RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522928.1

CLVS1-209, Transcript of clavesin 1, humanhuman

TSL 2

Gene CLVS1, Length 464 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS1-209ENST00000522928 ZFP3Q96NJ6 502 aa2.71□□□□□ -1.98
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CLVS1-209ENST00000522928 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa2.71□□□□□ -1.98
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CLVS1-209ENST00000522928 CACNG6Q9BXT2 260 aa2.71□□□□□ -1.98
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CLVS1-209ENST00000522928 H0YC42 278 aa2.69□□□□□ -1.98
CLVS1-209ENST00000522928 GOLGA8MH3BSY2 632 aa2.69□□□□□ -1.98
CLVS1-209ENST00000522928 EMC8O43402 210 aa2.69□□□□□ -1.98
CLVS1-209ENST00000522928 GMFGO60234 142 aa2.69□□□□□ -1.98
CLVS1-209ENST00000522928 REM1O75628 298 aa2.69□□□□□ -1.98
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