RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560521.5

RABGGTA-217, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTA, Length 680 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-217ENST00000560521 OR4D11Q8NGI4 311 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 OR9I1Q8NGQ6 314 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 PRSS27Q9BQR3 290 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 EVA1AQ9H8M9 152 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 SLAMF8Q9P0V8 285 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 LGALS13Q9UHV8 139 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 SLC13A4Q9UKG4 626 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGGTA-217ENST00000560521 SLC7A7Q9UM01 511 aa7.34□□□□□ -1.23
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RABGGTA-217ENST00000560521 A0A1W2PPL8 197 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGGTA-217ENST00000560521 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa7.33□□□□□ -1.24
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RABGGTA-217ENST00000560521 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGGTA-217ENST00000560521 OR10H3O60404 316 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGGTA-217ENST00000560521 DOK2O60496 412 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGGTA-217ENST00000560521 FAM20BO75063 409 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGGTA-217ENST00000560521 SERPINB7O75635 380 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGGTA-217ENST00000560521 IRF2P14316 349 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGGTA-217ENST00000560521 IGLL1P15814 213 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGGTA-217ENST00000560521 BGNP21810 368 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGGTA-217ENST00000560521 AQP1P29972 269 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGGTA-217ENST00000560521 HTR5AP47898 357 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGGTA-217ENST00000560521 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
RABGGTA-217ENST00000560521 COL10A1Q03692 680 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGGTA-217ENST00000560521 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
RABGGTA-217ENST00000560521 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
RABGGTA-217ENST00000560521 SCARB2Q14108 478 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGGTA-217ENST00000560521 FBXW12Q6X9E4 464 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGGTA-217ENST00000560521 BTN2A1Q7KYR7 527 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGGTA-217ENST00000560521 IGFN1Q86VF2 1251 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGGTA-217ENST00000560521 CALHM3Q86XJ0 350 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGGTA-217ENST00000560521 GPR32P1Q8NGA4 272 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGGTA-217ENST00000560521 OR4S1Q8NGB4 309 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGGTA-217ENST00000560521 PFN4Q8NHR9 129 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGGTA-217ENST00000560521 Q8TCH9 128 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGGTA-217ENST00000560521 NPRL2Q8WTW4 380 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGGTA-217ENST00000560521 R3HDM4Q96D70 268 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGGTA-217ENST00000560521 MPP4Q96JB8 637 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGGTA-217ENST00000560521 COG8Q96MW5 612 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGGTA-217ENST00000560521 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
RABGGTA-217ENST00000560521 RBP7Q96R05 134 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGGTA-217ENST00000560521 ALG12Q9BV10 488 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGGTA-217ENST00000560521 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGGTA-217ENST00000560521 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
RABGGTA-217ENST00000560521 TXNIPQ9H3M7 391 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGGTA-217ENST00000560521 EMC7Q9NPA0 242 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGGTA-217ENST00000560521 C20orf141Q9NUB4 165 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGGTA-217ENST00000560521 PTTG3PQ9NZH4 202 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGGTA-217ENST00000560521 ZIM2Q9NZV7 527 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGGTA-217ENST00000560521 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
RABGGTA-217ENST00000560521 ANGPT4Q9Y264 503 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGGTA-217ENST00000560521 RYR2Q92736 4967 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGGTA-217ENST00000560521 LYSTQ99698 3801 aa7.33□□□□□ -1.24
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RABGGTA-217ENST00000560521 TRAPPC13A5PLN9 417 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGGTA-217ENST00000560521 GMNCA6NCL1 334 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGGTA-217ENST00000560521 NPIPB13A6NJU9 1138 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGGTA-217ENST00000560521 IQCF6A8MYZ5 107 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGGTA-217ENST00000560521 NPIPB4C9JG80 1138 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGGTA-217ENST00000560521 BIRC5O15392 142 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGGTA-217ENST00000560521 ADAM20O43506 726 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGGTA-217ENST00000560521 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
RABGGTA-217ENST00000560521 OR7A10O76100 309 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGGTA-217ENST00000560521 MT-ND1P03886 318 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGGTA-217ENST00000560521 OPN1SWP03999 348 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGGTA-217ENST00000560521 VSIG10L2P0DP72 767 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGGTA-217ENST00000560521 CD28P10747 220 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGGTA-217ENST00000560521 IDO1P14902 403 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGGTA-217ENST00000560521 MSR1P21757 451 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGGTA-217ENST00000560521 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
RABGGTA-217ENST00000560521 RAD23AP54725 363 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGGTA-217ENST00000560521 DLX1P56177 255 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGGTA-217ENST00000560521 KRTAP10-11P60412 298 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGGTA-217ENST00000560521 MPPED2Q15777 294 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGGTA-217ENST00000560521 CDONQ4KMG0 1287 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGGTA-217ENST00000560521 LRIF1Q5T3J3 769 aa7.32□□□□□ -1.24
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RABGGTA-217ENST00000560521 C11orf88Q6PI97 169 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGGTA-217ENST00000560521 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
RABGGTA-217ENST00000560521 FGFRL1Q8N441 504 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGGTA-217ENST00000560521 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGGTA-217ENST00000560521 SPERTQ8NA61 448 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGGTA-217ENST00000560521 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGGTA-217ENST00000560521 BHLHE23Q8NDY6 225 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGGTA-217ENST00000560521 WFDC9Q8NEX5 89 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGGTA-217ENST00000560521 OR5R1Q8NH85 324 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGGTA-217ENST00000560521 LIPHQ8WWY8 451 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGGTA-217ENST00000560521 PCDHAC1Q9H158 963 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGGTA-217ENST00000560521 IKZF5Q9H5V7 419 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGGTA-217ENST00000560521 TMEM38AQ9H6F2 299 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGGTA-217ENST00000560521 CNTD2Q9H8S5 307 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGGTA-217ENST00000560521 POLE4Q9NR33 117 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGGTA-217ENST00000560521 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
RABGGTA-217ENST00000560521 UFSP2Q9NUQ7 469 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGGTA-217ENST00000560521 TMEM100Q9NV29 134 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGGTA-217ENST00000560521 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
RABGGTA-217ENST00000560521 KPTNQ9Y664 436 aa7.32□□□□□ -1.24
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