RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640094.1

HLA-B-257, Transcript of major histocompatibility complex, class I, B, humanhuman

BASIC

Gene HLA-B, Length 147 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-B-257ENST00000640094 GTF2H4Q92759 462 aa7.13□□□□□ -1.27
HLA-B-257ENST00000640094 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
HLA-B-257ENST00000640094 PTP4A1Q93096 173 aa7.13□□□□□ -1.27
HLA-B-257ENST00000640094 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
HLA-B-257ENST00000640094 ZNF583Q96ND8 569 aa7.13□□□□□ -1.27
HLA-B-257ENST00000640094 RBP7Q96R05 134 aa7.13□□□□□ -1.27
HLA-B-257ENST00000640094 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
HLA-B-257ENST00000640094 PPA2Q9H2U2 334 aa7.13□□□□□ -1.27
HLA-B-257ENST00000640094 TXNIPQ9H3M7 391 aa7.13□□□□□ -1.27
HLA-B-257ENST00000640094 CENPHQ9H3R5 247 aa7.13□□□□□ -1.27
HLA-B-257ENST00000640094 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
HLA-B-257ENST00000640094 TMCC3Q9ULS5 477 aa7.13□□□□□ -1.27
HLA-B-257ENST00000640094 KPTNQ9Y664 436 aa7.13□□□□□ -1.27
HLA-B-257ENST00000640094 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa7.12□□□□□ -1.27
HLA-B-257ENST00000640094 A6NIZ1 184 aa7.12□□□□□ -1.27
HLA-B-257ENST00000640094 IQCF6A8MYZ5 107 aa7.12□□□□□ -1.27
HLA-B-257ENST00000640094 EVPLLA8MZ36 301 aa7.12□□□□□ -1.27
HLA-B-257ENST00000640094 F5H5P2 479 aa7.12□□□□□ -1.27
HLA-B-257ENST00000640094 FBP2O00757 339 aa7.12□□□□□ -1.27
HLA-B-257ENST00000640094 ADAM20O43506 726 aa7.12□□□□□ -1.27
HLA-B-257ENST00000640094 NDUFA2O43678 99 aa7.12□□□□□ -1.27
HLA-B-257ENST00000640094 FBXO24O75426 580 aa7.12□□□□□ -1.27
HLA-B-257ENST00000640094 IGF2P01344 180 aa7.12□□□□□ -1.27
HLA-B-257ENST00000640094 MT-ND1P03886 318 aa7.12□□□□□ -1.27
HLA-B-257ENST00000640094 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
HLA-B-257ENST00000640094 AQP2P41181 271 aa7.12□□□□□ -1.27
HLA-B-257ENST00000640094 ERFP50548 548 aa7.12□□□□□ -1.27
HLA-B-257ENST00000640094 RAP1BP61224 184 aa7.12□□□□□ -1.27
HLA-B-257ENST00000640094 STX1BP61266 288 aa7.12□□□□□ -1.27
HLA-B-257ENST00000640094 RAP1AP62834 184 aa7.12□□□□□ -1.27
HLA-B-257ENST00000640094 CD69Q07108 199 aa7.12□□□□□ -1.27
HLA-B-257ENST00000640094 COX10Q12887 443 aa7.12□□□□□ -1.27
HLA-B-257ENST00000640094 STX3Q13277 289 aa7.12□□□□□ -1.27
HLA-B-257ENST00000640094 AQP6Q13520 282 aa7.12□□□□□ -1.27
HLA-B-257ENST00000640094 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
HLA-B-257ENST00000640094 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
HLA-B-257ENST00000640094 CDONQ4KMG0 1287 aa7.12□□□□□ -1.27
HLA-B-257ENST00000640094 FAM201AQ5SY85 155 aa7.12□□□□□ -1.27
HLA-B-257ENST00000640094 SLC35E4Q6ICL7 350 aa7.12□□□□□ -1.27
HLA-B-257ENST00000640094 C1orf94Q6P1W5 598 aa7.12□□□□□ -1.27
HLA-B-257ENST00000640094 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa7.12□□□□□ -1.27
HLA-B-257ENST00000640094 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
HLA-B-257ENST00000640094 LYPD2Q6UXB3 125 aa7.12□□□□□ -1.27
HLA-B-257ENST00000640094 VMO1Q7Z5L0 202 aa7.12□□□□□ -1.27
HLA-B-257ENST00000640094 PIP4P2Q8N4L2 257 aa7.12□□□□□ -1.27
HLA-B-257ENST00000640094 C11orf44Q8N8P7 122 aa7.12□□□□□ -1.27
HLA-B-257ENST00000640094 SMYD1Q8NB12 490 aa7.12□□□□□ -1.27
HLA-B-257ENST00000640094 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa7.12□□□□□ -1.27
HLA-B-257ENST00000640094 BHLHE23Q8NDY6 225 aa7.12□□□□□ -1.27
HLA-B-257ENST00000640094 OR6T1Q8NGN1 323 aa7.12□□□□□ -1.27
HLA-B-257ENST00000640094 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
HLA-B-257ENST00000640094 CLPTM1LQ96KA5 538 aa7.12□□□□□ -1.27
HLA-B-257ENST00000640094 C20orf27Q9GZN8 174 aa7.12□□□□□ -1.27
HLA-B-257ENST00000640094 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
HLA-B-257ENST00000640094 FN3KRPQ9HA64 309 aa7.12□□□□□ -1.27
HLA-B-257ENST00000640094 POLE4Q9NR33 117 aa7.12□□□□□ -1.27
HLA-B-257ENST00000640094 PTTG3PQ9NZH4 202 aa7.12□□□□□ -1.27
HLA-B-257ENST00000640094 CTSZQ9UBR2 303 aa7.12□□□□□ -1.27
HLA-B-257ENST00000640094 STARD10Q9Y365 291 aa7.12□□□□□ -1.27
HLA-B-257ENST00000640094 RYR3Q15413 4870 aa7.11□□□□□ -1.27
HLA-B-257ENST00000640094 NOTCH3Q9UM47 2321 aa7.11□□□□□ -1.27
HLA-B-257ENST00000640094 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa7.11□□□□□ -1.27
HLA-B-257ENST00000640094 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa7.11□□□□□ -1.27
HLA-B-257ENST00000640094 LGALS8O00214 317 aa7.11□□□□□ -1.27
HLA-B-257ENST00000640094 UBDO15205 165 aa7.11□□□□□ -1.27
HLA-B-257ENST00000640094 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
HLA-B-257ENST00000640094 MLNRO43193 412 aa7.11□□□□□ -1.27
HLA-B-257ENST00000640094 FAM20BO75063 409 aa7.11□□□□□ -1.27
HLA-B-257ENST00000640094 BGNP21810 368 aa7.11□□□□□ -1.27
HLA-B-257ENST00000640094 FPR3P25089 353 aa7.11□□□□□ -1.27
HLA-B-257ENST00000640094 CD200P41217 278 aa7.11□□□□□ -1.27
HLA-B-257ENST00000640094 RAD23AP54725 363 aa7.11□□□□□ -1.27
HLA-B-257ENST00000640094 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
HLA-B-257ENST00000640094 OR8B8Q15620 311 aa7.11□□□□□ -1.27
HLA-B-257ENST00000640094 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa7.11□□□□□ -1.27
HLA-B-257ENST00000640094 ALG10Q5BKT4 473 aa7.11□□□□□ -1.27
HLA-B-257ENST00000640094 LRIF1Q5T3J3 769 aa7.11□□□□□ -1.27
HLA-B-257ENST00000640094 FOXB2Q5VYV0 432 aa7.11□□□□□ -1.27
HLA-B-257ENST00000640094 OR2T2Q6IF00 324 aa7.11□□□□□ -1.27
HLA-B-257ENST00000640094 SLC2A7Q6PXP3 512 aa7.11□□□□□ -1.27
HLA-B-257ENST00000640094 PDZD9Q8IXQ8 264 aa7.11□□□□□ -1.27
HLA-B-257ENST00000640094 C11orf65Q8NCR3 313 aa7.11□□□□□ -1.27
HLA-B-257ENST00000640094 OR9I1Q8NGQ6 314 aa7.11□□□□□ -1.27
HLA-B-257ENST00000640094 RASSF5Q8WWW0 418 aa7.11□□□□□ -1.27
HLA-B-257ENST00000640094 R3HDM4Q96D70 268 aa7.11□□□□□ -1.27
HLA-B-257ENST00000640094 SGTBQ96EQ0 304 aa7.11□□□□□ -1.27
HLA-B-257ENST00000640094 ECSITQ9BQ95 431 aa7.11□□□□□ -1.27
HLA-B-257ENST00000640094 WFDC6Q9BQY6 131 aa7.11□□□□□ -1.27
HLA-B-257ENST00000640094 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
HLA-B-257ENST00000640094 HCAR1Q9BXC0 346 aa7.11□□□□□ -1.27
HLA-B-257ENST00000640094 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
HLA-B-257ENST00000640094 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
HLA-B-257ENST00000640094 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
HLA-B-257ENST00000640094 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
HLA-B-257ENST00000640094 TMEM100Q9NV29 134 aa7.11□□□□□ -1.27
HLA-B-257ENST00000640094 PNPOQ9NVS9 261 aa7.11□□□□□ -1.27
HLA-B-257ENST00000640094 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa7.11□□□□□ -1.27
HLA-B-257ENST00000640094 ONECUT1Q9UBC0 465 aa7.11□□□□□ -1.27
HLA-B-257ENST00000640094 RNF7Q9UBF6 113 aa7.11□□□□□ -1.27
HLA-B-257ENST00000640094 FOXJ3Q9UPW0 622 aa7.11□□□□□ -1.27
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