RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592790.1

VMP1-216, Transcript of vacuole membrane protein 1, human

Gene VMP1, Length 4,325 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
VMP1-216	ENST00000592790	NSG2	Q9Y328	171 aa		3.2	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	ADAM18	Q9Y3Q7	739 aa		3.2	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	TMED7-TICAM2	A0A0A6YYA0	188 aa		3.2	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	HSFX4	A0A1B0GTS1	333 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	HSFX3	A0A1B0GWH4	333 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	FRG2C	A6NGY1	282 aa		3.2	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	ZNF98	A6NK75	572 aa		3.2	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	SERPINE3	A8MV23	424 aa		3.2	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	UMAD1	C9J7I0	102 aa		3.2	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790		J3QRE1	110 aa		3.2	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	LGALS8	O00214	317 aa		3.2	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	ST8SIA5	O15466	376 aa		3.2	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	SCAF4	O95104	1147 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	HTR3B	O95264	441 aa		3.2	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	MPC2	O95563	127 aa		3.2	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	KLF8	O95600	359 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	ITGB2	P05107	769 aa		3.2	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	ZNF28	P17035	718 aa		3.2	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	SERPINF1	P36955	418 aa		3.2	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	VIPR2	P41587	438 aa		3.2	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	GAS1	P54826	345 aa		3.2	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	CLDN2	P57739	230 aa		3.2	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	SLC26A5	P58743	744 aa		3.2	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	PPIA	P62937	165 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	C17orf67	Q0P5P2	114 aa		3.2	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	FUT5	Q11128	374 aa		3.2	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	EIF3I	Q13347	325 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	ETFDH	Q16134	617 aa		3.2	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	C2orf27A	Q580R0	203 aa		3.2	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	C1orf140	Q5VVS0	124 aa		3.2	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	PTCRA	Q6ISU1	281 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	FDX2	Q6P4F2	183 aa		3.2	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	GLRX5	Q86SX6	157 aa		3.2	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	PLXDC1	Q8IUK5	500 aa		3.2	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	LGI3	Q8N145	548 aa		3.2	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	KDF1	Q8NAX2	398 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	OR11H4	Q8NGC9	324 aa		3.2	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	OR52B4	Q8NGK2	314 aa		3.2	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	OR6S1	Q8NH40	331 aa		3.2	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	STT3B	Q8TCJ2	826 aa		3.2	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	RPS4Y2	Q8TD47	263 aa		3.2	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	NEK7	Q8TDX7	302 aa		3.2	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	MITD1	Q8WV92	249 aa		3.2	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	DVL3	Q92997	716 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	NICN1	Q9BSH3	213 aa		3.2	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	CFHR5	Q9BXR6	569 aa		3.2	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	SLC5A7	Q9GZV3	580 aa		3.2	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	METTL7A	Q9H8H3	244 aa		3.2	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	IL21R	Q9HBE5	538 aa		3.2	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	RHOF	Q9HBH0	211 aa		3.2	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	TAS2R4	Q9NYW5	299 aa		3.2	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	MBD1	Q9UIS9	605 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	B9D1	Q9UPM9	204 aa		3.2	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	TMED7	Q9Y3B3	224 aa		3.2	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	SPTBN2	O15020	2390 aa		3.2	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790		A0A0A6YYC8	382 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790		A0A0G2JK05	382 aa		3.2	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	C9orf170	A2RU37	121 aa		3.2	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	OR4C45	A6NMZ5	311 aa		3.2	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	RNASEK-C17orf49	H0YIS7	233 aa		3.2	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790		I3L1I5	382 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	SMAD9	O15198	467 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	DUX1	O43812	170 aa		3.2	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	HYAL3	O43820	417 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	C1QC	P02747	245 aa		3.2	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	SNRNP70	P08621	437 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	ZGLP1	P0C6A0	271 aa		3.2	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	CLU	P10909	449 aa		3.2	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	ALOX5AP	P20292	161 aa		3.2	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	TBXA2R	P21731	343 aa		3.2	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	TAGLN2	P37802	199 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	PNLIPRP2	P54317	469 aa		3.2	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	DEFB103A	P81534	67 aa		3.2	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	ELAVL1	Q15717	326 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	STK11	Q15831	433 aa		3.2	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	IAH1	Q2TAA2	248 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	EIF2S3L	Q2VIR3	472 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	GPR157	Q5UAW9	335 aa		3.2	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	AGBL4	Q5VU57	503 aa		3.2	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	LHX8	Q68G74	356 aa		3.2	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	ZNF660	Q6AZW8	331 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	SEZ6L2	Q6UXD5	910 aa		3.2	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	MOB3C	Q70IA8	216 aa		3.2	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	H1FNT	Q75WM6	255 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790		Q7L0L9	218 aa		3.2	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	CMTM1	Q8IZ96	169 aa		3.2	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	FAM185A	Q8N0U4	392 aa		3.2	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	RELL2	Q8NC24	303 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	OR13C8	Q8NGS7	320 aa		3.2	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	OR9A4	Q8NGU2	314 aa		3.2	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	SLC25A43	Q8WUT9	341 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	TSACC	Q96A04	125 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	NTNG2	Q96CW9	530 aa		3.2	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	GNPNAT1	Q96EK6	184 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	C14orf79	Q96F83	325 aa		3.2	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	VN1R3	Q9BXE9	311 aa		3.2	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	OR11A1	Q9GZK7	315 aa		3.2	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	CHST6	Q9GZX3	395 aa		3.2	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	TWSG1	Q9GZX9	223 aa		3.2	□□□□□ -1.9
VMP1-216	ENST00000592790	METTL9	Q9H1A3	318 aa		3.2	□□□□□ -1.9

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