RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488601.6

POLR1C-208, Transcript of RNA polymerase I and III subunit C, human

TSL 2

Gene POLR1C, Length 973 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
POLR1C-208	ENST00000488601	ZNF317	Q96PQ6	595 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
POLR1C-208	ENST00000488601	TSPAN32	Q96QS1	320 aa		4.56	□□□□□ -1.68
POLR1C-208	ENST00000488601	PELO	Q9BRX2	385 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
POLR1C-208	ENST00000488601	NMUR2	Q9GZQ4	415 aa		4.56	□□□□□ -1.68
POLR1C-208	ENST00000488601	TMPRSS5	Q9H3S3	457 aa		4.56	□□□□□ -1.68
POLR1C-208	ENST00000488601	SDHAF3	Q9NRP4	125 aa		4.56	□□□□□ -1.68
POLR1C-208	ENST00000488601	C20orf96	Q9NUD7	363 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
POLR1C-208	ENST00000488601	TMEM106B	Q9NUM4	274 aa		4.56	□□□□□ -1.68
POLR1C-208	ENST00000488601	TAS2R13	Q9NYV9	303 aa		4.56	□□□□□ -1.68
POLR1C-208	ENST00000488601	EMC3	Q9P0I2	261 aa		4.56	□□□□□ -1.68
POLR1C-208	ENST00000488601	RHCG	Q9UBD6	479 aa		4.56	□□□□□ -1.68
POLR1C-208	ENST00000488601	CLN8	Q9UBY8	286 aa		4.56	□□□□□ -1.68
POLR1C-208	ENST00000488601	FBXO5	Q9UKT4	447 aa		4.56	□□□□□ -1.68
POLR1C-208	ENST00000488601	VDAC3	Q9Y277	283 aa		4.56	□□□□□ -1.68
POLR1C-208	ENST00000488601	MEIOC	A2RUB1	952 aa		4.55	□□□□□ -1.68
POLR1C-208	ENST00000488601	ANKDD1B	A6NHY2	528 aa		4.55	□□□□□ -1.68
POLR1C-208	ENST00000488601	NR5A2	O00482	541 aa		4.55	□□□□□ -1.68
POLR1C-208	ENST00000488601	ZNF195	O14628	629 aa		4.55	□□□□□ -1.68
POLR1C-208	ENST00000488601	PHYH	O14832	338 aa		4.55	□□□□□ -1.68
POLR1C-208	ENST00000488601	PGRMC2	O15173	223 aa		4.55	□□□□□ -1.68
POLR1C-208	ENST00000488601	MRPL33	O75394	65 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
POLR1C-208	ENST00000488601	TFAP2A	P05549	437 aa		4.55	□□□□□ -1.68
POLR1C-208	ENST00000488601	MLN	P12872	115 aa		4.55	□□□□□ -1.68
POLR1C-208	ENST00000488601	HPD	P32754	393 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
POLR1C-208	ENST00000488601	PITPNB	P48739	271 aa		4.55	□□□□□ -1.68
POLR1C-208	ENST00000488601	ZNF75D	P51815	510 aa		4.55	□□□□□ -1.68
POLR1C-208	ENST00000488601	CAPZA1	P52907	286 aa		4.55	□□□□□ -1.68
POLR1C-208	ENST00000488601	AP1S2	P56377	157 aa		4.55	□□□□□ -1.68
POLR1C-208	ENST00000488601	TUBA1B	P68363	451 aa		4.55	□□□□□ -1.68
POLR1C-208	ENST00000488601	MZT1	Q08AG7	82 aa		4.55	□□□□□ -1.68
POLR1C-208	ENST00000488601	GAGE2B	Q13066	116 aa		4.55	□□□□□ -1.68
POLR1C-208	ENST00000488601	PDK3	Q15120	406 aa		4.55	□□□□□ -1.68
POLR1C-208	ENST00000488601	GAGE2E	Q4V326	116 aa		4.55	□□□□□ -1.68
POLR1C-208	ENST00000488601	HSP90AA5P	Q58FG0	334 aa		4.55	□□□□□ -1.68
POLR1C-208	ENST00000488601	GAGE2A	Q6NT46	116 aa		4.55	□□□□□ -1.68
POLR1C-208	ENST00000488601	ZBTB49	Q6ZSB9	765 aa		4.55	□□□□□ -1.68
POLR1C-208	ENST00000488601	TUBA1A	Q71U36	451 aa		4.55	□□□□□ -1.68
POLR1C-208	ENST00000488601	THOC6	Q86W42	341 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
POLR1C-208	ENST00000488601	OR51G2	Q8NGK0	314 aa		4.55	□□□□□ -1.68
POLR1C-208	ENST00000488601	OR6Q1	Q8NGQ2	317 aa		4.55	□□□□□ -1.68
POLR1C-208	ENST00000488601	MAGEE2	Q8TD90	523 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
POLR1C-208	ENST00000488601	SLC5A11	Q8WWX8	675 aa		4.55	□□□□□ -1.68
POLR1C-208	ENST00000488601	NEIL2	Q969S2	332 aa		4.55	□□□□□ -1.68
POLR1C-208	ENST00000488601	SPDL1	Q96EA4	605 aa		4.55	□□□□□ -1.68
POLR1C-208	ENST00000488601	LINGO1	Q96FE5	620 aa		4.55	□□□□□ -1.68
POLR1C-208	ENST00000488601	VPS39	Q96JC1	886 aa		4.55	□□□□□ -1.68
POLR1C-208	ENST00000488601	LYZL4	Q96KX0	146 aa		4.55	□□□□□ -1.68
POLR1C-208	ENST00000488601	RNF145	Q96MT1	663 aa		4.55	□□□□□ -1.68
POLR1C-208	ENST00000488601	ZNF582	Q96NG8	517 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
POLR1C-208	ENST00000488601	OR4K3	Q96R72	315 aa		4.55	□□□□□ -1.68
POLR1C-208	ENST00000488601	NDN	Q99608	321 aa		4.55	□□□□□ -1.68
POLR1C-208	ENST00000488601	COQ10B	Q9H8M1	238 aa		4.55	□□□□□ -1.68
POLR1C-208	ENST00000488601	PELI2	Q9HAT8	420 aa		4.55	□□□□□ -1.68
POLR1C-208	ENST00000488601	LYRM4	Q9HD34	91 aa		4.55	□□□□□ -1.68
POLR1C-208	ENST00000488601	IARS2	Q9NSE4	1012 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
POLR1C-208	ENST00000488601	SLCO1C1	Q9NYB5	712 aa		4.55	□□□□□ -1.68
POLR1C-208	ENST00000488601	ZKSCAN7	Q9P0L1	754 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
POLR1C-208	ENST00000488601	C11orf21	Q9P2W6	132 aa		4.55	□□□□□ -1.68
POLR1C-208	ENST00000488601	GAGE2D	Q9UEU5	116 aa		4.55	□□□□□ -1.68
POLR1C-208	ENST00000488601	GPR98	Q8WXG9	6306 aa		4.55	□□□□□ -1.68
POLR1C-208	ENST00000488601	FCGBP	Q9Y6R7	5405 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
POLR1C-208	ENST00000488601	IGLV2-18	A0A075B6J9	118 aa		4.54	□□□□□ -1.68
POLR1C-208	ENST00000488601		A0A087WZY1	265 aa		4.54	□□□□□ -1.68
POLR1C-208	ENST00000488601	ZCWPW2	A0A1B0GU75	182 aa		4.54	□□□□□ -1.68
POLR1C-208	ENST00000488601	LRIT2	A6NDA9	550 aa		4.54	□□□□□ -1.68
POLR1C-208	ENST00000488601	SCO2	O43819	266 aa		4.54	□□□□□ -1.68
POLR1C-208	ENST00000488601	TSPAN2	O60636	221 aa		4.54	□□□□□ -1.68
POLR1C-208	ENST00000488601	GLRA3	O75311	464 aa		4.54	□□□□□ -1.68
POLR1C-208	ENST00000488601	GAGE7	O76087	117 aa		4.54	□□□□□ -1.68
POLR1C-208	ENST00000488601	IGHV1-46	P01743	117 aa		4.54	□□□□□ -1.68
POLR1C-208	ENST00000488601	KRT14	P02533	472 aa		4.54	□□□□□ -1.68
POLR1C-208	ENST00000488601	IFNA4	P05014	189 aa		4.54	□□□□□ -1.68
POLR1C-208	ENST00000488601	GAGE12F	P0CL80	117 aa		4.54	□□□□□ -1.68
POLR1C-208	ENST00000488601	GAGE12G	P0CL81	117 aa		4.54	□□□□□ -1.68
POLR1C-208	ENST00000488601	GAGE12I	P0CL82	117 aa		4.54	□□□□□ -1.68
POLR1C-208	ENST00000488601	C1GALT1C1L	P0DN25	315 aa		4.54	□□□□□ -1.68
POLR1C-208	ENST00000488601	ZNF35	P13682	527 aa		4.54	□□□□□ -1.68
POLR1C-208	ENST00000488601	S1PR1	P21453	382 aa		4.54	□□□□□ -1.68
POLR1C-208	ENST00000488601	AZGP1	P25311	298 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
POLR1C-208	ENST00000488601	SLC1A2	P43004	574 aa		4.54	□□□□□ -1.68
POLR1C-208	ENST00000488601	PLA2G16	P53816	162 aa		4.54	□□□□□ -1.68
POLR1C-208	ENST00000488601	ARF6	P62330	175 aa		4.54	□□□□□ -1.68
POLR1C-208	ENST00000488601	TGM3	Q08188	693 aa		4.54	□□□□□ -1.68
POLR1C-208	ENST00000488601	GAGE1	Q13065	139 aa		4.54	□□□□□ -1.68
POLR1C-208	ENST00000488601	GAGE4	Q13068	117 aa		4.54	□□□□□ -1.68
POLR1C-208	ENST00000488601	TSPO2	Q5TGU0	170 aa		4.54	□□□□□ -1.68
POLR1C-208	ENST00000488601	ZCCHC12	Q6PEW1	402 aa		4.54	□□□□□ -1.68
POLR1C-208	ENST00000488601	TMIGD1	Q6UXZ0	262 aa		4.54	□□□□□ -1.68
POLR1C-208	ENST00000488601	NPSR1	Q6W5P4	371 aa		4.54	□□□□□ -1.68
POLR1C-208	ENST00000488601	ZNF841	Q6ZN19	808 aa		4.54	□□□□□ -1.68
POLR1C-208	ENST00000488601	VMO1	Q7Z5L0	202 aa		4.54	□□□□□ -1.68
POLR1C-208	ENST00000488601	LYG2	Q86SG7	212 aa		4.54	□□□□□ -1.68
POLR1C-208	ENST00000488601	KLHDC8A	Q8IYD2	350 aa		4.54	□□□□□ -1.68
POLR1C-208	ENST00000488601	C1orf52	Q8N6N3	182 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
POLR1C-208	ENST00000488601	TTL	Q8NG68	377 aa		4.54	□□□□□ -1.68
POLR1C-208	ENST00000488601	OR8B3	Q8NGG8	313 aa		4.54	□□□□□ -1.68
POLR1C-208	ENST00000488601	OR8U1	Q8NH10	309 aa		4.54	□□□□□ -1.68
POLR1C-208	ENST00000488601	OR52I2	Q8NH67	350 aa		4.54	□□□□□ -1.68
POLR1C-208	ENST00000488601	SLC38A5	Q8WUX1	472 aa		4.54	□□□□□ -1.68
POLR1C-208	ENST00000488601	BCL2L2	Q92843	193 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68

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