RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574099.1

CCDC40-211, Transcript of coiled-coil domain containing 40, humanhuman

TSL 4

Gene CCDC40, Length 537 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC40-211ENST00000574099 MED31Q9Y3C7 131 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC40-211ENST00000574099 V9GYY5 206 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
CCDC40-211ENST00000574099 P2RY10O00398 339 aa14.54□□□□□ -0.08
CCDC40-211ENST00000574099 PIN1P1O15428 100 aa14.54□□□□□ -0.08
CCDC40-211ENST00000574099 CSF1P09603 554 aa14.54□□□□□ -0.08
CCDC40-211ENST00000574099 RAC2P15153 192 aa14.54□□□□□ -0.08
CCDC40-211ENST00000574099 PMELP40967 661 aa14.54□□□□□ -0.08
CCDC40-211ENST00000574099 CRYBA2P53672 197 aa14.54□□□□□ -0.08
CCDC40-211ENST00000574099 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
CCDC40-211ENST00000574099 ZNF841Q6ZN19 808 aa14.54□□□□□ -0.08
CCDC40-211ENST00000574099 Q6ZPA2 131 aa14.54□□□□□ -0.08
CCDC40-211ENST00000574099 DCDC5Q6ZRR9 648 aa14.54□□□□□ -0.08
CCDC40-211ENST00000574099 Q6ZSV7 163 aa14.54□□□□□ -0.08
CCDC40-211ENST00000574099 OR8G5Q8NG78 346 aa14.54□□□□□ -0.08
CCDC40-211ENST00000574099 OR13G1Q8NGZ3 307 aa14.54□□□□□ -0.08
CCDC40-211ENST00000574099 FNDC8Q8TC99 324 aa14.54□□□□□ -0.08
CCDC40-211ENST00000574099 LIPHQ8WWY8 451 aa14.54□□□□□ -0.08
CCDC40-211ENST00000574099 LHX4Q969G2 390 aa14.54□□□□□ -0.08
CCDC40-211ENST00000574099 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
CCDC40-211ENST00000574099 RIMS3Q9UJD0 308 aa14.54□□□□□ -0.08
CCDC40-211ENST00000574099 TMCC3Q9ULS5 477 aa14.54□□□□□ -0.08
CCDC40-211ENST00000574099 HIF3AQ9Y2N7 669 aa14.54□□□□□ -0.08
CCDC40-211ENST00000574099 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa14.53□□□□□ -0.08
CCDC40-211ENST00000574099 A0A0U1RQK1 487 aa14.53□□□□□ -0.08
CCDC40-211ENST00000574099 ZNF879B4DU55 563 aa14.53□□□□□ -0.08
CCDC40-211ENST00000574099 DBHP09172 617 aa14.53□□□□□ -0.08
CCDC40-211ENST00000574099 IRF2P14316 349 aa14.53□□□□□ -0.08
CCDC40-211ENST00000574099 IDH3AP50213 366 aa14.53□□□□□ -0.08
CCDC40-211ENST00000574099 PRSS12P56730 875 aa14.53□□□□□ -0.08
CCDC40-211ENST00000574099 PDZD9Q8IXQ8 264 aa14.53□□□□□ -0.08
CCDC40-211ENST00000574099 SCCPDHQ8NBX0 429 aa14.53□□□□□ -0.08
CCDC40-211ENST00000574099 COG8Q96MW5 612 aa14.53□□□□□ -0.08
CCDC40-211ENST00000574099 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
CCDC40-211ENST00000574099 TRIM15Q9C019 465 aa14.53□□□□□ -0.08
CCDC40-211ENST00000574099 TRAV27A0A087WT01 109 aa14.52□□□□□ -0.09
CCDC40-211ENST00000574099 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa14.52□□□□□ -0.09
CCDC40-211ENST00000574099 FBP2O00757 339 aa14.52□□□□□ -0.09
CCDC40-211ENST00000574099 OR5F1O95221 314 aa14.52□□□□□ -0.09
CCDC40-211ENST00000574099 IGF2P01344 180 aa14.52□□□□□ -0.09
CCDC40-211ENST00000574099 IGHV1-69P01742 117 aa14.52□□□□□ -0.09
CCDC40-211ENST00000574099 HLA-DPB1P04440 258 aa14.52□□□□□ -0.09
CCDC40-211ENST00000574099 IFI30P13284 250 aa14.52□□□□□ -0.09
CCDC40-211ENST00000574099 MMP9P14780 707 aa14.52□□□□□ -0.09
CCDC40-211ENST00000574099 FAM189A2Q15884 450 aa14.52□□□□□ -0.09
CCDC40-211ENST00000574099 ZNF181Q2M3W8 571 aa14.52□□□□□ -0.09
CCDC40-211ENST00000574099 WDR93Q6P2C0 686 aa14.52□□□□□ -0.09
CCDC40-211ENST00000574099 WDFY2Q96P53 400 aa14.52□□□□□ -0.09
CCDC40-211ENST00000574099 CGREF1Q99674 301 aa14.52□□□□□ -0.09
CCDC40-211ENST00000574099 WDR76Q9H967 626 aa14.52□□□□□ -0.09
CCDC40-211ENST00000574099 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa14.52□□□□□ -0.09
CCDC40-211ENST00000574099 CTSZQ9UBR2 303 aa14.52□□□□□ -0.09
CCDC40-211ENST00000574099 A6NIZ1 184 aa14.51□□□□□ -0.09
CCDC40-211ENST00000574099 IER3P46695 156 aa14.51□□□□□ -0.09
CCDC40-211ENST00000574099 OR1E2P47887 323 aa14.51□□□□□ -0.09
CCDC40-211ENST00000574099 RAP1BP61224 184 aa14.51□□□□□ -0.09
CCDC40-211ENST00000574099 RAP1AP62834 184 aa14.51□□□□□ -0.09
CCDC40-211ENST00000574099 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
CCDC40-211ENST00000574099 METTL11BQ5VVY1 283 aa14.51□□□□□ -0.09
CCDC40-211ENST00000574099 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
CCDC40-211ENST00000574099 FBXW12Q6X9E4 464 aa14.51□□□□□ -0.09
CCDC40-211ENST00000574099 LRRC75AQ8NAA5 344 aa14.51□□□□□ -0.09
CCDC40-211ENST00000574099 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
CCDC40-211ENST00000574099 OR51A7Q8NH64 312 aa14.51□□□□□ -0.09
CCDC40-211ENST00000574099 OR10A6Q8NH74 314 aa14.51□□□□□ -0.09
CCDC40-211ENST00000574099 UFSP2Q9NUQ7 469 aa14.51□□□□□ -0.09
CCDC40-211ENST00000574099 C5orf63A6NC05 138 aa14.5□□□□□ -0.09
CCDC40-211ENST00000574099 FAM20BO75063 409 aa14.5□□□□□ -0.09
CCDC40-211ENST00000574099 FSTL3O95633 263 aa14.5□□□□□ -0.09
CCDC40-211ENST00000574099 FPR3P25089 353 aa14.5□□□□□ -0.09
CCDC40-211ENST00000574099 PSMB10P40306 273 aa14.5□□□□□ -0.09
CCDC40-211ENST00000574099 EGR3Q06889 387 aa14.5□□□□□ -0.09
CCDC40-211ENST00000574099 AQP6Q13520 282 aa14.5□□□□□ -0.09
CCDC40-211ENST00000574099 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa14.5□□□□□ -0.09
CCDC40-211ENST00000574099 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
CCDC40-211ENST00000574099 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa14.5□□□□□ -0.09
CCDC40-211ENST00000574099 LDLRAD3Q86YD5 345 aa14.5□□□□□ -0.09
CCDC40-211ENST00000574099 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
CCDC40-211ENST00000574099 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa14.5□□□□□ -0.09
CCDC40-211ENST00000574099 OR1F12Q8NHA8 337 aa14.5□□□□□ -0.09
CCDC40-211ENST00000574099 RASSF5Q8WWW0 418 aa14.5□□□□□ -0.09
CCDC40-211ENST00000574099 RASD2Q96D21 266 aa14.5□□□□□ -0.09
CCDC40-211ENST00000574099 BPIFA2Q96DR5 249 aa14.5□□□□□ -0.09
CCDC40-211ENST00000574099 WACQ9BTA9 647 aa14.5□□□□□ -0.09
CCDC40-211ENST00000574099 RERGLQ9H628 205 aa14.5□□□□□ -0.09
CCDC40-211ENST00000574099 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
CCDC40-211ENST00000574099 PLXNB1O43157 2135 aa14.5□□□□□ -0.09
CCDC40-211ENST00000574099 ELOVL7A1L3X0 281 aa14.49□□□□□ -0.09
CCDC40-211ENST00000574099 OR6C6A6NF89 314 aa14.49□□□□□ -0.09
CCDC40-211ENST00000574099 IQCF6A8MYZ5 107 aa14.49□□□□□ -0.09
CCDC40-211ENST00000574099 NPY4RP50391 375 aa14.49□□□□□ -0.09
CCDC40-211ENST00000574099 NFYCQ13952 458 aa14.49□□□□□ -0.09
CCDC40-211ENST00000574099 VMACQ2NL98 169 aa14.49□□□□□ -0.09
CCDC40-211ENST00000574099 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
CCDC40-211ENST00000574099 SAMD5Q5TGI4 173 aa14.49□□□□□ -0.09
CCDC40-211ENST00000574099 CD276Q5ZPR3 534 aa14.49□□□□□ -0.09
CCDC40-211ENST00000574099 OR5L1Q8NGL2 311 aa14.49□□□□□ -0.09
CCDC40-211ENST00000574099 OR13C2Q8NGS9 318 aa14.49□□□□□ -0.09
CCDC40-211ENST00000574099 OR11L1Q8NGX0 322 aa14.49□□□□□ -0.09
CCDC40-211ENST00000574099 CCDC28BQ9BUN5 200 aa14.49□□□□□ -0.09
CCDC40-211ENST00000574099 SIRPDQ9H106 197 aa14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.9 ms