RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503638.1

PGGT1B-204, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 579 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-204ENST00000503638 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP11.58□□□□□ -0.56
PGGT1B-204ENST00000503638 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP11.58□□□□□ -0.56
PGGT1B-204ENST00000503638 ITPR3Q14573 2671 aa11.58□□□□□ -0.56
PGGT1B-204ENST00000503638 ABCA4P78363 2273 aa11.57□□□□□ -0.56
PGGT1B-204ENST00000503638 NF1P21359 2839 aa11.57□□□□□ -0.56
PGGT1B-204ENST00000503638 ZNF878C9JN71 531 aa11.57□□□□□ -0.56
PGGT1B-204ENST00000503638 DLGAP1O14490 977 aa11.57□□□□□ -0.56
PGGT1B-204ENST00000503638 SYNGR3O43761 229 aa11.57□□□□□ -0.56
PGGT1B-204ENST00000503638 LYNP07948 512 aa11.57□□□□□ -0.56
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PGGT1B-204ENST00000503638 H2BFMP0C1H6 154 aa11.57□□□□□ -0.56
PGGT1B-204ENST00000503638 COX5BP10606 129 aa11.57□□□□□ -0.56
PGGT1B-204ENST00000503638 PSKH1P11801 424 aa11.57□□□□□ -0.56
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PGGT1B-204ENST00000503638 NR4A1P22736 598 aa11.57□□□□□ -0.56
PGGT1B-204ENST00000503638 THBS4P35443 961 aa11.57□□□□□ -0.56
PGGT1B-204ENST00000503638 RAD52P43351 418 aa11.57□□□□□ -0.56
PGGT1B-204ENST00000503638 SLC15A1P46059 708 aa11.57□□□□□ -0.56
PGGT1B-204ENST00000503638 NUDT6P53370 316 aa11.57□□□□□ -0.56
PGGT1B-204ENST00000503638 HCCSP53701 268 aa11.57□□□□□ -0.56
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PGGT1B-204ENST00000503638 POU4F2Q12837 409 aa11.57□□□□□ -0.56
PGGT1B-204ENST00000503638 SPATA46Q5T0L3 261 aa11.57□□□□□ -0.56
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PGGT1B-204ENST00000503638 KRT77Q7Z794 578 aa11.57□□□□□ -0.56
PGGT1B-204ENST00000503638 SLC35F2Q8IXU6 374 aa11.57□□□□□ -0.56
PGGT1B-204ENST00000503638 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP11.57□□□□□ -0.56
PGGT1B-204ENST00000503638 OR10H4Q8NGA5 316 aa11.57□□□□□ -0.56
PGGT1B-204ENST00000503638 OR1J1Q8NGS3 322 aa11.57□□□□□ -0.56
PGGT1B-204ENST00000503638 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP11.57□□□□□ -0.56
PGGT1B-204ENST00000503638 RNFT2Q96EX2 444 aa11.57□□□□□ -0.56
PGGT1B-204ENST00000503638 C4orf45Q96LM5 186 aa11.57□□□□□ -0.56
PGGT1B-204ENST00000503638 COQ7Q99807 217 aa11.57□□□□□ -0.56
PGGT1B-204ENST00000503638 ABHD6Q9BV23 337 aa11.57□□□□□ -0.56
PGGT1B-204ENST00000503638 LIME1Q9H400 295 aa11.57□□□□□ -0.56
PGGT1B-204ENST00000503638 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa11.57□□□□□ -0.56
PGGT1B-204ENST00000503638 IKZF2Q9UKS7 526 aa11.57□□□□□ -0.56
PGGT1B-204ENST00000503638 FZR1Q9UM11 496 aa11.57□□□□□ -0.56
PGGT1B-204ENST00000503638 LAMP3Q9UQV4 416 aa11.57□□□□□ -0.56
PGGT1B-204ENST00000503638 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa11.57□□□□□ -0.56
PGGT1B-204ENST00000503638 A0A1W2PPW3 197 aa11.56□□□□□ -0.56
PGGT1B-204ENST00000503638 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa11.56□□□□□ -0.56
PGGT1B-204ENST00000503638 H0YAE9 185 aa11.56□□□□□ -0.56
PGGT1B-204ENST00000503638 GPRIN2O60269 458 aa11.56□□□□□ -0.56
PGGT1B-204ENST00000503638 OR4A8P0C604 315 aa11.56□□□□□ -0.56
PGGT1B-204ENST00000503638 DNASE1P24855 282 aa11.56□□□□□ -0.56
PGGT1B-204ENST00000503638 SERPINF1P36955 418 aa11.56□□□□□ -0.56
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PGGT1B-204ENST00000503638 MTNR1AP48039 350 aa11.56□□□□□ -0.56
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PGGT1B-204ENST00000503638 UCP2P55851 309 aa11.56□□□□□ -0.56
PGGT1B-204ENST00000503638 TPTEP56180 551 aa11.56□□□□□ -0.56
PGGT1B-204ENST00000503638 SELENOVP59797 346 aa11.56□□□□□ -0.56
PGGT1B-204ENST00000503638 HIST1H3AP68431 136 aa11.56□□□□□ -0.56
PGGT1B-204ENST00000503638 IL18R1Q13478 541 aa11.56□□□□□ -0.56
PGGT1B-204ENST00000503638 OCLNQ16625 522 aa11.56□□□□□ -0.56
PGGT1B-204ENST00000503638 TEX30Q5JUR7 227 aa11.56□□□□□ -0.56
PGGT1B-204ENST00000503638 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa11.56□□□□□ -0.56
PGGT1B-204ENST00000503638 ZNF691Q5VV52 312 aa11.56□□□□□ -0.56
PGGT1B-204ENST00000503638 AGAP6Q5VW22 663 aa11.56□□□□□ -0.56
PGGT1B-204ENST00000503638 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP11.56□□□□□ -0.56
PGGT1B-204ENST00000503638 HIST2H3AQ71DI3 136 aa11.56□□□□□ -0.56
PGGT1B-204ENST00000503638 CDH24Q86UP0 819 aa11.56□□□□□ -0.56
PGGT1B-204ENST00000503638 MUC15Q8N387 334 aa11.56□□□□□ -0.56
PGGT1B-204ENST00000503638 ZNF283Q8N7M2 679 aa11.56□□□□□ -0.56
PGGT1B-204ENST00000503638 ZNF611Q8N823 705 aa11.56□□□□□ -0.56
PGGT1B-204ENST00000503638 NUP37Q8NFH4 326 aa11.56□□□□□ -0.56
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PGGT1B-204ENST00000503638 CNIH3Q8TBE1 160 aa11.56□□□□□ -0.56
PGGT1B-204ENST00000503638 TMEM171Q8WVE6 324 aa11.56□□□□□ -0.56
PGGT1B-204ENST00000503638 BCL2L14Q9BZR8 327 aa11.56□□□□□ -0.56
PGGT1B-204ENST00000503638 YIPF3Q9GZM5 350 aa11.56□□□□□ -0.56
PGGT1B-204ENST00000503638 MARCH7Q9H992 704 aa11.56□□□□□ -0.56
PGGT1B-204ENST00000503638 ELOVL3Q9HB03 270 aa11.56□□□□□ -0.56
PGGT1B-204ENST00000503638 ADGRL4Q9HBW9 690 aa11.56□□□□□ -0.56
PGGT1B-204ENST00000503638 DUSP13Q9UII6 198 aa11.56□□□□□ -0.56
PGGT1B-204ENST00000503638 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa11.56□□□□□ -0.56
PGGT1B-204ENST00000503638 CMAHPQ9Y471 501 aa11.56□□□□□ -0.56
PGGT1B-204ENST00000503638 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa11.56□□□□□ -0.56
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PGGT1B-204ENST00000503638 CADP27708 2225 aa11.55□□□□□ -0.56
PGGT1B-204ENST00000503638 M0R135 149 aa11.55□□□□□ -0.56
PGGT1B-204ENST00000503638 PSMD9O00233 223 aa11.55□□□□□ -0.56
PGGT1B-204ENST00000503638 SMPD2O60906 423 aa11.55□□□□□ -0.56
PGGT1B-204ENST00000503638 RAF1P04049 648 aa11.55□□□□□ -0.56
PGGT1B-204ENST00000503638 LCATP04180 440 aa11.55□□□□□ -0.56
PGGT1B-204ENST00000503638 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
PGGT1B-204ENST00000503638 GNAO1P09471 354 aa11.55□□□□□ -0.56
PGGT1B-204ENST00000503638 GCH1P30793 250 aa11.55□□□□□ -0.56
PGGT1B-204ENST00000503638 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP11.55□□□□□ -0.56
PGGT1B-204ENST00000503638 WNT5AP41221 380 aa11.55□□□□□ -0.56
PGGT1B-204ENST00000503638 HSPA13P48723 471 aa11.55□□□□□ -0.56
PGGT1B-204ENST00000503638 ERVS71-1P61550 626 aa11.55□□□□□ -0.56
PGGT1B-204ENST00000503638 PPP1CBP62140 327 aa11.55□□□□□ -0.56
PGGT1B-204ENST00000503638 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
PGGT1B-204ENST00000503638 GRB2P62993 217 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
PGGT1B-204ENST00000503638 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
PGGT1B-204ENST00000503638 GGTLC2Q14390 218 aa11.55□□□□□ -0.56
PGGT1B-204ENST00000503638 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP11.55□□□□□ -0.56
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