RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380828.6

RABGEF1-202, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-202ENST00000380828 OR4F21O95013 312 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 ICAM1P05362 532 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 SERPINE2P07093 398 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 GYG1P46976 350 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 TBPL1P62380 186 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 MZT1Q08AG7 82 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 FZD5Q13467 585 aa6.12□□□□□ -1.43
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RABGEF1-202ENST00000380828 C1orf220Q5T0J3 134 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
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RABGEF1-202ENST00000380828 OR4F3Q6IEY1 312 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 CMC1Q7Z7K0 106 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC30A8Q8IWU4 369 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 SAXO1Q8IYX7 474 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF567Q8N184 647 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 TMEM130Q8N3G9 435 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 CSNK1A1LQ8N752 337 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa6.12□□□□□ -1.43
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RABGEF1-202ENST00000380828 OR52L1Q8NGH7 329 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 KCNG3Q8TAE7 436 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 WDR34Q96EX3 536 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 MBOAT4Q96T53 435 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 SEC11CQ9BY50 192 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 C7orf66A4D0T2 115 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 G3V2L1 256 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 K7EN84 100 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP6.11□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 WDR1O75083 606 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 TSPAN19P0C672 248 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 TBC1D3HP0C7X1 549 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 GPX2P18283 190 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 PTPN7P35236 360 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 CRISP3P54108 245 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 CTBP2P56545 445 aa6.11□□□□□ -1.43
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RABGEF1-202ENST00000380828 ERVK11-1P61568 191 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 OR2F1Q13607 317 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 PRSS54Q6PEW0 395 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 MOB3CQ70IA8 216 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 TMUB2Q71RG4 321 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF280BQ86YH2 543 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 OR9Q2Q8NGE9 314 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 OR13C4Q8NGS5 318 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 ST8SIA1Q92185 356 aa6.11□□□□□ -1.43
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RABGEF1-202ENST00000380828 GINS4Q9BRT9 223 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 TAPBPLQ9BX59 468 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 SIRPDQ9H106 197 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
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RABGEF1-202ENST00000380828 NPIPB13A6NJU9 1138 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 NPIPB4C9JG80 1138 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC25A12O75746 678 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 C8AP07357 584 aa6.11□□□□□ -1.43
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RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
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RABGEF1-202ENST00000380828 PAFAH1B2P68402 229 aa6.11□□□□□ -1.43
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RABGEF1-202ENST00000380828 CD276Q5ZPR3 534 aa6.11□□□□□ -1.43
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RABGEF1-202ENST00000380828 SEH1LQ96EE3 360 aa6.11□□□□□ -1.43
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RABGEF1-202ENST00000380828 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
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RABGEF1-202ENST00000380828 SLC25A31Q9H0C2 315 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 BEX1Q9HBH7 125 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 CLN8Q9UBY8 286 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 FLVCR2Q9UPI3 526 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 CEP350Q5VT06 3117 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 TBC1D3EA0A087X179 549 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 K7ESF4 209 aa6.11□□□□□ -1.43
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