RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368202.4

PTPRK-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 526 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-201ENST00000368202 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 SHANK1Q9Y566 2161 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 CACNA1GO43497 2377 aa10.62□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa10.62□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 ACOD1A6NK06 481 aa10.62□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 C16orf97H3BN30 126 aa10.62□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 PRB1P04280 392 aa10.62□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 CD1AP06126 327 aa10.62□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 CBR1P16152 277 aa10.62□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 GADD45AP24522 165 aa10.62□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 STOMP27105 288 aa10.62□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 APEX1P27695 318 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 TGFBR2P37173 567 aa10.62□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 UQCRFS1P47985 274 aa10.62□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 MMP16P51512 607 aa10.62□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 RPS25P62851 125 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 ODF4Q2M2E3 257 aa10.62□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 YIF1BQ5BJH7 314 aa10.62□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 WDR38Q5JTN6 314 aa10.62□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 TMEM244Q5VVB8 128 aa10.62□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa10.62□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 FAM57BQ71RH2 274 aa10.62□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 SSX8Q7RTT4 187 aa10.62□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 CATSPERDQ86XM0 798 aa10.62□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 ZGRF1Q86YA3 2104 aa10.62□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 THRSPQ92748 146 aa10.62□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 GHSRQ92847 366 aa10.62□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 S100PBPQ96BU1 408 aa10.62□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 C4orf45Q96LM5 186 aa10.62□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa10.62□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 ACTR6Q9GZN1 396 aa10.62□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 PBOV1Q9GZY1 135 aa10.62□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 CDH20Q9HBT6 801 aa10.62□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 JKAMPQ9P055 326 aa10.62□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 ENPP5Q9UJA9 477 aa10.62□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF281Q9Y2X9 895 aa10.62□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 CACNA1BQ00975 2339 aa10.61□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 C5orf49A4QMS7 147 aa10.61□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 A6NHS1 94 aa10.61□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 AGFG2O95081 481 aa10.61□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 LCATP04180 440 aa10.61□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 SERPINA5P05154 406 aa10.61□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 SLC2A1P11166 492 aa10.61□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 NR4A1P22736 598 aa10.61□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 ADORA2A-AS1P86434 159 aa10.61□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 FAM27E3Q08E93 113 aa10.61□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 PPA1Q15181 289 aa10.61□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 ALKBH2Q6NS38 261 aa10.61□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 PAMR1Q6UXH9 720 aa10.61□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa10.61□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF843Q8N446 348 aa10.61□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 WDR31Q8NA23 367 aa10.61□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 SLC30A7Q8NEW0 376 aa10.61□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 HSD17B8Q92506 261 aa10.61□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 SLC7A6Q92536 515 aa10.61□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 ISOC1Q96CN7 298 aa10.61□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 KCNS3Q9BQ31 491 aa10.61□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa10.61□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 BCL7BQ9BQE9 202 aa10.61□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 OR10A2Q9H208 303 aa10.61□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 OR10A4Q9H209 315 aa10.61□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 OR51E2Q9H255 320 aa10.61□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 SLC24A3Q9HC58 644 aa10.61□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 KCNJ16Q9NPI9 418 aa10.61□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 FAM206AQ9NX38 181 aa10.61□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 B3GNT2Q9NY97 397 aa10.61□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 SLC22A13Q9Y226 551 aa10.61□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 CEPT1Q9Y6K0 416 aa10.61□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 BSNQ9UPA5 3926 aa10.6□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 A0A1B0GVI7 797 aa10.6□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa10.6□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 GABRPO00591 440 aa10.6□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 ZFPL1O95159 310 aa10.6□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 GABARAPO95166 117 aa10.6□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 PNPP00491 289 aa10.6□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 DBHP09172 617 aa10.6□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 ACSM4P0C7M7 580 aa10.6□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 PPP3CBP16298 524 aa10.6□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF12P17014 697 aa10.6□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 GALP22466 123 aa10.6□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 CRYGSP22914 178 aa10.6□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 UGT2B10P36537 528 aa10.6□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 KIR3DL2P43630 455 aa10.6□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 LSM3P62310 102 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 DOC2BQ14184 412 aa10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.7 ms