RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466048.6

USP54-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 54, humanhuman

TSL 5

Gene USP54, Length 4,674 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP54-210ENST00000466048 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 ZNF337Q9Y3M9 751 aa6.93□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 A8MVM7 634 aa6.93□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 AGPAT2O15120 278 aa6.93□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 AQP8O94778 261 aa6.93□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 CPN1P15169 458 aa6.93□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 MGMTP16455 207 aa6.93□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 SFTPDP35247 375 aa6.93□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 NBL1P41271 181 aa6.93□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 GPR4P46093 362 aa6.93□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 PLA2G7Q13093 441 aa6.93□□□□□ -1.3
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USP54-210ENST00000466048 PPA1Q15181 289 aa6.93□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 SYT14P1Q58G82 188 aa6.93□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 OLIG3Q7RTU3 272 aa6.93□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 ANKRD37Q7Z713 158 aa6.93□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 HMGN2P46Q86SG4 172 aa6.93□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 VASH2Q86V25 355 aa6.93□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 C1orf87Q8N0U7 546 aa6.93□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 KCNRGQ8N5I3 272 aa6.93□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 OR56B2PQ8NGI1 322 aa6.93□□□□□ -1.3
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USP54-210ENST00000466048 OR6N2Q8NGY6 317 aa6.93□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 UBE2FQ969M7 185 aa6.93□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 MARVELD3Q96A59 401 aa6.93□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 LMF1Q96S06 567 aa6.93□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 VN1R1Q9GZP7 353 aa6.93□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 C20orf85Q9H1P6 137 aa6.93□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 ACOXLQ9NUZ1 547 aa6.93□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 ANKRD10Q9NXR5 420 aa6.93□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 V9GYS6 101 aa6.93□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa6.93□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 A0A0B4J2E0 115 aa6.93□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 A0A1B0GX12 115 aa6.93□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 TMEM129A0AVI4 362 aa6.93□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 EPPINO95925 133 aa6.93□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 FGF7P21781 194 aa6.93□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 TNFSF4P23510 183 aa6.93□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 PTAFRP25105 342 aa6.93□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 GNRHRP30968 328 aa6.93□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 RIDAP52758 137 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 CARD18P57730 90 aa6.93□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 PPIAP62937 165 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 H3F3AP84243 136 aa6.93□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 ADAM5Q6NVV9 412 aa6.93□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 NKAIN4Q8IVV8 208 aa6.93□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 ZNF679Q8IYX0 411 aa6.93□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 OR4M1Q8NGD0 313 aa6.93□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 C16orf52Q8NHV5 167 aa6.93□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 SYNPRQ8TBG9 265 aa6.93□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 DUSP19Q8WTR2 217 aa6.93□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 FRZBQ92765 325 aa6.93□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 SPOCK3Q9BQ16 436 aa6.93□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 ACKR4Q9NPB9 350 aa6.93□□□□□ -1.3
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USP54-210ENST00000466048 G3V3Y1 287 aa6.92□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 PSMD9O00233 223 aa6.92□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 GPR137BO60478 399 aa6.92□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 CYTIPO60759 359 aa6.92□□□□□ -1.3
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USP54-210ENST00000466048 IGHG1P01857 330 aa6.92□□□□□ -1.3
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USP54-210ENST00000466048 ZNF136P52737 540 aa6.92□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 PSG6Q00889 435 aa6.92□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 CAMK2BQ13554 666 aa6.92□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 RSU1Q15404 277 aa6.92□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 ZNF766Q5HY98 468 aa6.92□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 ACER2Q5QJU3 275 aa6.92□□□□□ -1.3
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USP54-210ENST00000466048 CCDC190Q86UF4 302 aa6.92□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 CDH26Q8IXH8 852 aa6.92□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 STPG2Q8N412 459 aa6.92□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 COMMD1Q8N668 190 aa6.92□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 IQCF1Q8N6M8 205 aa6.92□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
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USP54-210ENST00000466048 ST8SIA2Q92186 375 aa6.92□□□□□ -1.3
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USP54-210ENST00000466048 OR52D1Q9H346 318 aa6.92□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 FBXO7Q9Y3I1 522 aa6.92□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 TMEM131Q92545 1883 aa6.92□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 A0A1B0GUH1 482 aa6.92□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 A0A1B0GWA3 101 aa6.92□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 DVL2O14641 736 aa6.92□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 MT-CO2P00403 227 aa6.92□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 CPT2P23786 658 aa6.92□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 SLC6A9P48067 706 aa6.92□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 GPR176Q14439 515 aa6.92□□□□□ -1.3
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