RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284957.9

RABGEF1-201, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-201ENST00000284957 LHX6Q9UPM6 363 aa8.2□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 C5orf63A6NC05 138 aa8.2□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 HPGDSO60760 199 aa8.2□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 PAHP00439 452 aa8.2□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 ACSM4P0C7M7 580 aa8.2□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 PATE4P0C8F1 98 aa8.2□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC2A1P11166 492 aa8.2□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF12P17014 697 aa8.2□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 CFL1P23528 166 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 CTSSP25774 331 aa8.2□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 CD40LGP29965 261 aa8.2□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF79Q15937 498 aa8.2□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 DDI2Q5TDH0 399 aa8.2□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 NAA40Q86UY6 237 aa8.2□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 ELMOD2Q8IZ81 293 aa8.2□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC22A24Q8N4F4 322 aa8.2□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC7A6Q92536 515 aa8.2□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 CLCF1Q9UBD9 225 aa8.2□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa8.2□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 A0A0B4J203 849 aa8.19□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa8.19□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa8.19□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 LMX1BO60663 402 aa8.19□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 RAF1P04049 648 aa8.19□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 CST2P09228 141 aa8.19□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 AGTR1P30556 359 aa8.19□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 SPANXN2Q5MJ10 180 aa8.19□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 BCL2L15Q5TBC7 163 aa8.19□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 KLHL24Q6TFL4 600 aa8.19□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 FGD2Q7Z6J4 655 aa8.19□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa8.19□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF175Q9Y473 711 aa8.19□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 P2RY10O00398 339 aa8.19□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 HSD11B1P28845 292 aa8.19□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 GALK2Q01415 458 aa8.19□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 SKA3Q8IX90 412 aa8.19□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 CEP19Q96LK0 163 aa8.19□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 NIPAL2Q9H841 368 aa8.19□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF224Q9NZL3 707 aa8.19□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 LUZP4Q9P127 313 aa8.19□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 MKRN2OSH3BPM6 223 aa8.19□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 DBHP09172 617 aa8.19□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 CX3CR1P49238 355 aa8.19□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 TBR1Q16650 682 aa8.19□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 ELFN2Q5R3F8 820 aa8.19□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF544Q6NX49 715 aa8.19□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 DNAAF1Q8NEP3 725 aa8.19□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 OR8B12Q8NGG6 310 aa8.19□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 OR5M9Q8NGP3 310 aa8.19□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 EXTL1Q92935 676 aa8.19□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 APH1AQ96BI3 265 aa8.19□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 SOX7Q9BT81 388 aa8.19□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 HHLA2Q9UM44 414 aa8.19□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 BOLA1Q9Y3E2 137 aa8.19□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 A0A1B0GTI1 187 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 A8MV72 311 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 SYNGR3O43761 229 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF32P17041 273 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 ACHEP22303 614 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 GRB2P62993 217 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 TAF13Q15543 124 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 C9orf135Q5VTT2 229 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 ACOT12Q8WYK0 555 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 KCNJ15Q99712 375 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 SOSTQ9BQB4 213 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 TCF7L1Q9HCS4 588 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 PLEK2Q9NYT0 353 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 COQ3Q9NZJ6 369 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 PRSS50Q9UI38 385 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 DHDHQ9UQ10 334 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 NCOR2Q9Y618 2525 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 IFITM5A6NNB3 132 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 KRT33AO76009 404 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 CRYGSP22914 178 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 APEX1P27695 318 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 PPP3R1P63098 170 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 ARF1P84077 181 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF774Q6NX45 483 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF627Q7L945 461 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 MCEMP1Q8IX19 187 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 IQCF2Q8IXL9 164 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 OR5H6Q8NGV6 325 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 DIRAS2Q96HU8 199 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 C12orf49Q9H741 205 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 GP6Q9HCN6 339 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-201ENST00000284957 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.4 ms