RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000220888.9

TRPS1-201, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPS1, Length 5,480 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-201ENST00000220888 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 PLA1AQ53H76 456 aa9.58□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 ELFN2Q5R3F8 820 aa9.58□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 OR10P1Q8NGE3 313 aa9.58□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 FOXB1Q99853 325 aa9.58□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 TAS2R4Q9NYW5 299 aa9.58□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 SCGB1D1O95968 90 aa9.58□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 SRMP19623 302 aa9.58□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 OPCMLQ14982 345 aa9.58□□□□□ -0.88
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TRPS1-201ENST00000220888 ACER2Q5QJU3 275 aa9.58□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 LHX8Q68G74 356 aa9.58□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 SLC25A26Q70HW3 274 aa9.58□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
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TRPS1-201ENST00000220888 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
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TRPS1-201ENST00000220888 TMEM171Q8WVE6 324 aa9.57□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 GALMQ96C23 342 aa9.57□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 ST8SIA3O43173 380 aa9.57□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 TNFSF8P32971 234 aa9.57□□□□□ -0.88
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TRPS1-201ENST00000220888 LIPNQ5VXI9 398 aa9.57□□□□□ -0.88
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TRPS1-201ENST00000220888 APH1BQ8WW43 257 aa9.57□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 MED9Q9NWA0 146 aa9.57□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 PPIL1Q9Y3C6 166 aa9.57□□□□□ -0.88
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TRPS1-201ENST00000220888 A0A087WV62 115 aa9.57□□□□□ -0.88
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TRPS1-201ENST00000220888 OPRL1P41146 370 aa9.56□□□□□ -0.88
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TRPS1-201ENST00000220888 ANKRD53Q8N9V6 530 aa9.56□□□□□ -0.88
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TRPS1-201ENST00000220888 AKR7LQ8NHP1 331 aa9.56□□□□□ -0.88
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TRPS1-201ENST00000220888 DDOSTP39656 456 aa9.56□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 DESI1Q6ICB0 168 aa9.56□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 TRNP1Q6NT89 227 aa9.56□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
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TRPS1-201ENST00000220888 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 OR5V1Q9UGF6 321 aa9.56□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 PRSS37A4D1T9 235 aa9.56□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 TUBAL3A6NHL2 446 aa9.56□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 F2RL2O00254 374 aa9.56□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 B3GALNT1O75752 331 aa9.56□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 OR4A8P0C604 315 aa9.56□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 FCER1GP30273 86 aa9.56□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 RHOBP62745 196 aa9.56□□□□□ -0.88
TRPS1-201ENST00000220888 POU4F3Q15319 338 aa9.56□□□□□ -0.88
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