RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449489.5

RBM39-218, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 5

Gene RBM39, Length 432 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-218ENST00000449489 OR2H1Q9GZK4 316 aa5.97□□□□□ -1.45
RBM39-218ENST00000449489 FAM234AQ9H0X4 552 aa5.97□□□□□ -1.45
RBM39-218ENST00000449489 PCDHAC1Q9H158 963 aa5.97□□□□□ -1.45
RBM39-218ENST00000449489 WNT5BQ9H1J7 359 aa5.97□□□□□ -1.45
RBM39-218ENST00000449489 EVA1AQ9H8M9 152 aa5.97□□□□□ -1.45
RBM39-218ENST00000449489 TRIM36Q9NQ86 728 aa5.97□□□□□ -1.45
RBM39-218ENST00000449489 SELENONQ9NZV5 590 aa5.97□□□□□ -1.45
RBM39-218ENST00000449489 ZIM2Q9NZV7 527 aa5.97□□□□□ -1.45
RBM39-218ENST00000449489 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
RBM39-218ENST00000449489 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
RBM39-218ENST00000449489 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa5.97□□□□□ -1.45
RBM39-218ENST00000449489 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa5.97□□□□□ -1.45
RBM39-218ENST00000449489 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa5.97□□□□□ -1.45
RBM39-218ENST00000449489 SORL1Q92673 2214 aa5.97□□□□□ -1.45
RBM39-218ENST00000449489 A0A1W2PPM1 405 aa5.96□□□□□ -1.46
RBM39-218ENST00000449489 TMEM247A6NEH6 219 aa5.96□□□□□ -1.46
RBM39-218ENST00000449489 LRRN3E7EW58 273 aa5.96□□□□□ -1.46
RBM39-218ENST00000449489 E9PBE3 544 aa5.96□□□□□ -1.46
RBM39-218ENST00000449489 C11orf98E9PRG8 122 aa5.96□□□□□ -1.46
RBM39-218ENST00000449489 SERPINI2O75830 405 aa5.96□□□□□ -1.46
RBM39-218ENST00000449489 ABHD16AO95870 558 aa5.96□□□□□ -1.46
RBM39-218ENST00000449489 OPN1SWP03999 348 aa5.96□□□□□ -1.46
RBM39-218ENST00000449489 BCHEP06276 602 aa5.96□□□□□ -1.46
RBM39-218ENST00000449489 CST2P09228 141 aa5.96□□□□□ -1.46
RBM39-218ENST00000449489 CD28P10747 220 aa5.96□□□□□ -1.46
RBM39-218ENST00000449489 NR2C1P13056 603 aa5.96□□□□□ -1.46
RBM39-218ENST00000449489 IRF2P14316 349 aa5.96□□□□□ -1.46
RBM39-218ENST00000449489 ETS2P15036 469 aa5.96□□□□□ -1.46
RBM39-218ENST00000449489 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
RBM39-218ENST00000449489 S100A3P33764 101 aa5.96□□□□□ -1.46
RBM39-218ENST00000449489 PMELP40967 661 aa5.96□□□□□ -1.46
RBM39-218ENST00000449489 CLRN1P58418 232 aa5.96□□□□□ -1.46
RBM39-218ENST00000449489 ACSM1Q08AH1 577 aa5.96□□□□□ -1.46
RBM39-218ENST00000449489 FBXW12Q6X9E4 464 aa5.96□□□□□ -1.46
RBM39-218ENST00000449489 ZNF621Q6ZSS3 439 aa5.96□□□□□ -1.46
RBM39-218ENST00000449489 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
RBM39-218ENST00000449489 RNF144BQ7Z419 303 aa5.96□□□□□ -1.46
RBM39-218ENST00000449489 LINC00482Q8N8I6 264 aa5.96□□□□□ -1.46
RBM39-218ENST00000449489 ATG16L2Q8NAA4 619 aa5.96□□□□□ -1.46
RBM39-218ENST00000449489 NOXO1Q8NFA2 376 aa5.96□□□□□ -1.46
RBM39-218ENST00000449489 OR8G5Q8NG78 346 aa5.96□□□□□ -1.46
RBM39-218ENST00000449489 AKR7LQ8NHP1 331 aa5.96□□□□□ -1.46
RBM39-218ENST00000449489 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
RBM39-218ENST00000449489 TMEM19Q96HH6 336 aa5.96□□□□□ -1.46
RBM39-218ENST00000449489 CLPTM1LQ96KA5 538 aa5.96□□□□□ -1.46
RBM39-218ENST00000449489 ZNF347Q96SE7 839 aa5.96□□□□□ -1.46
RBM39-218ENST00000449489 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa5.96□□□□□ -1.46
RBM39-218ENST00000449489 TMEM27Q9HBJ8 222 aa5.96□□□□□ -1.46
RBM39-218ENST00000449489 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa5.96□□□□□ -1.46
RBM39-218ENST00000449489 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
RBM39-218ENST00000449489 CTSZQ9UBR2 303 aa5.96□□□□□ -1.46
RBM39-218ENST00000449489 KMT2AQ03164 3969 aa5.96□□□□□ -1.46
RBM39-218ENST00000449489 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa5.95□□□□□ -1.46
RBM39-218ENST00000449489 NPIPB13A6NJU9 1138 aa5.95□□□□□ -1.46
RBM39-218ENST00000449489 NPIPB4C9JG80 1138 aa5.95□□□□□ -1.46
RBM39-218ENST00000449489 COPEO14579 308 aa5.95□□□□□ -1.46
RBM39-218ENST00000449489 NPFFO15130 113 aa5.95□□□□□ -1.46
RBM39-218ENST00000449489 RNF13O43567 381 aa5.95□□□□□ -1.46
RBM39-218ENST00000449489 ANGPTL7O43827 346 aa5.95□□□□□ -1.46
RBM39-218ENST00000449489 PAHP00439 452 aa5.95□□□□□ -1.46
RBM39-218ENST00000449489 ZCCHC18P0CG32 403 aa5.95□□□□□ -1.46
RBM39-218ENST00000449489 VSIG10L2P0DP72 767 aa5.95□□□□□ -1.46
RBM39-218ENST00000449489 ETFAP13804 333 aa5.95□□□□□ -1.46
RBM39-218ENST00000449489 ECHS1P30084 290 aa5.95□□□□□ -1.46
RBM39-218ENST00000449489 CDKN2CP42773 168 aa5.95□□□□□ -1.46
RBM39-218ENST00000449489 UBE2E1P51965 193 aa5.95□□□□□ -1.46
RBM39-218ENST00000449489 DSTNP60981 165 aa5.95□□□□□ -1.46
RBM39-218ENST00000449489 MELKQ14680 651 aa5.95□□□□□ -1.46
RBM39-218ENST00000449489 OR1Q1Q15612 314 aa5.95□□□□□ -1.46
RBM39-218ENST00000449489 ZNF74Q16587 644 aa5.95□□□□□ -1.46
RBM39-218ENST00000449489 FAM201AQ5SY85 155 aa5.95□□□□□ -1.46
RBM39-218ENST00000449489 C8orf74Q6P047 294 aa5.95□□□□□ -1.46
RBM39-218ENST00000449489 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa5.95□□□□□ -1.46
RBM39-218ENST00000449489 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa5.95□□□□□ -1.46
RBM39-218ENST00000449489 BTN2A1Q7KYR7 527 aa5.95□□□□□ -1.46
RBM39-218ENST00000449489 VMO1Q7Z5L0 202 aa5.95□□□□□ -1.46
RBM39-218ENST00000449489 MOGAT3Q86VF5 341 aa5.95□□□□□ -1.46
RBM39-218ENST00000449489 LYG1Q8N1E2 194 aa5.95□□□□□ -1.46
RBM39-218ENST00000449489 C10orf53Q8N6V4 93 aa5.95□□□□□ -1.46
RBM39-218ENST00000449489 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa5.95□□□□□ -1.46
RBM39-218ENST00000449489 LY6G5BQ8NDX9 201 aa5.95□□□□□ -1.46
RBM39-218ENST00000449489 BBS10Q8TAM1 723 aa5.95□□□□□ -1.46
RBM39-218ENST00000449489 FNDC8Q8TC99 324 aa5.95□□□□□ -1.46
RBM39-218ENST00000449489 SLC7A13Q8TCU3 470 aa5.95□□□□□ -1.46
RBM39-218ENST00000449489 DPF1Q92782 380 aa5.95□□□□□ -1.46
RBM39-218ENST00000449489 ZNF583Q96ND8 569 aa5.95□□□□□ -1.46
RBM39-218ENST00000449489 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
RBM39-218ENST00000449489 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
RBM39-218ENST00000449489 CDCA4Q9BXL8 241 aa5.95□□□□□ -1.46
RBM39-218ENST00000449489 MEGF9Q9H1U4 602 aa5.95□□□□□ -1.46
RBM39-218ENST00000449489 NANSQ9NR45 359 aa5.95□□□□□ -1.46
RBM39-218ENST00000449489 SERTAD4Q9NUC0 356 aa5.95□□□□□ -1.46
RBM39-218ENST00000449489 KAAG1Q9UBP8 84 aa5.95□□□□□ -1.46
RBM39-218ENST00000449489 ZNF229Q9UJW7 825 aa5.95□□□□□ -1.46
RBM39-218ENST00000449489 STARD10Q9Y365 291 aa5.95□□□□□ -1.46
RBM39-218ENST00000449489 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
RBM39-218ENST00000449489 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa5.94□□□□□ -1.46
RBM39-218ENST00000449489 A0A1W2PRG6 482 aa5.94□□□□□ -1.46
RBM39-218ENST00000449489 H3BUX3 64 aa5.94□□□□□ -1.46
RBM39-218ENST00000449489 LGALS8O00214 317 aa5.94□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 80.5 ms