RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-216	ENST00000489424	PYCR1	P32322	319 aa		14.74	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM120AOS	Q5T036	256 aa		14.74	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM236	Q5W0B7	351 aa		14.74	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC26A10	Q8NG04	563 aa		14.74	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	AKR7L	Q8NHP1	331 aa		14.74	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	C4orf45	Q96LM5	186 aa		14.74	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	DCLRE1C	Q96SD1	692 aa	Known RBP	14.74	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	DDO	Q99489	341 aa		14.74	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	OR51V1	Q9H2C8	321 aa		14.74	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	RIBC2	Q9H4K1	309 aa		14.74	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	PLEK2	Q9NYT0	353 aa		14.74	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	USE1	Q9NZ43	259 aa		14.74	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	ASH2L	Q9UBL3	628 aa		14.74	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	PRPF8	Q6P2Q9	2335 aa	Known RBP eCLIP	14.74	□□□□□ -0.05	2e-6	■□□□□ 11.2
HDAC10-216	ENST00000489424	PLSCR5	A0PG75	271 aa		14.73	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	ANKRD65	E5RJM6	399 aa		14.73	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	DOK2	O60496	412 aa		14.73	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	MITF	O75030	526 aa	Predicted RBP	14.73	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	GAA	P10253	952 aa		14.73	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	NAT2	P11245	290 aa		14.73	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	SRD5A1	P18405	259 aa		14.73	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	WNT5A	P41221	380 aa		14.73	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	MMP15	P51511	669 aa		14.73	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	MAD2L1BP	Q15013	274 aa	Predicted RBP	14.73	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	CBR4	Q8N4T8	237 aa		14.73	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	TEX29	Q8N6K0	151 aa		14.73	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	KLF14	Q8TD94	323 aa	Predicted RBP	14.73	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	NMNAT2	Q9BZQ4	307 aa		14.73	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	C8orf4	Q9NR00	106 aa		14.73	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF275	Q9NSD4	429 aa	Predicted RBP	14.73	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	CUBN	O60494	3623 aa		14.72	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM183A	A6NL82	134 aa		14.72	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	ZAR1L	A6NP61	321 aa		14.72	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424		H0YHG0	523 aa		14.72	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	EI24	O14681	340 aa		14.72	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	PRODH	O43272	600 aa		14.72	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	NCR1	O76036	304 aa		14.72	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	GLCE	O94923	617 aa		14.72	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	ALPL	P05186	524 aa		14.72	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	SCG5	P05408	212 aa		14.72	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	CD55	P08174	381 aa		14.72	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	HTR5A	P47898	357 aa		14.72	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	RGS6	P49758	472 aa		14.72	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	CDC42	P60953	191 aa		14.72	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	RPS7	P62081	194 aa	Known RBP	14.72	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	PPP1CB	P62140	327 aa		14.72	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC3A1	Q07837	685 aa		14.72	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	ECH1	Q13011	328 aa		14.72	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	KLHL12	Q53G59	568 aa		14.72	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC35D3	Q5M8T2	416 aa		14.72	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	SLX4IP	Q5VYV7	408 aa		14.72	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF774	Q6NX45	483 aa		14.72	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	PLBD1	Q6P4A8	553 aa		14.72	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	CPO	Q8IVL8	374 aa		14.72	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF101	Q8IZC7	436 aa		14.72	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	OR51L1	Q8NGJ5	315 aa		14.72	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	ELMOD3	Q96FG2	381 aa		14.72	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	PITX2	Q99697	317 aa		14.72	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	GABARAPL3	Q9BY60	117 aa		14.72	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	HDHD2	Q9H0R4	259 aa		14.72	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	DECR2	Q9NUI1	292 aa		14.72	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEFF2	Q9UIK5	374 aa	Predicted RBP	14.72	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	FZR1	Q9UM11	496 aa		14.72	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	LRP5L	A4QPB2	252 aa		14.71	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	OR6C6	A6NF89	314 aa		14.71	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	LYNX1	G3V0Z9	82 aa		14.71	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	GPANK1	O95872	356 aa		14.71	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	GYPB	P06028	91 aa		14.71	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	LYNX1	P0DP58	116 aa		14.71	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	GSTT1	P30711	240 aa		14.71	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	ENTPD1	P49961	510 aa		14.71	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF81	P51508	661 aa		14.71	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	ERVS71-1	P61550	626 aa		14.71	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	RCN1	Q15293	331 aa		14.71	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	MEP1B	Q16820	701 aa		14.71	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	LCN1P1	Q5VSP4	162 aa		14.71	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	SHF	Q7M4L6	423 aa		14.71	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	OR1F12	Q8NHA8	337 aa		14.71	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	PTP4A1	Q93096	173 aa		14.71	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	YIPF5	Q969M3	257 aa		14.71	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	INTS14	Q96SY0	518 aa		14.71	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	EGLN1	Q9GZT9	426 aa		14.71	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	DCLRE1B	Q9H816	532 aa		14.71	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	MED20	Q9H944	212 aa		14.71	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	IMPAD1	Q9NX62	359 aa		14.71	□□□□□ -0.05
HDAC10-216	ENST00000489424	IGHV1-69-2	A0A0G2JMI3	117 aa		14.7	□□□□□ -0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	TVP23A	A6NH52	213 aa		14.7	□□□□□ -0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF593	O00488	134 aa	Predicted RBP	14.7	□□□□□ -0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	SPARC	P09486	303 aa		14.7	□□□□□ -0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	KITLG	P21583	273 aa		14.7	□□□□□ -0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	MAGEB1	P43366	347 aa		14.7	□□□□□ -0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	LMO4	P61968	165 aa		14.7	□□□□□ -0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	HIST1H3A	P68431	136 aa		14.7	□□□□□ -0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	CCL8	P80075	99 aa		14.7	□□□□□ -0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	TAF13	Q15543	124 aa		14.7	□□□□□ -0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	CR1L	Q2VPA4	569 aa		14.7	□□□□□ -0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	HFE	Q30201	348 aa		14.7	□□□□□ -0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	HIST2H3PS2	Q5TEC6	136 aa		14.7	□□□□□ -0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	HIST2H3A	Q71DI3	136 aa		14.7	□□□□□ -0.06
HDAC10-216	ENST00000489424	VASH1	Q7L8A9	365 aa	Predicted RBP	14.7	□□□□□ -0.06

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