RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469529.6

TRAF4-208, Transcript of TNF receptor associated factor 4, human

TSL 2

Gene TRAF4, Length 788 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRAF4-208	ENST00000469529	OR2G2	Q8NGZ5	317 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TRAF4-208	ENST00000469529	GHSR	Q92847	366 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TRAF4-208	ENST00000469529	ISOC1	Q96CN7	298 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TRAF4-208	ENST00000469529	KCNJ15	Q99712	375 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TRAF4-208	ENST00000469529	ATF6B	Q99941	703 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TRAF4-208	ENST00000469529	SH3GL3	Q99963	347 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TRAF4-208	ENST00000469529	OR2H1	Q9GZK4	316 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TRAF4-208	ENST00000469529	MOV10	Q9HCE1	1003 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
TRAF4-208	ENST00000469529	FRRS1L	Q9P0K9	344 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TRAF4-208	ENST00000469529		Q9UFV3	132 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TRAF4-208	ENST00000469529	IKZF2	Q9UKS7	526 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TRAF4-208	ENST00000469529	STUB1	Q9UNE7	303 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TRAF4-208	ENST00000469529	POLR1D	Q9Y2S0	133 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TRAF4-208	ENST00000469529	LRP12	Q9Y561	859 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TRAF4-208	ENST00000469529	POLE	Q07864	2286 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	TRBV2	A0A0J9YWF9	115 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	TMEM212	A6NML5	194 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	SLC22A1	O15245	554 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	SGCE	O43556	437 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	AIRE	O43918	545 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	UBL3	O95164	117 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	SERPINA3	P01011	423 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF32	P17041	273 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	PSMB1	P20618	241 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	CRYGS	P22914	178 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	NANOS3	P60323	173 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF829	Q3KNS6	432 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	TBRG1	Q3YBR2	411 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	YIF1B	Q5BJH7	314 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	SFRP5	Q5T4F7	317 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	OTP	Q5XKR4	325 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	PAMR1	Q6UXH9	720 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	PRSS45	Q7RTY3	260 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	ZC3HAV1	Q7Z2W4	902 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	MRGPRG	Q86SM5	289 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	CATSPERD	Q86XM0	798 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	LRRC18	Q8N456	261 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	IL17RD	Q8NFM7	739 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	OR1F12	Q8NHA8	337 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	RND1	Q92730	232 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	C4orf45	Q96LM5	186 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	WNT5B	Q9H1J7	359 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	OR10A4	Q9H209	315 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	MOB1A	Q9H8S9	216 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	SP140L	Q9H930	580 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	G6PC2	Q9NQR9	355 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	SLC17A5	Q9NRA2	495 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	CENPM	Q9NSP4	180 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	FAM206A	Q9NX38	181 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	ELOVL5	Q9NYP7	299 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	TINAG	Q9UJW2	476 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	FBXL3	Q9UKT7	428 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF281	Q9Y2X9	895 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	GTF3C1	Q12789	2109 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	MYO18B	Q8IUG5	2567 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	TMEM269	A0A1B0GVZ9	245 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	DVL2	O14641	736 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	GPX5	O75715	221 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	GATB	O75879	557 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	ZFPL1	O95159	310 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	PNP	P00491	289 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	GADD45A	P24522	165 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	UGT2B10	P36537	528 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	RPS11	P62280	158 aa	Known RBP eCLIP	11.13	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	TUBA1B	P68363	451 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	TMEM53	Q6P2H8	277 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF474	Q6S9Z5	364 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	KLHL24	Q6TFL4	600 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	DRAM2	Q6UX65	266 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF704	Q6ZNC4	412 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529		Q6ZSR3	168 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	TUBA1A	Q71U36	451 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	ZSCAN2	Q7Z7L9	614 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	ELMOD2	Q8IZ81	293 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	PRSS35	Q8N3Z0	413 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	GALNT11	Q8NCW6	608 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	CCDC54	Q8NEL0	328 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	FGFBP3	Q8TAT2	258 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	ABHD4	Q8TB40	342 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	NANOS1	Q8WY41	292 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	THRSP	Q92748	146 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	SPTSSA	Q969W0	71 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	C12orf43	Q96C57	262 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF75A	Q96N20	296 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	DACH2	Q96NX9	599 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	DCLRE1C	Q96SD1	692 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	NAA50	Q9GZZ1	169 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	GALNT8	Q9NY28	637 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	PLEK2	Q9NYT0	353 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	NUFIP1	Q9UHK0	495 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	SSR3	Q9UNL2	185 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529		H3BMQ9	156 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	PSMD9	O00233	223 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	WNT11	O96014	354 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	RAF1	P04049	648 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	PSMB10	P40306	273 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	GDI2	P50395	445 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	PSMA6	P60900	246 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	RAB1A	P62820	205 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TRAF4-208	ENST00000469529	TAF13	Q15543	124 aa		11.12	□□□□□ -0.63

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