RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393655.3

TFAP2B-202, Transcript of transcription factor AP-2 beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TFAP2B, Length 5,773 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAP2B-202ENST00000393655 ELLP55199 621 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
TFAP2B-202ENST00000393655 HTR4Q13639 388 aa14.65□□□□□ -0.06
TFAP2B-202ENST00000393655 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
TFAP2B-202ENST00000393655 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa14.65□□□□□ -0.06
TFAP2B-202ENST00000393655 SLC39A7Q92504 469 aa14.65□□□□□ -0.06
TFAP2B-202ENST00000393655 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa14.65□□□□□ -0.06
TFAP2B-202ENST00000393655 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
TFAP2B-202ENST00000393655 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
TFAP2B-202ENST00000393655 PCK2Q16822 640 aa14.65□□□□□ -0.06
TFAP2B-202ENST00000393655 NOXO1Q8NFA2 376 aa14.65□□□□□ -0.06
TFAP2B-202ENST00000393655 OR5M9Q8NGP3 310 aa14.65□□□□□ -0.06
TFAP2B-202ENST00000393655 OR2G3Q8NGZ4 309 aa14.65□□□□□ -0.06
TFAP2B-202ENST00000393655 SOX7Q9BT81 388 aa14.65□□□□□ -0.06
TFAP2B-202ENST00000393655 TUBB1Q9H4B7 451 aa14.65□□□□□ -0.06
TFAP2B-202ENST00000393655 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
TFAP2B-202ENST00000393655 WBP1LQ9NX94 342 aa14.65□□□□□ -0.06
TFAP2B-202ENST00000393655 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
TFAP2B-202ENST00000393655 LAMP3Q9UQV4 416 aa14.65□□□□□ -0.06
TFAP2B-202ENST00000393655 APEHP13798 732 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
TFAP2B-202ENST00000393655 SRP14P37108 136 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
TFAP2B-202ENST00000393655 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
TFAP2B-202ENST00000393655 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa14.65□□□□□ -0.06
TFAP2B-202ENST00000393655 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa14.64□□□□□ -0.07
TFAP2B-202ENST00000393655 XKRY2A2RUG3 117 aa14.64□□□□□ -0.07
TFAP2B-202ENST00000393655 AIPO00170 330 aa14.64□□□□□ -0.07
TFAP2B-202ENST00000393655 GPR37O15354 613 aa14.64□□□□□ -0.07
TFAP2B-202ENST00000393655 ADIRFQ15847 76 aa14.64□□□□□ -0.07
TFAP2B-202ENST00000393655 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa14.64□□□□□ -0.07
TFAP2B-202ENST00000393655 OR10G3Q8NGC4 313 aa14.64□□□□□ -0.07
TFAP2B-202ENST00000393655 OLIG1Q8TAK6 271 aa14.64□□□□□ -0.07
TFAP2B-202ENST00000393655 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
TFAP2B-202ENST00000393655 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
TFAP2B-202ENST00000393655 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
TFAP2B-202ENST00000393655 C7orf72A4D263 438 aa14.64□□□□□ -0.07
TFAP2B-202ENST00000393655 SULT1C4O75897 302 aa14.64□□□□□ -0.07
TFAP2B-202ENST00000393655 B4GALT1P15291 398 aa14.64□□□□□ -0.07
TFAP2B-202ENST00000393655 EMDP50402 254 aa14.64□□□□□ -0.07
TFAP2B-202ENST00000393655 ZNF385BQ569K4 471 aa14.64□□□□□ -0.07
TFAP2B-202ENST00000393655 ALKAL2Q6UX46 152 aa14.64□□□□□ -0.07
TFAP2B-202ENST00000393655 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
TFAP2B-202ENST00000393655 BCL2L10Q9HD36 194 aa14.64□□□□□ -0.07
TFAP2B-202ENST00000393655 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa14.64□□□□□ -0.07
TFAP2B-202ENST00000393655 OR5G3P0C626 314 aa14.64□□□□□ -0.07
TFAP2B-202ENST00000393655 CTRB1P17538 263 aa14.64□□□□□ -0.07
TFAP2B-202ENST00000393655 HAAOP46952 286 aa14.64□□□□□ -0.07
TFAP2B-202ENST00000393655 DHODHQ02127 395 aa14.64□□□□□ -0.07
TFAP2B-202ENST00000393655 CTRB2Q6GPI1 263 aa14.64□□□□□ -0.07
TFAP2B-202ENST00000393655 DHRS13Q6UX07 377 aa14.64□□□□□ -0.07
TFAP2B-202ENST00000393655 TMEM99Q8N816 258 aa14.64□□□□□ -0.07
TFAP2B-202ENST00000393655 SARGQ9BW04 601 aa14.64□□□□□ -0.07
TFAP2B-202ENST00000393655 ACER3Q9NUN7 267 aa14.64□□□□□ -0.07
TFAP2B-202ENST00000393655 MYH10P35580 1976 aa14.64□□□□□ -0.07
TFAP2B-202ENST00000393655 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa14.64□□□□□ -0.07
TFAP2B-202ENST00000393655 ARNTP27540 789 aa14.64□□□□□ -0.07
TFAP2B-202ENST00000393655 C17orf107Q6ZR85 190 aa14.64□□□□□ -0.07
TFAP2B-202ENST00000393655 MED29Q9NX70 200 aa14.64□□□□□ -0.07
TFAP2B-202ENST00000393655 ONECUT1Q9UBC0 465 aa14.64□□□□□ -0.07
TFAP2B-202ENST00000393655 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa14.64□□□□□ -0.07
TFAP2B-202ENST00000393655 MAST2Q6P0Q8 1798 aa14.64□□□□□ -0.07
TFAP2B-202ENST00000393655 NDUFA6P56556 154 aa14.64□□□□□ -0.07
TFAP2B-202ENST00000393655 SLC51BQ86UW2 128 aa14.64□□□□□ -0.07
TFAP2B-202ENST00000393655 C17orf78Q8N4C9 275 aa14.64□□□□□ -0.07
TFAP2B-202ENST00000393655 YIPF5Q969M3 257 aa14.64□□□□□ -0.07
TFAP2B-202ENST00000393655 WDR1O75083 606 aa14.63□□□□□ -0.07
TFAP2B-202ENST00000393655 ALOX5APP20292 161 aa14.63□□□□□ -0.07
TFAP2B-202ENST00000393655 RELAQ04206 551 aa14.63□□□□□ -0.07
TFAP2B-202ENST00000393655 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
TFAP2B-202ENST00000393655 IL21Q9HBE4 155 aa14.63□□□□□ -0.07
TFAP2B-202ENST00000393655 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
TFAP2B-202ENST00000393655 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
TFAP2B-202ENST00000393655 UPK1AO00322 258 aa14.63□□□□□ -0.07
TFAP2B-202ENST00000393655 MEOX1P50221 254 aa14.63□□□□□ -0.07
TFAP2B-202ENST00000393655 ALKBH6Q3KRA9 238 aa14.63□□□□□ -0.07
TFAP2B-202ENST00000393655 MAVSQ7Z434 540 aa14.63□□□□□ -0.07
TFAP2B-202ENST00000393655 NRARPQ7Z6K4 114 aa14.63□□□□□ -0.07
TFAP2B-202ENST00000393655 OR10AD1Q8NGE0 317 aa14.63□□□□□ -0.07
TFAP2B-202ENST00000393655 HES4Q9HCC6 221 aa14.63□□□□□ -0.07
TFAP2B-202ENST00000393655 CLEC2DQ9UHP7 191 aa14.63□□□□□ -0.07
TFAP2B-202ENST00000393655 SSC5DA1L4H1 1573 aa14.63□□□□□ -0.07
TFAP2B-202ENST00000393655 POM121CA8CG34 1229 aa14.63□□□□□ -0.07
TFAP2B-202ENST00000393655 ACOT8O14734 319 aa14.63□□□□□ -0.07
TFAP2B-202ENST00000393655 APEX1P27695 318 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
TFAP2B-202ENST00000393655 SYS1Q8N2H4 156 aa14.63□□□□□ -0.07
TFAP2B-202ENST00000393655 OR10P1Q8NGE3 313 aa14.63□□□□□ -0.07
TFAP2B-202ENST00000393655 OR51S1Q8NGJ8 323 aa14.63□□□□□ -0.07
TFAP2B-202ENST00000393655 ZNF251Q9BRH9 671 aa14.63□□□□□ -0.07
TFAP2B-202ENST00000393655 NDUFB11Q9NX14 153 aa14.63□□□□□ -0.07
TFAP2B-202ENST00000393655 RGPD1P0DJD0 1748 aa14.63□□□□□ -0.07
TFAP2B-202ENST00000393655 FUT6P51993 359 aa14.63□□□□□ -0.07
TFAP2B-202ENST00000393655 DLEU7Q6UYE1 221 aa14.63□□□□□ -0.07
TFAP2B-202ENST00000393655 BPIFCQ8NFQ6 507 aa14.63□□□□□ -0.07
TFAP2B-202ENST00000393655 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
TFAP2B-202ENST00000393655 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
TFAP2B-202ENST00000393655 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa14.62□□□□□ -0.07
TFAP2B-202ENST00000393655 FITM1A5D6W6 292 aa14.62□□□□□ -0.07
TFAP2B-202ENST00000393655 ZFP92A6NM28 416 aa14.62□□□□□ -0.07
TFAP2B-202ENST00000393655 SPRY3O43610 288 aa14.62□□□□□ -0.07
TFAP2B-202ENST00000393655 SSPNQ14714 243 aa14.62□□□□□ -0.07
TFAP2B-202ENST00000393655 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
TFAP2B-202ENST00000393655 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.8 ms