RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472398.5

TTC3-214, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 3, human

TSL 1 (best)

Gene TTC3, Length 2,305 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC3-214	ENST00000472398	SYT7	O43581	403 aa		2.82	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	EIF4E2	O60573	245 aa	Known RBP	2.82	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	MFAP3L	O75121	409 aa		2.82	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	RDH16	O75452	317 aa		2.82	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	GADD45G	O95257	159 aa		2.82	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	ZSCAN5DP	P0CG00	497 aa		2.82	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	RPL10	P27635	214 aa	Known RBP	2.82	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	HSD17B3	P37058	310 aa		2.82	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	CD96	P40200	585 aa		2.82	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	REG1B	P48304	166 aa		2.82	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	FOXG1	P55316	489 aa	Predicted RBP	2.82	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	TAS2R31	P59538	309 aa		2.82	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	TPI1	P60174	286 aa		2.82	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	SNRPE	P62304	92 aa	Known RBP	2.82	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	SLC35B1	P78383	322 aa		2.82	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	PSG4	Q00888	419 aa		2.82	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	EMX1	Q04741	257 aa	Predicted RBP	2.82	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	MFGE8	Q08431	387 aa	Predicted RBP	2.82	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	GAGE5	Q13069	117 aa		2.82	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	GAGE6	Q13070	117 aa		2.82	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	PPP1R1A	Q13522	171 aa		2.82	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	ITPK1	Q13572	414 aa		2.82	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	GNMT	Q14749	295 aa		2.82	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	HSD17B12	Q53GQ0	312 aa		2.82	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	SYT14P1	Q58G82	188 aa		2.82	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398		Q5BKY6	102 aa		2.82	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	DNLZ	Q5SXM8	178 aa		2.82	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	BAIAP2L2	Q6UXY1	529 aa		2.82	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	CATSPER3	Q86XQ3	398 aa		2.82	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	GPR135	Q8IZ08	494 aa		2.82	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	DAW1	Q8N136	415 aa		2.82	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	ACOT4	Q8N9L9	421 aa		2.82	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	OR52B6	Q8NGF0	335 aa		2.82	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	C11orf45	Q8TAV5	145 aa		2.82	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	APOBEC3D	Q96AK3	386 aa	Predicted RBP	2.82	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	DNAJC19	Q96DA6	116 aa		2.82	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	TMEM19	Q96HH6	336 aa		2.82	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	MAGEB18	Q96M61	343 aa		2.82	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	DUX3	Q96PT4	197 aa		2.82	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	AGPAT1	Q99943	283 aa		2.82	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	URM1	Q9BTM9	101 aa	Known RBP	2.82	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	OR51I1	Q9H343	314 aa		2.82	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	C5orf66	Q9H5L9	145 aa		2.82	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	REEP4	Q9H6H4	257 aa		2.82	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	ZNF665	Q9H7R5	613 aa		2.82	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	SH2D2A	Q9NP31	389 aa		2.82	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	MBNL3	Q9NUK0	354 aa	Known RBP	2.82	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	HRASLS2	Q9NWW9	162 aa		2.82	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	BFAR	Q9NZS9	450 aa		2.82	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	IL17C	Q9P0M4	197 aa		2.82	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	OR1A1	Q9P1Q5	309 aa		2.82	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	SIGLEC9	Q9Y336	463 aa		2.82	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	FBXO7	Q9Y3I1	522 aa		2.82	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	NEDD4	P46934	1319 aa		2.82	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	2.81	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	EXOC1L	A0A1B0GW35	172 aa		2.81	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	FAM74A7	A6NL05	159 aa		2.81	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	TCP10L2	B9ZVM9	353 aa		2.81	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	PPP5D1	E7EU14	171 aa		2.81	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398		F6UZH7	168 aa		2.81	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	TRAPPC2L	H3BP13	241 aa		2.81	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	CLIC1	O00299	241 aa		2.81	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	PHF1	O43189	567 aa	Predicted RBP	2.81	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	ZG16	O60844	167 aa		2.81	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	MPDU1	O75352	247 aa		2.81	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	TRAPPC6A	O75865	159 aa		2.81	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	OR2B3	O76000	313 aa		2.81	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	STK17B	O94768	372 aa		2.81	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	IL18BP	O95998	194 aa		2.81	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	CAT	P04040	527 aa	Known RBP	2.81	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	GIP	P09681	153 aa	Predicted RBP	2.81	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	GP9	P14770	177 aa		2.81	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	HOXB9	P17482	250 aa	Predicted RBP	2.81	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	RPL35A	P18077	110 aa	Known RBP	2.81	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	F2R	P25116	425 aa		2.81	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	PIGA	P37287	484 aa		2.81	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	STC1	P52823	247 aa		2.81	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	BTN3A2	P78410	334 aa		2.81	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	NTHL1	P78549	312 aa		2.81	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	ECH1	Q13011	328 aa		2.81	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	TSN	Q15631	228 aa	Known RBP	2.81	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	ZNF239	Q16600	458 aa	Known RBP	2.81	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	FAM74A3	Q4VXF1	159 aa		2.81	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	PHLDA2	Q53GA4	152 aa		2.81	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	CYBRD1	Q53TN4	286 aa		2.81	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	FAM102A	Q5T9C2	384 aa	Predicted RBP	2.81	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	TAPT1	Q6NXT6	567 aa		2.81	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	WDR74	Q6RFH5	385 aa	Predicted RBP	2.81	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	DLK2	Q6UY11	383 aa		2.81	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	C12orf54	Q6X4T0	127 aa		2.81	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	ZNF767P	Q75MW2	155 aa		2.81	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	CBLL1	Q75N03	491 aa		2.81	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	GOLGA7	Q7Z5G4	137 aa		2.81	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	MOB3B	Q86TA1	216 aa		2.81	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	NIT1	Q86X76	327 aa		2.81	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	LRRC25	Q8N386	305 aa	Predicted RBP	2.81	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	GCSAM	Q8N6F7	178 aa		2.81	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	LINC01356	Q8N9X3	169 aa		2.81	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	KBTBD8	Q8NFY9	601 aa		2.81	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	OR4D9	Q8NGE8	314 aa		2.81	□□□□□ -1.96

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