RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509355.5

PDE4D-217, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 847 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-217ENST00000509355 TIGD3Q6B0B8 471 aa3.66□□□□□ -1.82
PDE4D-217ENST00000509355 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP3.66□□□□□ -1.82
PDE4D-217ENST00000509355 NIPAL3Q6P499 406 aa3.66□□□□□ -1.82
PDE4D-217ENST00000509355 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa3.66□□□□□ -1.82
PDE4D-217ENST00000509355 CBLN3Q6UW01 205 aa3.66□□□□□ -1.82
PDE4D-217ENST00000509355 CENPUQ71F23 418 aa3.66□□□□□ -1.82
PDE4D-217ENST00000509355 C16orf62Q7Z3J2 963 aa3.66□□□□□ -1.82
PDE4D-217ENST00000509355 C17orf64Q86WR6 236 aa3.66□□□□□ -1.82
PDE4D-217ENST00000509355 ZNF567Q8N184 647 aa3.66□□□□□ -1.82
PDE4D-217ENST00000509355 CA13Q8N1Q1 262 aa3.66□□□□□ -1.82
PDE4D-217ENST00000509355 ZNF321PQ8N8H1 164 aa3.66□□□□□ -1.82
PDE4D-217ENST00000509355 MFSD9Q8NBP5 474 aa3.66□□□□□ -1.82
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PDE4D-217ENST00000509355 FAHD2AQ96GK7 314 aa3.66□□□□□ -1.82
PDE4D-217ENST00000509355 SLC6A7Q99884 636 aa3.66□□□□□ -1.82
PDE4D-217ENST00000509355 PINK1Q9BXM7 581 aa3.66□□□□□ -1.82
PDE4D-217ENST00000509355 MEAF6Q9HAF1 191 aa3.66□□□□□ -1.82
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PDE4D-217ENST00000509355 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa3.66□□□□□ -1.82
PDE4D-217ENST00000509355 FREM1Q5H8C1 2179 aa3.66□□□□□ -1.82
PDE4D-217ENST00000509355 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
PDE4D-217ENST00000509355 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP3.66□□□□□ -1.82
PDE4D-217ENST00000509355 DNAJC13O75165 2243 aa3.66□□□□□ -1.82
PDE4D-217ENST00000509355 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa3.65□□□□□ -1.83
PDE4D-217ENST00000509355 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa3.65□□□□□ -1.83
PDE4D-217ENST00000509355 DPRXA6NFQ7 191 aa3.65□□□□□ -1.83
PDE4D-217ENST00000509355 WRBO00258 174 aa3.65□□□□□ -1.83
PDE4D-217ENST00000509355 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
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PDE4D-217ENST00000509355 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
PDE4D-217ENST00000509355 CBR3O75828 277 aa3.65□□□□□ -1.83
PDE4D-217ENST00000509355 ANP32DO95626 131 aa3.65□□□□□ -1.83
PDE4D-217ENST00000509355 GOT2P00505 430 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
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PDE4D-217ENST00000509355 ALDH3B1P43353 468 aa3.65□□□□□ -1.83
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PDE4D-217ENST00000509355 STK11Q15831 433 aa3.65□□□□□ -1.83
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PDE4D-217ENST00000509355 C11orf71Q6IPW1 123 aa3.65□□□□□ -1.83
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PDE4D-217ENST00000509355 ZDHHC22Q8N966 263 aa3.65□□□□□ -1.83
PDE4D-217ENST00000509355 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
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PDE4D-217ENST00000509355 OR6K3Q8NGY3 331 aa3.65□□□□□ -1.83
PDE4D-217ENST00000509355 OR4L1Q8NH43 312 aa3.65□□□□□ -1.83
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PDE4D-217ENST00000509355 PEX13Q92968 403 aa3.65□□□□□ -1.83
PDE4D-217ENST00000509355 MCHR2Q969V1 340 aa3.65□□□□□ -1.83
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PDE4D-217ENST00000509355 C5orf66Q9H5L9 145 aa3.65□□□□□ -1.83
PDE4D-217ENST00000509355 FOLH1BQ9HBA9 442 aa3.65□□□□□ -1.83
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PDE4D-217ENST00000509355 P2RX2Q9UBL9 471 aa3.65□□□□□ -1.83
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PDE4D-217ENST00000509355 LOC105371242A0A075B767 164 aa3.64□□□□□ -1.83
PDE4D-217ENST00000509355 SHISA9B4DS77 424 aa3.64□□□□□ -1.83
PDE4D-217ENST00000509355 PPIAL4DF5H284 164 aa3.64□□□□□ -1.83
PDE4D-217ENST00000509355 ZNF195O14628 629 aa3.64□□□□□ -1.83
PDE4D-217ENST00000509355 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
PDE4D-217ENST00000509355 SPOPO43791 374 aa3.64□□□□□ -1.83
PDE4D-217ENST00000509355 CTNSO60931 367 aa3.64□□□□□ -1.83
PDE4D-217ENST00000509355 TPM3P06753 285 aa3.64□□□□□ -1.83
PDE4D-217ENST00000509355 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
PDE4D-217ENST00000509355 STAG3L3P0CL85 134 aa3.64□□□□□ -1.83
PDE4D-217ENST00000509355 MDKP21741 143 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
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