RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372616.1

CTPS1-201, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTPS1, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF285Q96NJ3 590 aa6.45□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 NRIP2Q9BQI9 281 aa6.45□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 WDR76Q9H967 626 aa6.45□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa6.45□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 DNAJB11Q9UBS4 358 aa6.45□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 SHPKQ9UHJ6 478 aa6.45□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 MEMO1Q9Y316 297 aa6.45□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 OR10H1Q9Y4A9 318 aa6.45□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa6.45□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa6.45□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 A0A1W2PPC4 97 aa6.45□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 POM121BA6NF01 834 aa6.45□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 OR4C45A6NMZ5 311 aa6.45□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 SCAMP1O15126 338 aa6.45□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 RENP00797 406 aa6.45□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 MAS1P04201 325 aa6.45□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 CRHP06850 196 aa6.45□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 CD14P08571 375 aa6.45□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 MYF5P13349 255 aa6.45□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 ADRA2CP18825 462 aa6.45□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 FUT1P19526 365 aa6.45□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 FSTP19883 344 aa6.45□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 ZBTB25P24278 435 aa6.45□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 HOXA6P31267 233 aa6.45□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 PTGFRP43088 359 aa6.45□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 BLKP51451 505 aa6.45□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 F2RL1P55085 397 aa6.45□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 RAB1AP62820 205 aa6.45□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 ZXDAP98168 799 aa6.45□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 SIGLEC14Q08ET2 396 aa6.45□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF750Q32MQ0 723 aa6.45□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 ACTBL2Q562R1 376 aa6.45□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 ARHGAP40Q5TG30 622 aa6.45□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 NKAIN2Q5VXU1 208 aa6.45□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF425Q6IV72 752 aa6.45□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa6.45□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 CDC20BQ86Y33 519 aa6.45□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 RFLNBQ8N5W9 214 aa6.45□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa6.45□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 GRHL3Q8TE85 626 aa6.45□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 LIPHQ8WWY8 451 aa6.45□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 RSC1A1Q92681 617 aa6.45□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 SEH1LQ96EE3 360 aa6.45□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF75AQ96N20 296 aa6.45□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 OR5B2Q96R09 309 aa6.45□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 OR2M4Q96R27 311 aa6.45□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 GPR174Q9BXC1 333 aa6.45□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 TLNRD1Q9H1K6 362 aa6.45□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa6.45□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 SYNPO2LQ9H987 977 aa6.45□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 NIT2Q9NQR4 276 aa6.45□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa6.45□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 DOCK9Q9BZ29 2069 aa6.45□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 A0A087WUJ7 227 aa6.44□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 C2orf74A8MZ97 194 aa6.44□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 DOK2O60496 412 aa6.44□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 NKX2-2O95096 273 aa6.44□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 TXNDC12O95881 172 aa6.44□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 IGHV4-34P06331 123 aa6.44□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 FBP1P09467 338 aa6.44□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 ADCYAP1P18509 176 aa6.44□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 CD27P26842 260 aa6.44□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 GLP1RP43220 463 aa6.44□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 KCNJ3P48549 501 aa6.44□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 PGDP52209 483 aa6.44□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 RAB2AP61019 212 aa6.44□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 FHL1Q13642 323 aa6.44□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 MELKQ14680 651 aa6.44□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 C2orf76Q3KRA6 126 aa6.44□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 FHL5Q5TD97 284 aa6.44□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 TMEM244Q5VVB8 128 aa6.44□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 OR10K2Q6IF99 312 aa6.44□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 CORO6Q6QEF8 472 aa6.44□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 HIST2H3AQ71DI3 136 aa6.44□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 WDSUB1Q8N9V3 476 aa6.44□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 OR51D1Q8NGF3 324 aa6.44□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 OR8S1Q8NH09 359 aa6.44□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 NANPQ8TBE9 248 aa6.44□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 DCUN1D4Q92564 292 aa6.44□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 MALSU1Q96EH3 234 aa6.44□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 SMIM8Q96KF7 97 aa6.44□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 BMFQ96LC9 184 aa6.44□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 NMNAT3Q96T66 252 aa6.44□□□□□ -1.38
CTPS1-201ENST00000372616 MAP3K3Q99759 626 aa6.44□□□□□ -1.38
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