RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326294.3

PTPRCAP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRCAP, Length 1,292 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAP-201ENST00000326294 POU1F1P28069 291 aa16.61■□□□□ 0.25
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMEM33P57088 247 aa16.61■□□□□ 0.25
PTPRCAP-201ENST00000326294 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
PTPRCAP-201ENST00000326294 PCK2Q16822 640 aa16.61■□□□□ 0.25
PTPRCAP-201ENST00000326294 SPRNQ5BIV9 151 aa16.61■□□□□ 0.25
PTPRCAP-201ENST00000326294 ACSM5Q6NUN0 579 aa16.61■□□□□ 0.25
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC27A4Q6P1M0 643 aa16.61■□□□□ 0.25
PTPRCAP-201ENST00000326294 FBXW12Q6X9E4 464 aa16.61■□□□□ 0.25
PTPRCAP-201ENST00000326294 Q6ZR03 302 aa16.61■□□□□ 0.25
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF511Q8NB15 262 aa16.61■□□□□ 0.25
PTPRCAP-201ENST00000326294 HPS1Q92902 700 aa16.61■□□□□ 0.25
PTPRCAP-201ENST00000326294 PTP4A1Q93096 173 aa16.61■□□□□ 0.25
PTPRCAP-201ENST00000326294 HAVCR1Q96D42 359 aa16.61■□□□□ 0.25
PTPRCAP-201ENST00000326294 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa16.61■□□□□ 0.25
PTPRCAP-201ENST00000326294 MED20Q9H944 212 aa16.61■□□□□ 0.25
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF556Q9HAH1 456 aa16.61■□□□□ 0.25
PTPRCAP-201ENST00000326294 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa16.61■□□□□ 0.25
PTPRCAP-201ENST00000326294 F5H5K5 113 aa16.6■□□□□ 0.25
PTPRCAP-201ENST00000326294 WNT9BO14905 357 aa16.6■□□□□ 0.25
PTPRCAP-201ENST00000326294 PPIHO43447 177 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
PTPRCAP-201ENST00000326294 SPARCP09486 303 aa16.6■□□□□ 0.25
PTPRCAP-201ENST00000326294 FMO3P31513 532 aa16.6■□□□□ 0.25
PTPRCAP-201ENST00000326294 ENTPD1P49961 510 aa16.6■□□□□ 0.25
PTPRCAP-201ENST00000326294 CDK5R2Q13319 367 aa16.6■□□□□ 0.25
PTPRCAP-201ENST00000326294 CCNIQ14094 377 aa16.6■□□□□ 0.25
PTPRCAP-201ENST00000326294 GINS1Q14691 196 aa16.6■□□□□ 0.25
PTPRCAP-201ENST00000326294 C1orf146Q5VVC0 180 aa16.6■□□□□ 0.25
PTPRCAP-201ENST00000326294 PRIMA1Q86XR5 153 aa16.6■□□□□ 0.25
PTPRCAP-201ENST00000326294 HIPK1Q86Z02 1210 aa16.6■□□□□ 0.25
PTPRCAP-201ENST00000326294 ATG16L2Q8NAA4 619 aa16.6■□□□□ 0.25
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR6K6Q8NGW6 343 aa16.6■□□□□ 0.25
PTPRCAP-201ENST00000326294 CLDND2Q8NHS1 167 aa16.6■□□□□ 0.25
PTPRCAP-201ENST00000326294 NRBF2Q96F24 287 aa16.6■□□□□ 0.25
PTPRCAP-201ENST00000326294 ELMOD3Q96FG2 381 aa16.6■□□□□ 0.25
PTPRCAP-201ENST00000326294 DIRC2Q96SL1 478 aa16.6■□□□□ 0.25
PTPRCAP-201ENST00000326294 NARFLQ9H6Q4 476 aa16.6■□□□□ 0.25
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMEM160Q9NX00 188 aa16.6■□□□□ 0.25
PTPRCAP-201ENST00000326294 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa16.59■□□□□ 0.25
PTPRCAP-201ENST00000326294 IGFBP5P24593 272 aa16.59■□□□□ 0.25
PTPRCAP-201ENST00000326294 ATP6AP1Q15904 470 aa16.59■□□□□ 0.25
PTPRCAP-201ENST00000326294 TEX30Q5JUR7 227 aa16.59■□□□□ 0.25
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM166AQ6J272 317 aa16.59■□□□□ 0.25
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAHD1Q6P587 224 aa16.59■□□□□ 0.25
PTPRCAP-201ENST00000326294 DCXRQ7Z4W1 244 aa16.59■□□□□ 0.25
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR5L1Q8NGL2 311 aa16.59■□□□□ 0.25
PTPRCAP-201ENST00000326294 C1orf159Q96HA4 380 aa16.59■□□□□ 0.25
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC25A19Q9HC21 320 aa16.59■□□□□ 0.25
PTPRCAP-201ENST00000326294 M0R135 149 aa16.58■□□□□ 0.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 SURF4O15260 269 aa16.58■□□□□ 0.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 ANOS1P23352 680 aa16.58■□□□□ 0.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 BLVRAP53004 296 aa16.58■□□□□ 0.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 CDK5Q00535 292 aa16.58■□□□□ 0.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 AVPI1Q5T686 147 aa16.58■□□□□ 0.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR2T2Q6IF00 324 aa16.58■□□□□ 0.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 ASRGL1Q7L266 308 aa16.58■□□□□ 0.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 NAA40Q86UY6 237 aa16.58■□□□□ 0.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR5AS1Q8N127 324 aa16.58■□□□□ 0.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 ST7LQ8TDW4 575 aa16.58■□□□□ 0.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 DNAJC9Q8WXX5 260 aa16.58■□□□□ 0.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF799Q96GE5 643 aa16.58■□□□□ 0.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 EGLN1Q9GZT9 426 aa16.58■□□□□ 0.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 KIF17Q9P2E2 1029 aa16.58■□□□□ 0.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 KCNS2Q9ULS6 477 aa16.58■□□□□ 0.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 CLDN25C9JDP6 229 aa16.57■□□□□ 0.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 LMX1BO60663 402 aa16.57■□□□□ 0.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 GLCEO94923 617 aa16.57■□□□□ 0.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 TGFAP01135 160 aa16.57■□□□□ 0.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 PAICSP22234 425 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 CDH15P55291 814 aa16.57■□□□□ 0.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 TPTEP56180 551 aa16.57■□□□□ 0.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 HFEQ30201 348 aa16.57■□□□□ 0.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 PLBD1Q6P4A8 553 aa16.57■□□□□ 0.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR2Z1Q8NG97 314 aa16.57■□□□□ 0.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR5K1Q8NHB7 308 aa16.57■□□□□ 0.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 SPTSSAQ969W0 71 aa16.57■□□□□ 0.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 OTULINQ96BN8 352 aa16.57■□□□□ 0.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLAMF6Q96DU3 332 aa16.57■□□□□ 0.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 MARCH7Q9H992 704 aa16.57■□□□□ 0.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 IQCF6A8MYZ5 107 aa16.56■□□□□ 0.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 LCATP04180 440 aa16.56■□□□□ 0.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 GSTT1P30711 240 aa16.56■□□□□ 0.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 DAPP51397 102 aa16.56■□□□□ 0.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 PRSS12P56730 875 aa16.56■□□□□ 0.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 MVKQ03426 396 aa16.56■□□□□ 0.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 CHRFAM7AQ494W8 412 aa16.56■□□□□ 0.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMEM236Q5W0B7 351 aa16.56■□□□□ 0.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 PARP8Q8N3A8 854 aa16.56■□□□□ 0.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 LINC01356Q8N9X3 169 aa16.56■□□□□ 0.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR6N2Q8NGY6 317 aa16.56■□□□□ 0.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 INTS14Q96SY0 518 aa16.56■□□□□ 0.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 COPS4Q9BT78 406 aa16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.6 ms