RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000229307.8

NANOG-201, Transcript of Nanog homeobox, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NANOG, Length 5,183 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOG-201ENST00000229307 NME2P1O60361 137 aa7.15□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 SLC2A10O95528 541 aa7.15□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 NME2P22392 152 aa7.15□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 TMEM251Q8N6I4 163 aa7.15□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 OR6K3Q8NGY3 331 aa7.15□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 AKR7LQ8NHP1 331 aa7.15□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 ARSGQ96EG1 525 aa7.15□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 CES1P1Q9UKY3 287 aa7.15□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa7.15□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa7.15□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 PPIHO43447 177 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 EDN3P14138 238 aa7.15□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 CD34P28906 385 aa7.15□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 FXNQ16595 210 aa7.15□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 LTC4SQ16873 150 aa7.15□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 FAM198BQ6UWH4 519 aa7.15□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 SPNS2Q8IVW8 549 aa7.15□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 MCHR2Q969V1 340 aa7.15□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 ZNF681Q96N22 645 aa7.15□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 TCRBV5S2A0A599 114 aa7.15□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 MT-CO2P00403 227 aa7.15□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 CT45A8P0DMV1 189 aa7.15□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 CT45A9P0DMV2 189 aa7.15□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 CTSSP25774 331 aa7.15□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 LSAMPQ13449 338 aa7.15□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 PCOLCEQ15113 449 aa7.15□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 CT45A2Q5DJT8 189 aa7.15□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 B3GLCTQ6Y288 498 aa7.15□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa7.15□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 TUSC5Q8IXB3 177 aa7.15□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 OR5D18Q8NGL1 313 aa7.15□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 FNDC9Q8TBE3 224 aa7.15□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 LRRC20Q8TCA0 184 aa7.15□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 PAQR8Q8TEZ7 354 aa7.15□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 PP6455Q8WZ26 134 aa7.15□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 KIRREL1Q96J84 757 aa7.15□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 ABHD6Q9BV23 337 aa7.15□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
NANOG-201ENST00000229307 KNG1P01042 644 aa7.15□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 PTH2RP49190 550 aa7.15□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 LIMK1P53667 647 aa7.15□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 SRPXP78539 464 aa7.15□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 TCF15Q12870 199 aa7.15□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 MAB21L1Q13394 359 aa7.15□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 DEGS2Q6QHC5 323 aa7.15□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 BTNL3Q6UXE8 466 aa7.15□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa7.15□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 NOXA1Q86UR1 476 aa7.15□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 LSMEM1Q8N8F7 131 aa7.15□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 EHFQ9NZC4 300 aa7.15□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 KIAA1456Q9P272 454 aa7.15□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa7.14□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 CRHP06850 196 aa7.14□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 SPINK2P20155 84 aa7.14□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 NFYBP25208 207 aa7.14□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 NCS1P62166 190 aa7.14□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 SKP2Q13309 424 aa7.14□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 AGAP6Q5VW22 663 aa7.14□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 FBXW9Q5XUX1 488 aa7.14□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 DEFB108BQ8NET1 73 aa7.14□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 OR2Z1Q8NG97 314 aa7.14□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 RAXQ9Y2V3 346 aa7.14□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 KLK4Q9Y5K2 254 aa7.14□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 M0R233 179 aa7.14□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 FXYD1O00168 92 aa7.14□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 PPP1CBP62140 327 aa7.14□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 CAMK2BQ13554 666 aa7.14□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa7.14□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 ACSM5Q6NUN0 579 aa7.14□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 TMEM81Q6P7N7 255 aa7.14□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 ANGPTL5Q86XS5 388 aa7.14□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 PPA2Q9H2U2 334 aa7.14□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 MS4A5Q9H3V2 200 aa7.14□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 ZNF385DQ9H6B1 395 aa7.14□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 ISYNA1Q9NPH2 558 aa7.14□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 SIGLEC7Q9Y286 467 aa7.14□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 TTC28Q96AY4 2481 aa7.14□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 NLRC5Q86WI3 1866 aa7.14□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa7.14□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 BET1O15155 118 aa7.14□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 AQP8O94778 261 aa7.14□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 GNG3P63215 75 aa7.14□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 DOC2BQ14184 412 aa7.14□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 AADACL3Q5VUY0 350 aa7.14□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 FAHD1Q6P587 224 aa7.14□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 CNIH2Q6PI25 160 aa7.14□□□□□ -1.27
NANOG-201ENST00000229307 CBLN3Q6UW01 205 aa7.14□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.3 ms