RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627440.2

SNAP23-223, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 5 BASIC

Gene SNAP23, Length 210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-223	ENST00000627440	TRPC4AP	Q8TEL6	797 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	DCAKD	Q8WVC6	231 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	MAIP1	Q8WWC4	291 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	ESAM	Q96AP7	390 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	CMBL	Q96DG6	245 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF488	Q96MN9	340 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	ECSIT	Q9BQ95	431 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	MECR	Q9BV79	373 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	HAUS4	Q9H6D7	363 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	KRCC1	Q9NPI7	259 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	ANO10	Q9NW15	660 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	AHSP	Q9NZD4	102 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	TMED7	Q9Y3B3	224 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	NACA	E9PAV3	2078 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	IGHV3OR15-7	A0A075B7D8	119 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	IZUMO1R	A6ND01	250 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	LYPD3	O95274	346 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	IGHV1-8	P0DP01	117 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	CPA3	P15088	417 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	ECHS1	P30084	290 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	BRS3	P32247	399 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC1A2	P43004	574 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	MAGEA4	P43358	317 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	NPBWR2	P48146	333 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	NCBP2	P52298	156 aa	Known RBP eCLIP	4.55	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	GUCY1A3	Q02108	690 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	IL18R1	Q13478	541 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	FASTKD3	Q14CZ7	662 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	TIGD6	Q17RP2	521 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	FGD3	Q5JSP0	725 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	CDKL4	Q5MAI5	379 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	LRRC38	Q5VT99	294 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	PRAMEF6	Q5VXH4	476 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	CCDC144NL	Q6NUI1	221 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440		Q6ZTC4	211 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	FAM185A	Q8N0U4	392 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	CDRT4	Q8N9R6	151 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	NECAP1	Q8NC96	275 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	OR6N1	Q8NGY5	312 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	PNPT1	Q8TCS8	783 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	OIT3	Q8WWZ8	545 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF566	Q969W8	418 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	TM4SF18	Q96CE8	201 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	POM121L2	Q96KW2	1035 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	SERPINI1	Q99574	410 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	FAM118B	Q9BPY3	351 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	PRSS27	Q9BQR3	290 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	IL22	Q9GZX6	179 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	MRPL18	Q9H0U6	180 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	AKTIP	Q9H8T0	292 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	MEAF6	Q9HAF1	191 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	PLEKHA1	Q9HB21	404 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	MACF1	Q9UPN3	7388 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	IGHV4OR15-8	A0A075B7B6	117 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440		A0A087WW49	117 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440		A0A1W2PPQ1	181 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	ODF3B	A8MYP8	253 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	UBE2C	O00762	179 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	MLNR	O43193	412 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	URI1	O94763	535 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	HAUS5	O94927	633 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	IGHG2	P01859	326 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	IGHG4	P01861	327 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	JUN	P05412	331 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	UBTFL6	P0CB48	400 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	PRG2	P13727	222 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	CHN1	P15882	459 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	NCF2	P19878	526 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	GCSH	P23434	173 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	OTX1	P32242	354 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	HTR3A	P46098	478 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	ERF	P50548	548 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC25A1	P53007	311 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	CDKN2D	P55273	166 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	DYNC1I2	Q13409	638 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	PABPC1L2A	Q5JQF8	200 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	WDR38	Q5JTN6	314 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	HACD2	Q6Y1H2	254 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF782	Q6ZMW2	699 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	FAM71D	Q8N9W8	422 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	C2CD4A	Q8NCU7	369 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	NDNF	Q8TB73	568 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	MYOZ3	Q8TDC0	251 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	CIDEC	Q96AQ7	238 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	HAVCR1	Q96D42	359 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	SEH1L	Q96EE3	360 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	LRR1	Q96L50	414 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	CPPED1	Q9BRF8	314 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	SPATA9	Q9BWV2	254 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC35C2	Q9NQQ7	365 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	DUSP22	Q9NRW4	184 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF355P	Q9NSJ1	428 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	SNX6	Q9UNH7	406 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	LOC100509620	A0A075B734	347 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	hCG_1809904	A0A1W2PP81	198 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440		A0A1W2PPE2	198 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440		A0A1W2PR64	198 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440		A0A1W2PRV1	198 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	TBX19	O60806	448 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SNAP23-223	ENST00000627440	H2AFB1	P0C5Y9	115 aa		4.53	□□□□□ -1.68

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