		7.27	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	FRG2C	A6NGY1	282 aa		7.27	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	GREM1	O60565	184 aa		7.27	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	TCN2	P20062	427 aa		7.27	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	MSR1	P21757	451 aa		7.27	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	CHAT	P28329	748 aa		7.27	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	CD80	P33681	288 aa		7.27	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	MRPS34	P82930	218 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	FOXF1	Q12946	379 aa		7.27	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	AANAT	Q16613	207 aa		7.27	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	LTC4S	Q16873	150 aa		7.27	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	AADACL3	Q5VUY0	350 aa		7.27	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	TMEM88	Q6PEY1	159 aa		7.27	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	TMEM92	Q6UXU6	159 aa		7.27	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	WDR88	Q6ZMY6	472 aa		7.27	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	TMEM91	Q6ZNR0	172 aa		7.27	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	LANCL3	Q6ZV70	420 aa		7.27	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	ST8SIA1	Q92185	356 aa		7.27	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	C20orf24	Q9BUV8	137 aa		7.27	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	DLL4	Q9NR61	685 aa		7.27	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	LRP12	Q9Y561	859 aa		7.27	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	PCYT1B	Q9Y5K3	369 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	SCN2A	Q99250	2005 aa		7.27	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193		M0R135	149 aa		7.27	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	BHLHE40	O14503	412 aa		7.27	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	GPR137B	O60478	399 aa		7.27	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	NDUFB6	O95139	128 aa		7.27	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	CDA	P32320	146 aa		7.27	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	UBE2K	P61086	200 aa		7.27	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	NKX6-1	P78426	367 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	ARG2	P78540	354 aa		7.27	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	GSG1	Q2KHT4	349 aa		7.27	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	PRSS53	Q2L4Q9	553 aa		7.27	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	C1QL3	Q5VWW1	255 aa		7.27	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	DMKN	Q6E0U4	476 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	CLEC1A	Q8NC01	280 aa		7.27	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	C11orf40	Q8WZ69	217 aa		7.27	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	FRZB	Q92765	325 aa		7.27	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	CMBL	Q96DG6	245 aa		7.27	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF799	Q96GE5	643 aa		7.27	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF2	Q9BSG1	426 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	NELFA	Q9H3P2	528 aa		7.27	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	TAF9B	Q9HBM6	251 aa		7.27	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	DNAJB11	Q9UBS4	358 aa		7.27	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF223	Q9UK11	482 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	FOXJ3	Q9UPW0	622 aa		7.27	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF638	Q14966	1978 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF318	Q5VUA4	2279 aa		7.27	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	IGHV3-15	A0A0B4J1V0	119 aa		7.26	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	LMO7DN	F2Z398	122 aa		7.26	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	HRK	O00198	91 aa		7.26	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	LANCL1	O43813	399 aa		7.26	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	ZGLP1	P0C6A0	271 aa		7.26	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	ABCD3	P28288	659 aa		7.26	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	RNF4	P78317	190 aa		7.26	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF117	Q03924	483 aa		7.26	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	THEM4	Q5T1C6	240 aa		7.26	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	ADAM5	Q6NVV9	412 aa		7.26	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	SLC22A25	Q6T423	547 aa		7.26	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	NHLRC1	Q6VVB1	395 aa		7.26	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	PLPP5	Q8NEB5	264 aa		7.26	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	SEMA6D	Q8NFY4	1073 aa		7.26	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	OR9K2	Q8NGE7	335 aa		7.26	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	ST8SIA2	Q92186	375 aa		7.26	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	HAS2	Q92819	552 aa		7.26	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	PIGQ	Q9BRB3	760 aa		7.26	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	OBP2B	Q9NPH6	170 aa		7.26	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF629	Q9UEG4	869 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25

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